Gen om e d iver si ty
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2012/2013 Forschungsbericht Scientific Report Leibniz-inStitut FüR PFLanzengenetik und kuLtuRPFLanzenFoRSchung (iPk) Gen om e D iver si ty Pr of. A ndr eas G raner Dr . N ils S tein Reso ur ce s G en et ics an d Re pr odu ct ion Dr . A ndr eas B ör ner 1) M anagem ent Le ibni z I ns tit ut e of P la nt G ene tic s and Cr op P lan t Resear ch (I PK) Co rre ns str a e 3 ß D- 06 46 6 St ad t S ee lan d OT G ate rs leb en / Ger m any Phone: +49 ( 0) 3948 2 50 Fax : +49 ( 0) 3948 2 5500 Em ail: inf o@ ipk -g at er slebe n. de Int er ne t: http ://w ww .ip k- gat er sle be n. de As of 1 Januar y 2012 Gov er ni ng B oa rd Chai r: N. N. Vi ce C hai r: Dr . H enk v an Li em pt M ana gi ng O ffi ce Rol and S chnee Ch ar ac te ris atio n a nd Do cu m en ta tio n Pr of. A ndr eas G raner M ana ge m ent a nd Ev alu atio n Dr . A ndr eas B ör ner Ta xon om y a nd Ev olu tio n Dr . F rank B lat tner De pt . of G ene ba nk Head: P rof . A ndr eas G raner De pt . of A dm ini st ra tion an d C en tral S er vi ces Head: S ybi lle -A ndr ea Lor enz Dep t. of C yt og en et ics an d G en om e A nal ysi s Head: P rof . I ngo Sc huber t Dep t. o f M ol ecu lar Gen et ics Head: P rof . T hom as A ltm ann De pt . of P hy si ol ogy and Ce ll B io lo gy Head: P rof . N icol aus von W irén Ka ry oty pe E vo lu tio n Pr of. Ingo Sc hub er t Seed D evel op m en t Dr . W inf riede W es chk e Pl an t G en om e R eso ur ce s C en tre (P GR C) Coor dinat or : D r. P atr ick S chw eiz er Bio in fo rm atic s Coor dinat or : P rof . F alk S chr eiber Ge ne ba nk D oc um ent at ion Dr . H elm ut Knüpf fer Sa te llite C olle ctio ns N or th Dr . K laus D ehm er In v itr o St or age and Cr yo pr es er vat io n Dr . J oac him K ell er Exp er im en ta l Ta xon om y Dr . F rank B lat tner Gr oups Tr an scr ip to m e A nal ysi s Dr . P atr ick S chw eiz er Ch ro m os om e S tru ct ur e and Func tion Dr . A ndr eas H oub en Ap om ix is Dr . T im othy F . S har bel Ep ig en etic s Dr . M ichael F M ett e Ge ne and Ge nom e M appi ng Dr . M ar ion Röder Bio in fo rm atic s a nd Inf or m at ion Te chno logy Dr . U we Sc hol z Pro gra m m es Cy to gen et ics Pr of. Ingo Sc hub er t Pla nt B io in fo rm atic s Pr of. F alk S chr eiber Ge ne R egul at ion Dr . H elm ut Bäum lei n Phy toa nt ibod ie s Dr . U do Conr ad Pl ant R epr oduc tiv e B iol ogy Dr . J oc hen Kum lehn Ap plie d B io ch em is try Dr . H ans -P et er M oc k Str uc tu ra l C ell Bio lo gy Dr . M ichael M elz er Yeast G en et ics Pr of. G ott har d Kunz e Pe rs on ne l W ilm a K laas en -v an H us en Fi na nc es M ar tina Li ew ald Te chn ol og y Tr ans fe r a nd Leg al M at ter s Dr . T ank red Sc huhm an n Bui ldi ngs and E qui pm ent Her wi g B ier stedt M at er ial s, M an ag em en t a nd Gen er al S er vi ces Kat rin M enz el Exp er im en ta l F iel ds an d Nu rser ies Pet er S chr eiber Gen om e A nal ysi s Dr . P atr ick S chw eiz er Ge no m e P la stic ity Dr . R enat e Sc hm idt Boa rd of D ire ct or s Pr of. A ndr eas G raner 1) M anagi ng D irec tor Sy bille -A ndr ea Lor enz 1) A dm ini str ati ve D irec tor Pr of. T hom as A ltm ann Pr of. Ingo Sc hub er t Pr of. N icol aus v on W irén Sci en tif ic A dvi so ry Bo ar d Chai r: Pr of. C hr ist ian Jung Pe rs onne l C ounc il C hai r: T hom as K rus e Gen eb an k A dvi so ry Bo ar d C hai r: N. N. M ole cu la r P la nt Nu tritio n Pr of. N icol aus v on W irén Dat a I nsp ect io n (J uni or R es ear ch Gr oup) Dr . S wet lan a Fr iedel Hy br id W he at (BM BF -funde d R es ear ch Gr oup) Dr . M ar io Gils Pla nt A rc hite ctu re (BM BF -funde d R es ear ch Gr oup) Dr . T hor ste n Sc hnur bu sc h He te ro sis Pr of. T hom as A ltm ann Sy ste m s B io lo gy (BM BF -funde d R es ear ch Gr oup) Dr . B jör n H . J unk er Im ag e A nal ysi s (J uni or R es ear ch Gr oup) Dr . C hr ist ian Kl uk as St ress G en om ics (IZ N- funde d Juni or R es ear ch Gr oup) Dr . N es e Sr eeni vas ulu Gen om e D iver si ty Pr of. A ndr eas G raner Dr . N ils S tein Reso ur ce s G en et ics an d Re pr odu ct ion Dr . A ndr eas B ör ner 1) M anagem ent Le ibni z I ns tit ut e of P la nt G ene tic s and Cr op P lan t Resear ch (I PK) Co rre ns str a e 3 ß D- 06 46 6 St ad t S ee lan d OT G ate rs leb en / Ger m any Phone: +49 ( 0) 3948 2 50 Fax : +49 ( 0) 3948 2 5500 Em ail: inf o@ ipk -g at er slebe n. de Int er ne t: http ://w ww .ip k- gat er sle be n. de As of 1 Januar y 2012 Gov er ni ng B oa rd Chai r: N. N. Vi ce C hai r: Dr . H enk v an Li em pt M ana gi ng O ffi ce Rol and S chnee Ch ar ac te ris atio n a nd Do cu m en ta tio n Pr of. A ndr eas G raner M ana ge m ent a nd Ev alu atio n Dr . A ndr eas B ör ner Ta xon om y a nd Ev olu tio n Dr . F rank B lat tner De pt . of G ene ba nk Head: P rof . A ndr eas G raner De pt . of A dm ini st ra tion an d C en tral S er vi ces Head: S ybi lle -A ndr ea Lor enz Dep t. of C yt og en et ics an d G en om e A nal ysi s Head: P rof . I ngo Sc huber t Dep t. o f M ol ecu lar Gen et ics Head: P rof . T hom as A ltm ann De pt . of P hy si ol ogy and Ce ll B io lo gy Head: P rof . N icol aus von W irén Ka ry oty pe E vo lu tio n Pr of. Ingo Sc hub er t Seed D evel op m en t Dr . W inf riede W es chk e Pl an t G en om e R eso ur ce s C en tre (P GR C) Coor dinat or : D r. P atr ick S chw eiz er Bio in fo rm atic s Coor dinat or : P rof . F alk S chr eiber Ge ne ba nk D oc um ent at ion Dr . H elm ut Knüpf fer Sa te llite C olle ctio ns N or th Dr . K laus D ehm er In v itr o St or age and Cr yo pr es er vat io n Dr . J oac him K ell er Exp er im en ta l Ta xon om y Dr . F rank B lat tner Gr oups Tr an scr ip to m e A nal ysi s Dr . P atr ick S chw eiz er Ch ro m os om e S tru ct ur e and Func tion Dr . A ndr eas H oub en Ap om ix is Dr . T im othy F . S har bel Ep ig en etic s Dr . M ichael F M ett e Ge ne and Ge nom e M appi ng Dr . M ar ion Röder Bio in fo rm atic s a nd Inf or m at ion Te chno logy Dr . U we Sc hol z Pro gra m m es Cy to gen et ics Pr of. Ingo Sc hub er t Pla nt B io in fo rm atic s Pr of. F alk S chr eiber Ge ne R egul at ion Dr . H elm ut Bäum lei n Phy toa nt ibod ie s Dr . U do Conr ad Pl ant R epr oduc tiv e B iol ogy Dr . J oc hen Kum lehn Ap plie d B io ch em is try Dr . H ans -P et er M oc k Str uc tu ra l C ell Bio lo gy Dr . M ichael M elz er Yeast G en et ics Pr of. G ott har d Kunz e Pe rs on ne l W ilm a K laas en -v an H us en Fi na nc es M ar tina Li ew ald Te chn ol og y Tr ans fe r a nd Leg al M at ter s Dr . T ank red Sc huhm an n Bui ldi ngs and E qui pm ent Her wi g B ier stedt M at er ial s, M an ag em en t a nd Gen er al S er vi ces Kat rin M enz el Exp er im en ta l F iel ds an d Nu rser ies Pet er S chr eiber Gen om e A nal ysi s Dr . P atr ick S chw eiz er Ge no m e P la stic ity Dr . R enat e Sc hm idt Boa rd of D ire ct or s Pr of. A ndr eas G raner 1) M anagi ng D irec tor Sy bille -A ndr ea Lor enz 1) A dm ini str ati ve D irec tor Pr of. T hom as A ltm ann Pr of. Ingo Sc hub er t Pr of. N icol aus v on W irén Sci en tif ic A dvi so ry Bo ar d Chai r: Pr of. C hr ist ian Jung Pe rs onne l C ounc il C hai r: T hom as K rus e Gen eb an k A dvi so ry Bo ar d C hai r: N. N. M ole cu la r P la nt Nu tritio n Pr of. N icol aus v on W irén Dat a I nsp ect io n (J uni or R es ear ch Gr oup) Dr . S wet lan a Fr iedel Hy br id W he at (BM BF -funde d R es ear ch Gr oup) Dr . M ar io Gils Pla nt A rc hite ctu re (BM BF -funde d R es ear ch Gr oup) Dr . T hor ste n Sc hnur bu sc h He te ro sis Pr of. T hom as A ltm ann Sy ste m s B io lo gy (BM BF -funde d R es ear ch Gr oup) Dr . B jör n H . J unk er Im ag e A nal ysi s (J uni or R es ear ch Gr oup) Dr . C hr ist ian Kl uk as St ress G en om ics (IZ N- funde d Juni or R es ear ch Gr oup) Dr . N es e Sr eeni vas ulu Corrensstraße 3 2012/2013 Forschungsbericht Scientific Report Gatersleben, Januar 2014 Leibniz-inStitut FüR PFLanzenGenetik und kuLtuRPFLanzenFoRSchunG (iPk) Impressum herausgeber: Leibniz-institut für Pflanzengenetik und kulturpflanzenforschung (iPk) corrensstraße 3 d-06466 Stadt Seeland/ot Gatersleben tel.: +49 (0)39482-50 Fax: +49 (0)39482-5500 internet: http://www.ipk-gatersleben.de Geschäftsführender direktor: Prof. dr. andreas Graner administrative Leiterin: Sybille-andrea Lorenz Redaktion: Geschäftsstelle Gesamtherstellung: iPk Gatersleben und koch-dRuck, halberstadt Foto: umschlag Vorderseite: zellkern (S. heckmann), Maiswurzel (M. Rosso), Fluoreszenzaufnahme Gerste (k. neumann) umschlag Rückseite: Flugdienst Magdeburg Inhaltsverzeichnis/ Contents Organigramm 2012/ Organisation of the Institute 2012 . . . . . . . . . . u2 Vorwort/ Introduction . . . . . . . . . . 4 Das Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK)/ The Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK) . . . . . . . . . . 6 Das Institut in den Jahren 2012 und 2013/ The Institute during 2012 and 2013 . . . . . . . . . . 10 Verwaltung und Infrastruktur/ Administration and Infrastructure . . . . . . . . . . 18 Personal . . . . . . . . . . 18 Programmbudget . . . . . . . . . . 20 drittmitteleinnahmen . . . . . . . . . . 20 technologietransfer . . . . . . . . . . 21 informationen zur infrastruktur . . . . . . . . . . 22 Versuchsfeld und Gärtnerei . . . . . . . . . . 22 informationstechnologie . . . . . . . . . . 22 Wissenschaftliche bibliothek . . . . . . . . . . 23 Forschungsberichte der Abteilungen/ Research Reports of the Departments . . . . . . . . . . 24 abteilung Genbank/ department of Genebank . . . . . . . . . . 24 abteilung cytogenetik und Genomanalyse/ department of cytogenetics and Genome analysis . . . . . . . . . . 56 abteilung Molekulare Genetik/ department of Molecular Genetics . . . . . . . . . . 87 abteilung Physiology und zellbiologie/ department of Physiology and cell biology . . . . . . . . . . 121 datenbanken und Web-informationssysteme/ databases and Web information Systems . . . . . . . . . . 151 Pflanzengenom-Ressourcen-centrum (PGRc)/ Plant Genome Resources centre (PGRc) . . . . . . . . . . 152 die entwicklung der bioinformatik am iPk/ the development of bioinformatics at iPk . . . . . . . . . . 154 das doktorandenprogramm und die Leibniz-Graduiertenschule/ the Phd Programme and the Leibniz Graduate School . . . . . . . . . . 155 das iPk Postdoc board/ the iPk Postdoc board . . . . . . . . . . 158 Kolloquien und Seminare/ Colloquia and Seminars . . . 161 Gatersleben Lectures/ Gatersleben Lectures . . . . . . . . . . 161 Vavilov- und PGRG-Seminare/ Vavilov- and PGRG-Seminars . . . . . . . . . . 162 Vavilov-Vortragsabende/ Vavilov Lectures . . . . . . . . . . 163 Genetische Seminare/ Genetics Seminars . . . . . . . . . . 163 zellbiologische Seminare/ cell biology Seminars . . . . . . . . 165 Waterman-Seminare/ Waterman-Seminars . . . . . . . . . . 166 Vorträge/ Lectures . . . . . . . . . . 167 eingeladene Vorträge auf internationalen tagungen (auswahl)/ invited Lectures at international conferences (Selection) . . . . . . . . . . 167 Weitere Vorträge/ other Lectures . . . . . . . . . . 171 Vom Institut organisierte Tagungen und Veranstaltungen/ Conferences and Meetings Organised by IPK . . . . . . . . . . 187 Beteiligung an der Organisation externer Veranstaltungen/ Download 0.66 Mb. 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