Amaliy mashg’ulot 13

Populyatsiya genotip ma’lumotlari
JoinMap 3.0 dasturida natijalar “project” ichiga saqlanadi. Siz “File” menyusidan foydalanib yangi project yaratishingiz (2a-rasm) yoki mavjud project larni ochishingiz (2b-rasm) mumkin. Project ochilganda mazkur project ga ma’lumotlar yuklanadi. Buni “File” menyusidagi “Load Data” parametri orqali amalga oshirishingiz mumkin (3-rasm). Bu optsiya yordamida project ga bir necha turdagi ma’lumotlar fayllarini, ular ichida F₂ avlodi kabi genetik ajraluvchi populyatsiya lokuslari uchun genotip kodlari faylini (locus genotype file yoki loc-file) yuklashingiz mumkin.
Locus genotype file yoki loc-file yaratish
Locus genotype file yoki loc-file quyidagicha yaratiladi. Buning uchun ekperimental populyatsiyani ota-ona genotiplari bilan birgalikda gel-elektroforez yoki kapilyar-elektroforez usullarida molekulyar skrining qilingandan so’ng genotipik jihatdan aniqlab olinadi (Jadvallar). Odatda kapilyar-elektroforez usulida populyatsiya kompyuter dasturi yordamida avtomatik tarzda genotiplanadi. Aksincha, gel-elektroforez usuli bilan molekulyar skrining qilingan ma’lumotlar Microsoft excel dasturidan foydalanib genotiplab chiqiladi (rasm).

1-jadval. F2, BC1, RIx populyatsiya turlari uchun genotip kodlari

Kod Tavsifi

a birinchi ota-ona formasi bo’yicha gomozigota

b ikkinchi ota-ona formasi bo’yicha gomozigota

h geterozigota (F1)

c a genotipi bo’lmagan (b-allel bo’yicha dominant)

d b genotipi bo’lmagan (a-allel bo’yicha dominant)

- noma’lum genotip

. noma’lum genotip

u noma’lum genotip

2-jadval. DH1, DH2, HAP1 populyatsiya turlari uchun genotip kodlari

Kod Tavsifi

a birinchi ota-ona formasi bo’yicha gomozigota yoki gaploid

b ikkinchi ota-ona formasi bo’yicha gomozigota yoki gaploid

- noma’lum genotip

. noma’lum genotip

u noma’lum genotip