Zamonaviy biologik tadqiqotlarda bioinformatikaning axamiyati
Bioinformatika qo’llaniladigan eng mashhur dasturlar
ACT-genom tahlilida qo’llaniladi.
Arlequin-populyatsion-genetik ma’lumotlarni tahlil etishda.
BLAST – nukleotidlar va aminokislotalar ketma-ketligi xalqaro bazasidan eng yaqin bo’lgan qarindosh tur ketma-ketlikni aniqlashda qo’llaniladi.
Clustal – ko’pgina nukleotid va aminokislotalar ketma-ketligini o’zaro o’xshashlarini aniqlab bir qatorga yig’ishda qo’llaniladi.
DnaSP – DNK ketma-ketligidagi polimorfizm holatini tahlil qilish uchun qo’llaniladi.
FigTree– filogenetik daraxtni tahrir qilishda foydalaniladi
MEGA – molekulyar-evolutsion genetik tahlillarda foydalaniladi
Bundan tashqari yuzlab dasturlar mavjud bo’lib, ular ushbu sohada faoliyat olib boruvchi tadqiqotchiga qulayliklarni yaratadi. Ushbu maqolani yozish davomida hisoblab ko’rsam men o’zim ayni vaqtdagi faoliyatim davomida deyarli kuni o’rtacha 6 ta mana shunday dasturlar bilan ishlatar ekanman.
Bioinformatika /ˌbaɪ.oʊˌɪnfarˈmætɪks/ ( tinglang) bu fanlararo usullarni ishlab chiqadigan soha va dasturiy vositalar tushunish uchun biologik ma'lumotlar, xususan ma'lumotlar to'plamlari katta va murakkab bo'lganda. Fanning fanlararo sohasi sifatida bioinformatika birlashadi biologiya, Kompyuter fanlari, axborot muhandisligi, matematika va statistika biologik ma'lumotlarni tahlil qilish va sharhlash. Bioinformatika uchun ishlatilgan silikonda matematik va statistik metodlardan foydalangan holda biologik so'rovlarni tahlil qilish.[tushuntirish kerak ]
Bioinformatika foydalanadigan biologik tadqiqotlarni o'z ichiga oladi kompyuter dasturlash ularning metodologiyasining bir qismi sifatida, shuningdek, qayta-qayta ishlatiladigan aniq tahlil "quvurlari", xususan genomika. Bioinformatikaning keng tarqalgan qo'llanilishiga nomzodlarni aniqlash kiradi genlar va bitta nukleotid polimorfizmlar (SNPlar ). Ko'pincha, bunday identifikatsiya kasallikning genetik asoslarini, noyob moslashuvlarini, kerakli xususiyatlarini (qishloq xo'jaligi turlarida) yoki populyatsiyalar o'rtasidagi farqlarni yaxshiroq bilish maqsadida amalga oshiriladi. Kamroq rasmiy ravishda bioinformatika, shuningdek, ichidagi tashkiliy tamoyillarni tushunishga harakat qiladi nuklein kislota va oqsil ketma-ketliklar proteomika.
Do'stlaringiz bilan baham: |