” fanidan 2-amaliy ish mavzu: Тингловчи амалий машғулотда келтирилган вазифаларни бажариши, таҳлил қилиши ва натижа олиши. Bajardi: Muqumov X ki-103-19-guruh talabasi

1-Амалий машғулот.
Маълумотлар базаси ва улардан фойдаланиш.
Ишдан мақсад: Нуклеотид кетма-кетликлар маълумотлар базаси (EMBL, DDBJ, NCBI, UniGene, STACK, EMBL-SVA) ресурслари билан танишиш. Геном маълумотлар базаси (Genomes Server, Proteome Analysis, Ensembl) ресурслари билан танишиш. Оқсил кетма-кетликлари маълумотлар базаси ҳамда аминокислота кетма-кетликлари маълумотлар базаси (UniProtKB/Swiss-Prot, GOA, ENZYME) ресурслари билан танишиш. NCBI маълумотлар базаси BLAST таҳлили ва Ugene 1.21.0 дастурий таъминотидан фойдаланиб генларни анотация қилишни ўрганиш.
Масаланинг қўйилиши:
Тингловчи амалий машғулотда келтирилган вазифаларни бажариши, таҳлил қилиши ва натижа олиши лозим.
Ишни бажариш учун намуна.
1-вазифа. 1-амалий машғулот натижасида аниқланган QTL маркерининг G.hirsutum ғўза тури тўлиқ геномидан фойдаланиб In silico PCR алгоритми билан Ugene 1.21.0 дастурида тегишли ДНК кетма-кетлигини аниқланг.


2-вазифа. In silico PCR маҳсулотидан олинган ДНК кетма-кетлигини NCBI маълумотлар базасига юкланг.

3-вазифа. NCBI маълумотлар базасига юкланган ДНК кетма-кетлигини таҳлил қилиш учун BLAST тугмасини босинг.

4-вазифа. Қидирув натижасида топилган кетма-кетликларни бирма-бир таҳлил қилинг.

5-вазифа. Тегишли (мос келувчи) ген/оқсил ёки локус кетмакетликларини Ugene 1.21.0 дастурида ҳам таҳлил қилиб кўринг.


Nazariy qism.
Маълумотлар базаси бу — тартибланган маълумотларни сақловчи ва қайта ишловчи ахборот модели ҳисобланади. Соддароқ қилиб айтганда, бир ҳил турдаги ахборотларни ўзида сақловчи ва берилган сўровлар орқали уларни тақдим этувчи модель. Мисол учун, китоблар жавони, бу маълумотлар базаси ҳисобланади, яъни бир ҳил турдаги (китобларни) объектларни ўзида сақлайди, ёки бўлмаса телефон рақамлар ёзилган китобча, бу ерда исм, телефон рақам каби бир ҳил типдаги маълумотлар сақланади, бу ҳам маълумотлар базаси.