Akramova dilnozaning

TAQDIMOTI
BIOTEXNOLOGIYA FAKULTETI
BIOLOGIYA YO’NALISHI
IV-BOSQICH K.BIO-EU-19 GURUH TALABASI
AKRAMOVA DILNOZANING
BIOINFORMATIKA FANIDAN
TAYYORLAGAN

Oqsillarni identifikatsiyalash resursi (Protein Identification Resource,PIR)

• Kirish
• Asosiy qism.
• 1.Oqsillarni identifikatsiyalash resursi
• 2. Ma'lumotlar bazasiga kirish arxitekturasi
• 3. PIR World Wide Web (WWW) sayti…
• 4. Proteinlar va genomik ketma-ketliklar atlasi CD-ROM
• 1.5.PIR Tarix

Kirish.

• Protein axborot resursi (PIR) 1960-yillarning boshlarida marhum Margaret O. Dayhoff ( 1-3 ) tomonidan tashkil etilgan Proteinlar ketma-ketligi va tuzilishi atlasidan kelib chiqqan. Oqsillarning o'zaro bog'liqligi va evolyutsiyasi bo'yicha tadqiqotlarni qo'llab-quvvatlash uchun mo'ljallangan ma'lumotlar to'plami sifatida kelib chiqishidan boshlab, resurs statik kutubxona sifatida emas, balki tadqiqotni qo'llab-quvvatlash vositasi sifatida ishlab chiqilgan. Demak, ma'lumotlar tahlil qilinadi, ko'rib chiqiladi va biologik bilimlarning dinamik ko'rinishini ifodalash uchun qayta tuziladi. PIR taqdim etilgan va chop etilgan ma'lumotlarni asl ko'rinishida saqlagan bo'lsa-da, PIRning vazifasi saqlangan ma'lumotlar arxivini taqdim etish emas; aksincha, PIR biologik tushunchalarni ifodalovchi shakldagi ketma-ketlik ma'lumotlarining tuzatilgan va joriy resursini ishlab chiqarish uchun bunday arxivlardan foydalanadi.

Kurs ishing maqsadi va vazifalari:

• Ma'lumotlar bazasi annotatsiyaning izchilligini saqlashda ham noyobdir, xususiyatlar va kalit so'zlar uchun cheklangan lug'at bilan. Ma'lumotlar nashr etilgan adabiyotlardan, PIR-Internationalga taqdim etish va GenBankga taqdim etilgan nuklein kislotalar ketma-ketligini tarjima qilish orqali to'planadi (10 ), Evropa molekulyar biologiya laboratoriyasi (EMBL) nukleotidlar ketma-ketligi ma'lumotlar bazasi ( 11 ) va Yaponiyaning DNK ma'lumotlar bazasi (DDBJ) ( 12 ). Ma'lumotlar bazasidagi yozuvlar quyidagi bo'limlarda tasvirlanganidek, ushbu manba ma'lumotlar bazalariga va boshqalarga o'zaro havola qilinadi.