Filogenetik daraxt qanday quriladi? (Upgma usuli)

Turlari

Daraxtlarning uchta asosiy turi mavjud: kladogrammalar, qo'shimcha daraxtlar va ultrametrik daraxtlar.
Kladogrammalar eng oddiy daraxtlar bo'lib, organizmlarning umumiy nasabga bog'liqligini ko'rsatadi. Ushbu turdagi daraxtlarning ma'lumotlari dallanadigan naqshlarda joylashgan, chunki filiallarning kattaligi qo'shimcha ma'noga ega emas.
Ikkinchi turdagi daraxtlar qo'shimchalar bo'lib, ular metrik daraxtlar yoki filogrammalar deb ham ataladi. Filiallarning uzunligi evolyutsion o'zgarish miqdori bilan bog'liq.
Va nihoyat, bizda ultrametrik daraxtlar yoki dendogrammalar mavjud bo'lib, u erda daraxtlarning barcha uchlari bir xil masofada joylashgan (filologiyada bunday holat uchi sherigidan pastroq yoki balandroq ko'rinishi mumkin). Filialning uzunligi evolyutsion vaqt bilan bog'liq.
Daraxtni tanlash biz javob bermoqchi bo'lgan evolyutsion savol bilan bevosita bog'liq. Masalan, agar biz faqat shaxslar o'rtasidagi munosabatlar bilan shug'ullanadigan bo'lsak, kladogramma o'rganish uchun etarli bo'ladi.

Filogenetik daraxtlarni o'qishda eng ko'p uchraydigan xatolar

Filogenetik daraxtlar ko'pincha evolyutsion biologiyada (va umumiy biologiyada) keng qo'llaniladigan grafikalar bo'lishiga qaramay, bu oddiy grafika o'quvchiga etkazish uchun mo'ljallangan xabarni noto'g'ri talqin qiladigan ko'plab talabalar va mutaxassislar mavjud.

Magistral yo'q

Birinchi xato - bu evolyutsiya taraqqiyotni nazarda tutadi deb o'ylab, ularni yonma-yon o'qish. Agar biz evolyutsion jarayonni to'g'ri tushunsak, ajdodlar turini chap tomonda va rivojlangan turlarni o'ng tomonda deb o'ylash uchun hech qanday sabab yo'q.
Daraxtning botanika o'xshashligi juda foydali bo'lsa-da, u endi u qadar aniq bo'lmagan nuqtaga keladi. Daraxtda mavjud bo'lmagan hal qiluvchi daraxt tuzilishi mavjud: magistral. Filogenetik daraxtlarda biz hech qanday asosiy novdalarni uchratmaymiz.
Xususan, ba'zi odamlar insonni evolyutsiyaning yakuniy "maqsadi", shuning uchun tur deb hisoblashlari mumkin. Homo sapiens U har doim yakuniy shaxs sifatida joylashgan bo'lishi kerak.
Biroq, bu nuqtai nazar evolyutsion tamoyillarga mos kelmaydi. Agar biz filogenetik daraxtlarning harakatlanuvchi elementlar ekanligini tushunsak, ularni joylashtirishimiz mumkin Homo daraxtning har qanday terminal holatida, chunki bu xususiyat vakolatxonada ahamiyatli emas.