Amaliy ish №6 mavzu: protein data bank (pdb) ma’lumotlar bazasi bilan ishlash. Mavzu

AMALIY ISH № 6


MAVZU: PROTEIN DATA BANK (PDB) MA’LUMOTLAR BAZASI BILAN ISHLASH.


Mavzu: Ma’lumotlar bazasi va ulardan foydalanish.
Protein Data Bank (PDB) ma’lumotlar bazasi bilan ishlash.


Ishdan maqsad: Ma’lumotlar bazasi va ulardan foydalanish.
Protein Data Bank (PDB) ma’lumotlar bazasi bilan ishlash.


Nazariy qism

Thread – bu (inglizchasiga thread – ip, tikmoq,) degan manoni anglatadi. Bu operatsion tizim yadrodini qayta ishlashdagi kichik bir birlik sifatida qaraladi. Iplar ya’ni bog’lanishlar operatsion tizimlarda turlicha bo’ladi. Ko’p hollarda amalga oshirilishga yana ijro etilishida ham farqlanadi. Jarayonlar bu faqatgina bor resurslarni jamlanmasidan tashkil topmagan, jarayonlar qachonki xotira resurslari, oqimlar (kodi) va ularni tarkibi (ular qanday vaqt o’zgaruvchilarga ega ekanligiga) kabi resurslarga bog’liq.

Bitta prodsessorda ko’plab threadlar bo’lishi ya’ni iplar bo’lishi ko’plab prodsessorlar bilan ishlashni ta’minlaydi. Bu bir vaqtning o’zida bir vaqt oralig’ida bir nechta amallarni bajarishga olib keladi.

1-rasm.

1-rasmda ikki porodsessorli holatida vaqt oraligida ikki ip (thread) ni amalga oshirish.

Intel Thread Profiler juda foydali ikki va ko’plab prodsessorli qurilmalar uchun jarayonlarni analiz qilishda foydali dasturiy ta’minot.

Intel Thread Profiler jarayonlarda muammoli manzillarni tez qayta ishlashga mo’ljallangan. Kodni qayta ishlash qulay.
Intel® Software Development tomonidan dasturning boshqa dasturlar bilan qo’llab quvvatlashi.
• Intel® Compilers
• Intel® VTune™ Performance Analyzers
• Intel® Performance Libraries
• Intel® Threading Analysis Tools
• Intel® Cluster Tools
Dasturning yordamchi moslashuv vositalari:
• Latest Multicore Processors
• Intel® 64 Architecture
• Microsoft Windows Vista*: Compiled 32 and 64-bit applications
• Microsoft Visual Studio* .NET development environment
• Microsoft Visual C++* .NET Compiler 2005, 2003, 2002 Editions or Visual C++ 6.0
• Intel® Fortran and C++ Compilers
• Windows threads and POSIX* threads
• Support for OpenMP*

3-rasm. Intel thread profiler dasturi tizimida vaqt oraliqlarida jarayonlarni analiz qilish oynasi.

4-rasm. Intel thread profilerda olingan analizlar natijalarini tahlil qilish oynasi.