Bioinformatika haqida qisqacha…

GeneBank & EMBL _{– bu yerda birlamchi ketma –ketliklar saqlanadi PDB – oqsillarning fazoviy strukturasi va boshqalar.
Ikkinchi tur –ma’lumotlar bazasi ustidan nazoratni amalga oshiruvchilar, ma’lumotlarning ishonchliligi uchun ushbu ma’lumotlar bazasining xo’jayinlari javobgar sanaladi. Bu yerga hech kim axborotlarni jo’natmaydi, maxsus ekspertlar arxiv ma’lumotlar bazasida mavjud axborotlarni ishonchlilik darajasini tekshirib (ketma-ketliklarda nima yozilgan, qanday tadqiqot natijalari asosida bu ketma –ketlik olingan va qanday vazifalarni bajaradi), so’ngra joylashtiriladi.
Bu turdagi ma’lumotlar bazasiga quyidagilar kiradi:
Swiss- Prot – oqsillarning aminokislota ketma –ketligi to’g’risida ma’lumotlarni saqlovchi, yuqori sifatli baza.
KEGG – metobolizm to’g’risidagi ma’lumotlar bazasi
FlyBase – Drosophila pashshasi to’g’risidagi ma’lumotlar bazasi.
COG – ortologik genlar to’g’risidagi ma’lumotlar
Yuqoridagi bazalarning qo’llab –quvvatlanishi nazoratchi va tavsiflovchilarning ishini talab qiladi.
Uchchinchi tur –ishlab chiqaruvchi ma’lumotlar bazalari. Bunday ma’lumotlar bazalari arxiv va nazorat qilinuvchi ma’lumotlar bazalarini qayta ishlash natijasida hosil bo’ladi. Bu yerga quyidagilar kiradi:
SCOP – oqsillarning strukturaviy klassifikatsiyasiga asoslangan ma’lumotlar bazasi (oqsillarning strukturasi tavsiflanadi)
PFAM – oqsil oilalari bo’yicha ma’lumotlar bazasi
GO (Gene Ontology) – Genlar klassifikatsiyasi (bir xil genning har hil nomlanishi va bir xil nom ostida har xil genlarni tushunmaslik maqsadida umumiy atamalar to’plamini yaratishga harakat qiladi)
ProDom – oqsil domenlari}