3- amaliy mashg’ulot mavzu

 
 
 
 

---

Mustaqil bajarish uchun topshiriqlar 
3-Amaliy mashg‘ulot. Ma’lumotlar bazasi va ulardan foydalanish. Ishdan maqsad: 
Nukleotid ketma-ketliklar ma’lumotlar bazasi (EMBL, DDBJ, NCBI, UniGene, 
STACK, EMBL-SVA) resurslari bilan tanishish. Genom ma’lumotlar bazasi 
(Genomes Server, Proteome Analysis, Ensembl) resurslari bilan tanishish. Oqsil 
ketma-ketliklari ma’lumotlar bazasi hamda aminokislota ketma-ketliklari 
ma’lumotlar bazasi (UniProtKB/Swiss-Prot, GOA, ENZYME) resurslari bilan 
tanishish. NCBI ma’lumotlar bazasi BLAST tahlili va Ugene 1.21.0 dasturiy 
ta’minotidan foydalanib genlarni anotasiya qilishni o‘rganish. Masalaning 
qo‘yilishi: Tinglovchi amaliy mashg‘ulotda keltirilgan vazifalarni bajarishi, tahlil 
qilishi va natija olishi lozim. Ishni bajarish uchun namuna.
1-vazifa. 1-amaliy mashg‘ulot natijasida aniqlangan QTL markerining G.hirsutum 
g‘o‘za turi to‘liq genomidan foydalanib In silico PCR algoritmi bilan Ugene 1.21.0 
dasturida tegishli DNK ketma-ketligini aniqlang. 
 
 

---

 
2-vazifa. In silico PCR mahsulotidan olingan DNK ketma-ketligini NCBI 
ma’lumotlar bazasiga yuklang. 
 
 

---

3-vazifa. NCBI ma’lumotlar bazasiga yuklangan DNK ketma-ketligini tahlil qilish 
uchun BLAST tugmasini bosing. 
4-vazifa. Qidiruv natijasida topilgan ketma-ketliklarni birma-bir tahlil qiling. 
 

---

5-vazifa. Tegishli (mos keluvchi) gen/oqsil yoki lokus ketmaketliklarini Ugene 
1.21.0 
dasturida ham tahlil qilib ko‘ring. 
 

---

Nazorat savollari:
1. Ma’lumtolar bazasi haqida nimalarni bilasiz?
2. Nukleotid ketma-ketliklar ma’lumotlar bazasiga misollar keltiring?
3. Oqsil ketma-ketliklar ma’lumotlar bazasiga misollar keltiring?