Filogenetik daraxt

Filogenetik daraxt ko’rinishlari

Ildizdan yo’naltirilgan
daraxt evolyutsiya
yo’nalishini ko’rsatadi
Ildizsiz oriyentirlanmagan
daraxt faqat tugunlar
orasidagi aloqani ko’rsatadi
Vaqt

Dendrogramma –filogenetik daraxt sxemali ko’rinishini bildiruvchi umumiy atama. Kladogramma –uzun novdalar to’g’risida axborotlarni saqlamaydigan filogenetik daraxt. Filogramma (yoki, fenogramma) –uzun novdalar to’g’risida axborotlarni saqlovchifilogenetik daraxt; bunday uzunliklar qandaydir tavsifning o’zgarganligini ko’rsatadi. Xronogramma –novdalarning uzunligi evolyutsion vaqtni aks ettiruvchi filogramma.

• Dendrogramma –filogenetik daraxt sxemali ko’rinishini bildiruvchi umumiy atama. Kladogramma –uzun novdalar to’g’risida axborotlarni saqlamaydigan filogenetik daraxt. Filogramma (yoki, fenogramma) –uzun novdalar to’g’risida axborotlarni saqlovchifilogenetik daraxt; bunday uzunliklar qandaydir tavsifning o’zgarganligini ko’rsatadi. Xronogramma –novdalarning uzunligi evolyutsion vaqtni aks ettiruvchi filogramma.

 

 

• Filogenetik daraxtni tuzish. Dastlabki davrlarda filogenetik daraxtlar oqsil yoki nuklein kislota ketma-ketligiga ko’ra tiklangan. Maxsus xisoblash (filogenetik) usullaridan foydalanilgan xolda kiritiladigan ketma-ketliklarning ixtiyoriy sonlariga ko’ra daraxtlab tuzilgan. Xaqiqiatga yaqin kelish prinsipiga asoslangan o’lchov (kriteriy)- mazkur daraxt topologiyasi berilgan nukleotid ketma-ketliklari (saralangan) ning nisbatan ishonchli mos kelish o’lchovi bo’lib xisoblangan. Ba’zan Bayes prinsipi xam qo’llanilib, undan foydalanish kko’p xollarda baxslarga sabab bo’ladi. Ehtimolli kriteriy (haqiqatga yaqin) lar esa xisob-kitob uchun mashinada ko’p ish vaqtini talab etadi. “Maksimal ekonomiya” hamda kiritiluvchi ketma-ketliklar orasidagi masofani oldindan xisoblashga asoslangan bir qator kriteriylar nisbatan tez aniqlanadi.

Tuzilgan daraxtni chizilish turlari

Filogramma:
Qovurg’alar uzunligi evolyutsion masofaga proporsional.
Kladogramma:
Faqat topologiyasi namoyish etilgan, qovurg’alar uzunligi tanqid qilinadi.