3-Laboratoriya mashg’uloti. Mavzu

Filogenetik daraxtni taqqoslash
Daraxtni taqqoslash filogenetik tahlilga qaraganda kamroq qo’llanilad,ammo genomika asrida u tez asosiy uslubga aylanib bormoqda.Aslida , odatda daraxtlarning topologiyalari ( ya’ni) tanllanma tanlanma tartibi) taqqoslanadi va topologiyalar orasidagi masofa ikkita taqqoslangan daraxtlar orasidagi farqli ( yoki keng tarqalgan) darxtning “yonib ketishi” sifatida ushlanishi mumkin.Daraxtlar topologiyasini taqqoslash usulida amalga oshirilgan qo’shimcha g’oya rasmda keltirilgan daraxtning ichki shoxlari ishonchligini novdlar ko’proq hissa qo’shdi.
Daraxt shoxlari uchun ishonchlilik yoki statistik qo’llab-quvvatlash,odatda 0 (umuman qo’llab quvvatlanmaydi) dan 1 gacha ( eng kuchli qo’llab quvvatlash ) dan farq qiladigan yuklash chizig’I qiymatlari bo’yicha hisoblanadi. Rasmda ko’rsatilgan daraxt topologiyasini taqqoslash uchun Boot Split Distance (BSD) usulida har bir bo’linisnng ulushi yuklash chizig’I qiymatlaridan foydalanilgan holda o’lchanadi.