Федеральное государственное образовательное

3.2. Новые стратегии в протеомном анализе 
Современный дизайн протеомного исследования включает выбор методов для 
пробоподготовки, количественного анализа, МС-анализа биологического образца 
(Patterson, 2003) с последующей обработкой результатов исследования. В последние годы 
предпринимаются попытки уменьшить комплексность биологического образца и 
повысить качество анализа, что привело к изменению протокола протеомного анализа. 
Частичное улучшение качества протеомного анализа может быть достигнуто 
фракционированием образца и увеличением разрешения метода 2DPAGE, соединением 
взаимодополняющих методов исследования, повышением качества обработки данных и 
представления результатов (Сарвилина, 2007). 
Наиболее широкие возможности предоставляют изотопные технологии, где 
допустимо определение веществ без гелей. Реагенты с изотопными метками содержат 
алкильную группу для ковалентной связи с остатками пептидных цистеинов, которые 
соединяют как водород, так и дейтерий, и биотиновые метки для связывания и выявления 
когорты модифицированных пептидов. В ICAT-эксперименте исследуемые и контрольные 
образцы для сравнительного анализа помечаются водородом и дейтерием, затем 
смешиваются. В ходе последующего МС-анализа различия по массам дифференцируются 
по наличию водорода и дейтерия, которые создают высокое разрешение в эксперименте, 
являются метками, связанными с пептидными аналитами и, таким образом, 
сигнализируют об их присутствии. Сигнальная активность коррелирует с 

---

20 
характеристиками Mw пептидов и протеинов, а также с идентифицируемыми 
химическими структурами. 
Количество техники, связанной с изотопными технологиями, резко возросло с 
момента создания реагента с меткой. Реагенты включают большой диапазон химических 
соединений с метками и альтернативные стабильные изотопные пары. Изотопные метки в