1. Sinteniya haqida tushuncha Odam va sichqon xramasomalaridagi orasidagi sinteniya

Sinteniya

• 
  1.Sinteniya haqida tushuncha
  
• 
  2.Odam va sichqon xramasomalaridagi orasidagi sinteniya
  
• 
  3.Makrosinteniya va mikrosinteniya
  
• 
  Genetikada sinteniya atamasi ikkita bog'liq tushunchani anglatadi:
  
• 
  Klassik genetikada sinteniya individ yoki tur ichida bir xil xromosomada irsiy lokuslarning jismoniy birgalikda lokalizatsiyasini tavsiflaydi .
  
• 
  Hozirgi biologiyada sinteniya ko'proq kolinearlikni anglatadi , ya'ni bir-biri bilan taqqoslanadigan ikkita xromosomalar to'plamidagi tartib bloklarining saqlanishi. Ushbu bloklar sintetik bloklar deb ataladi .
  
• 
  
  
• 
  Odam va sichqon xromosomalari orasidagi sinteniya (zamonaviy ma'noda). Inson xromosomalaridagi ranglar bir xil rangdagi sichqoncha xromosomasining qismlari bilan gomologik hududlarni ko'rsatadi. Masalan, sichqonchaning 1-xromosomasiga gomologik ketma-ketliklar asosan odamning 1 va 2-xromosomalarida, balki 6,8 va 18-da joylashgan. X xromosomasi ikkala turda ham deyarli butunlay sintenikdir.
  
• 
  Britannica entsiklopediyasida zamonaviy ta'rifdan foydalanib, sinteniyaning quyidagi tavsifi berilgan:
  
• 
  Genomik ketma-ketlik va xaritalash ko'plab turlarning genomlarining umumiy tuzilmalarini taqqoslash imkonini berdi. Umumiy topilma shundaki, nisbatan yaqinda ajralib chiqqan organizmlar genomda bir xil nisbiy pozitsiyalarda o'xshash gen bloklarini ko'rsatadi. Bu holat sinteniya deb ataladi, taxminan umumiy xromosoma ketma-ketligiga ega deb tarjima qilinadi. Masalan, odamning ko'pgina genlari boshqa sutemizuvchilarning genlari bilan sintenikdir - nafaqat maymunlar, balki sigirlar, sichqonlar va boshqalar. Sinteniyani o'rganish evolyutsiya jarayonida genomning qanday kesilishi va yopishtirilganligini ko'rsatishi mumkin
  

• 
  Birgalikda sinteniya (konservatsiyalangan sinteniya deb ham ataladi) har xil turdagi xromosomalardagi genlarning saqlanib qolgan birgalikda lokalizatsiyasini tavsiflaydi. Evolyutsiya jarayonida genomning qayta tuzilishi, masalan, xromosoma translokatsiyasi ikkita lokusni ajratishi mumkin, natijada ular orasidagi sinteniya yo'qoladi. Aksincha, translokatsiyalar xromosomalarning ilgari ajratilgan ikkita bo'lagini ham birlashtirishi mumkin, bu esa lokuslar o'rtasida sinteniyani oshirishga olib keladi. Kutilgandan ko'ra kuchliroq umumiy sinteniya sintenik genlar o'rtasidagi funktsional munosabatlar uchun tanlovni aks ettirishi mumkin, masalan, birgalikda meros qilib olinganda foydali bo'lgan allellarning kombinatsiyasi yoki umumiy tartibga solish mexanizmlari.
  
• 
  Sinteniyaning ma'nosidagi so'nggi o'zgarishlardan kelib chiqqan holda gen tarkibi va bog'lanishning tartibni saqlamasdan saqlanishi ham mezosinteniya deb ataladi .
  

• 
  Hozirgi vaqtda (~ 2000 yildan beri) bu atama umumiy ajdoddan o'tgan xromosomadagi genlarning aniq tartibini saqlashni tavsiflash uchun ko'proq qo'llaniladi, ko'proq "eski maktab" genetiklariga qaramay. atamaning noto'g'ri o'zlashtirilishi deb hisoblagan narsalarni rad etish, o'rniga kollinearlikni afzal ko'rish .
  
• 
  Gen tartibi ma'nosida sinteniyani tahlil qilish genomikada bir nechta ilovalarga ega. Birgalikda sinteniya turli turlarda genomik hududlar orfologiyasini o'rnatishning eng ishonchli mezonlaridan biridir . Bundan tashqari, sinteniyaning istisno saqlanishi genlar orasidagi muhim funktsional munosabatlarni aks ettirishi mumkin. Masalan, hayvonlar tanasi rejasining asosiy belgilovchilari bo'lgan va bir-biri bilan tanqidiy ta'sir ko'rsatadigan " Xox klasteri " genlarining tartibi asosan butun hayvonot olamida saqlanib qolgan.
  
• 
  Synteny murakkab genomlarni o'rganishda keng qo'llaniladi, chunki qiyosiy genomika oddiyroq model organizmdagi genlarning mavjudligi va ehtimol ularning ishlashini murakkabroq bo'lganlarni aniqlashga imkon beradi. Misol uchun, bug'doy juda katta, murakkab genomga ega, uni o'rganish qiyin. 1994 yilda Angliyadagi Jon Innes markazi va Yaponiyadagi Milliy agrobiologik tadqiqotlar instituti tomonidan olib borilgan tadqiqotlar shuni ko'rsatdiki, guruchning genomi ancha kichikroq bo'lib, bug'doynikiga o'xshash tuzilish va gen tartibiga ega. Keyingi tadqiqotlar shuni ko'rsatdiki, ko'plab donlar sintetik va shuning uchun guruch yoki o't Brachypodium kabi o'simliklardir.bug'doy etishtirish va tadqiqotlarda qo'llanilishi mumkin bo'lgan genlarni yoki genetik belgilarni topish uchun model sifatida foydalanish mumkin. Shu nuqtai nazardan, sinteniya bug'doyning juda muhim hududini, genom barqarorligi va unumdorligi bilan bog'liq bo'lgan Ph1 lokusuni aniqlashda muhim ahamiyatga ega bo'lib, u guruch va Braxipodiumdagi sintenik mintaqalardan olingan ma'lumotlardan foydalangan holda joylashgan.
  
• 
  Sinteniya mikrob genomikasida ham keng qo'llaniladi. Hyphomicrobiales va Enterobacterialesda sintenik genlar ko'p sonli muhim hujayra funktsiyalarini kodlaydi va yuqori darajadagi funktsional munosabatlarni ifodalaydi .
  

• 
  Birgalikda sinteniya yoki sinteniya uzilishlarining naqshlari bir nechta turlar orasidagi filogenetik munosabatlarni aniqlash va hatto yo'qolib ketgan ajdodlar turlarining genom tashkilotini aniqlash uchun belgilar sifatida ishlatilishi mumkin Sifatiy farq ba'zan makrosinteniya , xromosomaning katta qismlarida sinteniyaning saqlanishi va mikrosinteniya , bir vaqtning o'zida bir nechta gen uchun sinteniyaning saqlanishi o'rtasida aniqlanadiq.
  

Foydalanilgan adabiyotlar :

• 
  Amores A, Force A, Yan YL, Joly L, Amemiya C, Fritz A, Ho RK, Langeland J, Prince V, Wang YL, Westerfield M, Ekker M, Postletwait JH (1998 yil noyabr). "Zebrafish hox klasterlari va umurtqali hayvonlar genomining evolyutsiyasi". Fan . 282 (5394): 1711–4. Bibcode : 1998Sci...282.1711A . doi : 10.1126/science.282.5394.1711 . PMID 9831563 .
  
•