1 Методология это учение о наиболее общих принципах и методах изучения природы и общества

М.А.Афонин дал одну и» первых классификаций черноземов, причем не столько в нашем современном понимании этого слова, сколько классификацию темного органического вещества.
Он выделил 8 разных по свойствам черноземов:
1) "глинистый чернозем",
2) "каменистый или песчаной или с хрящем смешанный",
3)"лесной на смолу похожий чернозем, который также легко землею слывет и кой всегда масляным кажется, а при том рыхл почему и растения на нем скоро всходят",

4. 
   "болотный чернозем, который также называется мерзлою землею или тиною",
   
5. 
   "березовый чернозем, кой всегда сух и холоден",
   
6. 
   "можжевеловой и сосновой чернозем, которой натурою не только тепл, но и горяч",
   7)"еловой чернозем, которой так же жирен, но несколько холоднее нежели сосновой",
   

8) "ореховый чернозем, который также и лесным черноземом называется. Он по большей части состоит из хорошей и плодородной земли, потому что он в себе имеет как жирность, так и теплоту, с помощью которой растения скоро восходят и имеют хорошие соки своему питанию".
М.И.Афонин высказал мысль о необходимости собирания образцов почв России и организации почвенного музея. Он говорил: " Я за полезное нахожу предложить, дабы, не только различных видов называемый чернозем, но прочих родов земли собираемы и распологаемы были так, как минералоги поступают в собирании и расположении минеральных кабинетов. То есть расположить их на свои роды и виды и хранить оные не только с запискою их свойств, названия, и того уезду и деревни, но и самого поля, с которого такая земля будет взята и каким образом или способом в пашне оная употребляется. Ибо нередко случается, что в одном поле два, а иногда и три разные рода земель находятся, да к тому и свойствами своими противные, от чего, конечно, и не может не воспоследовать неприятное в приобретении достаточной и выгодной жатвы мероприятие. А сему последуя порядку, не только б каждому частному владетелю следовала из такого обстоятельного знания великая польза, но и не меньше того, в рассуждении так пространных и отдаленных любезного нашего Отечества провинций, всему обществу, потому что, узнав каждую землю не только во всяком уезде и деревне, но и в каждом поле, можно будет изыскивать такие сродные ей и поправления к вящшему и изобильнейшему рождению хлеба, а особливо в тех провинциях, где натура земли произвели или самые лучшие и плодоносные или в некоторых тому противные. Чего ради как в лучших, так и в худших поистине можно будет большего ожидать изобилия и приращения через пристойное удобрение и поправление". Предложение об организации Почвенного музея не удалось осуществить ни М.И.Афонину, ни В.В.Докучаеву. Лишь в 1904 уже после смерти Докучаева в Петербурге был открыт Почвенный музей.
Итак почвоведение в Московском университете берет свое начало в трудах Ломоносова и в преподавательской деятельности первого профессора агрономии Московского университета МЛ.Афонина.
Следует отметить, что во второй половине 18 века потребность в изучении почв в целях более продуктивного их использования в сельском хозяйстве значительно возросла, и поэтому в 1765 было организовано Вольное экономическое общество, которое впоследствии академик Ярилов, историк почвоведения, называл "колыбелью русского генетического почвоведения".
Целью этого общества, членами которого являлись многие землевладельцы, просвещенные помещики, искавшие научные пути использования принадлежавших им земель, было, как это записано в уставе Общества, "все полезные и новые в земледелии и экономии, чужестранными народами поныне изобретенные, и опытами уже изведанные материи, прилежно собирать и сообщать своим гражданам. Сие общество недовольно, чтоб какие-либо изобретения просто предлагать публике, делать будет над многими из оных, по колику дозволяет обстоятельства, собственные опыты, и о успехе их народ уведомлять. Так же возможное приложится старание, чтоб подробно узнать внутреннее состояние здешних провинций, открыть их недостатки, и изыскать полезные к отвращению тех недостатков средства".
Вольное Экономическое общество начало публиковать Труды, в которых содержались результаты исследований многих ученых того времени. В первой же книге Трудов Экономического общества была опубликована статья академика И.Г.Лемана, которая называлась "О различных качествах земли в рассуждении экономического ее употребления в земледелии". В этой статье Леман, который был химиком по специальности, давал советы - как правильно использовать почвы. Большое внимание уделялось вопросам плодородия почв. Он писал: "Под именем земли разумею я здесь смешанное из разных материй тело, которое все твердые частицы обитаемого нами земного круга покрывает, между пальцами растирается, в воде мягчится, а цвет, запах и вкус имеет весьма между собой различный. Она вообще кажется определена быть к произведению, рощению, умножению и питанию всяких вещей прозябающих".
С деятельностью Вольного экономического общества связаны имена таких замечательных ученых, как Болотов, Комов, Радищев, а позже - Менделеев, Бутлеров, Семенов-Тянь-Шаньский и др.