I. Genomik va proteomik ma'lumotlar bazalari bilan ishlash

IV. Raqamli tasvirlarni qayta ishlash
Hozirgi vaqtda biologiyada Raqamli tasvirlarni qayta ishlash tadqiqot usullari keng qo'llaniladi, ularning chiqish ma'lumotlari raqamli tasvirlardir. Bu, birinchi navbatda, mikroskopiya, balki mikro-erae va shunga o'xshash texnikadir. Ushbu ma'lumotlarning hajmi tez sur'atlar bilan o'sib borayotganligi sababli ularni avtomatik qayta ishlash muammosi paydo bo'ladi. Mikrofotografiyada avtomatik hal qilishni talab qiladigan quyidagi vazifalar mavjud:
1) shovqin signalini muhim signaldan ajratish;
2) tadqiqotchini qiziqtiradigan tuzilmalarni aniqlash (hujayralarni va ularning qismlarini aniqlash, har xil turdagi hujayralarni farqlash va boshqalar);
3) lyuminestsent signallarning intensivligi va joylashishini bir-biri bilan va yorqin maydon mikroskopiyasi natijalari bilan taqqoslash (lyuminestsent belgilarga ega bo'lgan molekulalarning hujayra ichidagi lokalizatsiyasi, shuningdek molekulalararo o'zaro ta'sirlarni bashorat qilish uchun zarur).¹⁶
DNK mikromassivlaridan foydalanish gen ekspressiyasini genomik darajada o'rganish yoki turli sharoitlarda yoki har xil hujayra turlarida ifodani solishtirish imkonini beradi. DNK mikrochipi - bu organizmning ma'lum genlariga mos keladigan DNK parchalari qo'llaniladigan juda ko'p sonli (o'n minglab) hujayralarga ega bo'lgan kichik qattiq tashuvchidir. Agar mikrochipga lyuminestsent yorlig'i bo'lgan cDNK qo'llanilsa, u chipdagi mos keladigan DNK bilan to'ldiruvchi juftlikni hosil qiladi, bu chipni yuvgandan keyin flüoresans bilan tasdiqlanadi. DNK gibridizatsiyasidan so'ng chip lazer yordamida skanerlanadi va raqamli tasvir olinadi. Ikki turdagi hujayralar yoki bir xil hujayralar solishtirilganda, lekin turli sharoitlarda, ba'zi hujayralardagi cDNKlar, masalan, yashil floresan yorliq bilan, boshqalari esa qizil rang bilan belgilanadi. Keyin namunalar aralashtiriladi va bitta mikrochipga qo'llaniladi. Shuning uchun, olingan tasvirni qayta ishlashda nafaqat gibridlanish sodir bo'lgan hujayralarni topish, balki uning miqdorini aniqlash, shuningdek, ko'p hollarda qizil va yashil signallarning intensivligini solishtirish kerak. Ushbu muammolarni hal qilish uchun tegishli dasturiy ta'minot allaqachon yaratilgan bo'lib, u keng miqyosda mikroarraylar yordamida tahlil qilish imkonini beradi.¹⁷