194-guruh talabasi Tilavoldiyeva Gavharning Bioinformatika fanidan

2.3. Makromolekulalarni topish va ko‘rish uchun tanlangan manbalar
Bir necha o‘n yillar oldin, strukturaviy biologiya hali go‘daklik davrida bo‘lganida, tuzilmalar kamdan-kam uchraydi va strukturaviy biologlar ko‘pincha o‘z hayotlarining yillarini atom detallari bo‘yicha faqat bitta tuzilmani o‘rganishga bag‘ishladilar. Makromolekulyar tuzilmalarni ko‘rish uchun ishlatiladigan birinchi vositalar mutaxassislar uchun asboblar edi.
Bugungi vaziyat juda boshqacha: tuzilmalarni hal qilish tezligi sezilarli darajada oshdi, 60 000 dan ortiq yuqori aniqlikdagi oqsil tuzilmalari konsolidatsiyalangan Butunjahon Protein Ma'lumotlar Bankida (wwPDB) 1 mavjud . Ushbu ma'lumotlar makromolekulyar funktsiyani tushunishga yordam beradigan ko‘plab batafsil ma'lumotlarni taqdim etadi. Ushbu ma'lumotdan eng samarali foydalanish uchun vizualizatsiya vositalari ishlab chiqildi va ular tobora biologlar uchun kundalik vositalarga aylanib bormoqda. Masalan, ko‘plab biokimyogarlar oqsil funktsiyasini tushunish uchun oqsil tuzilmalarini muntazam ravishda ko‘rib chiqadilar. Kimyogarlar ligandlarni bog‘laydigan joylarni dori dizaynining bir qismi sifatida ko‘rishadi. Molekulyar biologlar RNK signallari va xabarlarni qayta ishlash haqida tushunchaga ega bo‘lish uchun RNK tuzilmalari va oqsillar bilan komplekslarni ko‘rishadi. Strukturani vizualizatsiya qilishning ba'zi jihatlari, masalan, molekulyar harakat va keng ko‘lamli molekulyar yig‘ilishlar kabi mutaxassisning sohasi bo‘lib qoladi. Hatto bu murakkabroq sohalarda ham resurslar dastgoh biologlariga ushbu ma'lumotni tasavvur qilish va ishlatish imkonini bera boshlaydi.
Biroq, tizimli ma'lumotlar hozirda katta va xilma-xil olimlar guruhi tomonidan ko‘rib chiqilsa va foydalanilsa-da, ularning aksariyati murakkab foydalanuvchi interfeyslari yoki skript tillarini o‘rganish uchun bir necha oy sarflashga tayyor emas. Bugungi kunda ham vizualizatsiya vositalaridagi murakkab foydalanuvchi interfeyslari ko‘pincha to‘siq bo‘lib, ko‘plab olimlarning tizimli ma'lumotlardan foydalanishiga to‘sqinlik qiladi. Hatto strukturaviy mutaxassislar ham yaxshilangan tezlik, xususiyatlar va imkoniyatlardan tashqari molekulyar grafik vositalaridan foydalanish qulayligini kutishgan.