База данных нуклеотидных последовательностей (GenBank)

2.3. GENBANK — БАЗА ДАННЫХ БИОЛОГИЧЕСКИХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ.
Мировой архив последовательностей нуклеиновых кислот возник благодаря партнерству трех организаций — Национального центра биотехнологической информации (National Center for Biotechnology Information, USA), Библиотеки данных Европейского института биоинформатики (EMBL Data Library, UK) и Банка данных ДНК Японского национального института генетики (DNA Data Bank of Japan, National Institute of Genetics). Эти учреждения ежедневно обмениваются информацией.
В эти базы поступают данные о последовательностях ДНК и РНК, полученные из проектов исследований геномов, научных публикаций и заявок на патенты. Научные журналы требуют при публикации статьи внесения упоминаемых в ней новых последовательностей в базу данных, что обеспечивает ее наполнение.
Системы поиска GenBank помогают решать одну из основных для биоинформатика задач — поиск информации о имеющейся у него биологической последовательности. Пусть у нас есть аминокислотная последовательность:
GSHMLEADLELERAADVRWEEQAEISGSSPILSITISEDGSMSIKNEE EEQTLG
Попробуем найти данные о ней в базе GenBank.
Рисунок 2.3.1. GenBank - поиск по аминокислотной последовательности.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ.
Сегодня биологических баз данных существует великое множество — базы данных ДНК, РНК, белков — их первичных, вторичных, третичных структур, базы данных статей по биологии и медицине и др.
Крупнейшими и важнейшими биологическими базами данных являются:
• GenBank http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/ — база данных первичных структур ДНК и аминокислотных последовательностей.
Мировой архив последовательностей нуклеиновых кислот возник благодаря партнерству трех организаций — Национального центра биотехнологической информации (National Center for Biotechnology Information, USA), Библиотеки данных Европейского института биоинформатики (EMBL Data Library, UK) и Банка данных ДНК Японского национального института генетики (DNA Data Bank of Japan, National Institute of Genetics). Эти учреждения ежедневно обмениваются информацией.
В эти базы поступают данные о последовательностях ДНК и РНК, полученные из проектов исследований геномов, научных публикаций и заявок на патенты. Научные журналы требуют при публикации статьи внесения упоминаемых в ней новых последовательностей в базу данных, что обеспечивает ее наполнение.
Системы поиска GenBank помогают решать одну из основных для биоинформатика задач — поиск информации о имеющейся у него биологической последовательности.
Несколько десятилетий тому назад биологическая роль нуклеиновых кислот была совершенно неясна, в настоящее же время установлено их первостепенное значение в живой природе.