Gestion des milieux naturels et de la biodiversite

 
 
 
 

 
 
Diagnostic du Docob du site Natura 2000 FR4301294-FR4312010 « Moyenne Vallée du Doubs » - Etablissement Public Territorial 
du Bassin Saône et Doubs – Décembre 2010 
- 190 -
 
Martin-pêcheur d’Europe     
Alcedo atthis 
 
(Linnaeus, 1758)  
Code Natura 2000 : A 228
 
 
Classe : Oiseaux 
 
Ordre : Coraciiformes 
 
Famille : Alcédinidés  
 
 
 
 
 
Statut et Protection 
 
 
Directive Oiseaux : Annexe I  
 
Protection nationale : Arrêté du 17 
Avril 1981  
 
Liste rouge nationale : 
Préoccupation 
mineure
 
 
Convention de Bern : Annexe II  
Répartition en France et en Europe 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Population  nicheuse  française  estimée  entre  10 000  et     
20 000 couples  
 
Intérêt patrimonial 
Cette espèce est un bon indicateur de l'état général d’un 
cours d’eau. 
Description de l’espèce 
Oiseau trapu à grande tête, à pattes et à la queue courtes et 
au bec effilé. Plumage vif : calotte et dos bleu turquoise, 
poitrine et ventre roux. Pousse un cri strident lors de vols au 
ras de l’eau  
Taille: 17-19,5 cm (dont environ 4 cm pour le bec), poids: 
35-40 g, longévité: 15 ans. 
 
Biologie et Ecologie 
Espèce  sédentaire,  nichant  isolément  dans  des  milieux 
présentant des eaux calmes (rivières, étangs, lacs). Apprécie 
les  berges  bordées  d’arbres  utilisés  comme  perchoir.  Se 
déplace en vol rapide au ras de l’eau.  
Il  niche  généralement  dans  les  berges  sablonneuses  et  est 
fidèle au site d’une année à l’autre. 
Le  Martin-pêcheur  d’Europe  plonge  verticalement  dans  l’eau 
pour  saisir  sa  proie  d’un  perchoir  ou  après  un  vol 
stationnaire. Il se nourrit exclusivement de petits poissons. 
 
Menaces potentielles 
Aménagement des berges (cimentage, etc.), pollution des rivières, urbanisation, activités humaines perturbatrices. 
 
Localisation sur le site  
Présent sur l’ensemble du site, le long du Doubs et du Cusancin. 
 
 
Caractéristique de l’habitat d’espèce et de l’espèce sur le site, état de conservation 
 
L’espèce à une large répartition mais à connu une diminution de son effectif durant les vingt dernière années. C’est une 
espèce sensible. Elle exige des eaux propres, claires et poissonneuses pour occuper un site. 
   
 
 
 
 
 
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Diagnostic du Docob du site Natura 2000 FR4301294-FR4312010 « Moyenne Vallée du Doubs » - Etablissement Public Territorial 
du Bassin Saône et Doubs – Décembre 2010 
- 191 -
 
Busard Saint Martin     
Circus cyaneus (Linnaeus, 1766)  
Code Natura 2000 : A 082
 
 
Classe : Oiseaux 
 
Ordre : Accipitriforme 
 
Famille : Accipitridés 
 
 
 
 
 
Statut et Protection 
 
 
Directive Oiseaux : Annexe I  
 
Protection nationale : Arrêté du 17 
Avril 1981  
 
Liste rouge nationale : 
Préoccupation 
mineure
 
 
Convention de Bern : Annexe II  
 
Convention de Bonn : Annexe II 
Répartition en France et en Europe 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Population  nicheuse  française  estimée  entre  7  800  et     
11 200 couples  
 
Intérêt patrimonial 
Cette  espèce  est  rare  au  niveau  régional,  accueil  des 
populations nordiques hivernantes.  
 
Description de l’espèce 
Le mâle a le plumage gris bleuté présentant des bouts d’ailes 
noires et un croupion blanc. La femelle a la poitrine rayée de 
brun sur fond blanc et un dos brun.  
Taille : 42 à 55 cm, envergure : de 97 à 118 cm, poids : 300 
à  400  g  pour  le  mâle  et  de  400  à  700  g  pour  la  femelle, 
longévité : 17 ans. 
 
Biologie et Ecologie 
Espèce  sédentaire,  occupant  des  étendues  de  bruyères  et 
petits arbres, des terrains en friches, des prairies humides. Il 
est  inféodé  aux  milieux  ouverts.  Il  chasse  surtout  dans  les 
champs et les terrains humides.  
 
Le Busard Saint-Martin chasse de petits rongeurs et de petits 
passereaux. 
 
Il  niche  à  terre  dans  la  végétation  touffue  parfois  en  petite 
colonie lâche et occupe le même territoire d’année en année. 
 
Menaces potentielles 
Transformation des habitats de reproduction, persécution directe, destruction des nids, diminution des espaces en herbe 
milieu d’hivernations des populations nordiques   
Localisation sur le site  
Sans données 
Caractéristique de l’habitat d’espèce et de l’espèce sur le site, état de conservation 
Espèce inféodée aux milieux palustres ouverts.  
 
 
 
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Diagnostic du Docob du site Natura 2000 FR4301294-FR4312010 « Moyenne Vallée du Doubs » - Etablissement Public Territorial 
du Bassin Saône et Doubs – Décembre 2010 
- 192 -
 
Milan noir     
Milvus migrans
 
(Linnaeus, 1758)  
Code Natura 2000 : A 073
 
 
Classe : Oiseaux 
 
Ordre : Falconiformes 
 
Famille : Accipitridé 
 
 
 
 
 
Statut et Protection 
 
Directive Oiseaux : Annexe I 
n° 79/409 
du 6 avril 1979
 
 
Protection nationale : Arrêté du 17 
Avril 1981  
 
Liste rouge nationale : A Surveiller 
 
Convention de Bonn: Annexe II 
 
Convention de Bern : Annexe II  
Répartition en France et en Europe 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Population  nicheuse  française  estimée  entre  3 000  et     
5 000 couples (16 % de la population mondiale) 
 
Population  nicheuses  franc-comtoise  estimée  entre  500 
et 700 couples. 
 
Intérêt patrimonial 
Cette  espèce  est  un  bon  indicateur  de  l'état  général  du 
site face à l'agriculture et à la diversité des habitats.   
 
Description de l’espèce 
Rapace de taille moyenne aux longues ailes et à longue 
queue. La tête est grisâtre striée de brun, un peu plus claire 
que le reste du corps, brun sombre sur le dessus et brun 
roux sur le dessous. La queue est longue et échancrée mais 
apparaît droite lorsqu’elle est complètement étalée. Les deux 
sexes sont d’apparences identiques. Les jeunes sont brun 
foncé taché de roux sur le dessus, brun plus pâle sur le 
dessous avec une tête gris- brun. 
Taille: 48 à 58 cm, envergure: 130 à 155 cm, poids: 650 à 
950 g, longévité: 23 ans. 
 
Biologie et Ecologie 
Espèce grégaire, qui vit près des lacs, des cours d’eau et des 
marais.  Peu  former  des  groupes  notamment    au  dortoir  ou 
encore  en  période  de  nidification  formant  ainsi  une  colonie. 
Le nid est généralement construit sur un grand arbre au bord 
de  l’eau  ou  en  lisière  et  peut  être  réutilisé  d’une  année  sur 
l’autre.  Grand  migrateur,  quittant  son  lieu  de  reproduction 
dès août pour l’Afrique tropicale et revenant en mars.  
Le  Milan  noir  chasse  à  moyenne  altitude  et  se  nourrit  de 
poissons, reptiles, micromammifères  et de charognes pris le 
long des routes ou des cours d’eau.  
 
Menaces potentielles 
Raréfaction  des  proies  due  à  la  diminution  des  surfaces  de  milieux  ouverts  (prairies,  pâtures).  Empoisonnement  par 
bioaccumulation  de  pesticide.  Persécution  et  chasse  par  l’homme.  Electrocution  sur  lignes  électriques  et  collision  avec 
véhicules. 
  
Localisation sur le site 
Sans données 
Caractéristique de l’habitat d’espèce et de l’espèce sur le site, état de conservation 
Le milan noir peut se rencontrer tout au long du site, principalement le long du Doubs 
 
 
 
 
 
 
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Diagnostic du Docob du site Natura 2000 FR4301294-FR4312010 « Moyenne Vallée du Doubs » - Etablissement Public Territorial 
du Bassin Saône et Doubs – Décembre 2010 
- 193 -
 
Grand-duc d’Europe     
Bubo bubo (Linnaeus, 1758)  
Code Natura 2000 : A 215
 
 
Classe : Oiseaux 
 
Ordre : Strigiformes 
 
Famille : Strigidés 
 
 
 
 
 
 
Statut et Protection 
 
 
Directive Oiseaux : Annexe I  
 
Protection nationale : Arrêté du 17 
Avril 1981  
 
Liste rouge nationale : Préoccupation 
mineure 
 
Convention de Bern : Annexe II  
Répartition en France et en Europe 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Population nicheuse française estimée à 950 couples 
Individus  locaux  pouvant  provenir  de  réintroduction 
allemande et helvétiques. 
 
Intérêt patrimonial 
Sa présence atteste de la non-fragmentation de son 
habitat et du bon état général des milieux. 
Description de l’espèce 
Plus grand rapace nocturne d’Europe. Aspect puissant, 
plumage épais, poitrine jaune rouille strié de sombre, dos 
brun barré de noire. Longues aigrettes mobiles, repliées en 
vol et visibles au repos, large disque facial, iris rouge orangé, 
menton blanc. Se déplace par d’amples battements d’ailes 
lents et puissants. 
La femelle est plus grosse que le mâle, le plumage reste 
identique.  
 
Taille: 59 à 73 cm, envergure: 138 à 170 cm, poids: 1500 à 
2000 g pour le mâle et de 2500 à 3000 g pour la femelle, 
longévité: 21 ans. 
 
 
 
Biologie et Ecologie 
Espèce  sédentaire,  vivant  au  bord  de  falaise  (site  de 
nidification) proche de semis ouvert (site de chasse). 
Dortoirs  diurnes  situés  dans  de  vieux  conifères  touffus  ou 
dans des cavités. Peu occasionnellement nicher à terre.  
Au  sommet  de  la  chaîne  alimentaire,  le  hibou  grand-duc 
chasse,  au  crépuscule  ou  à  l’aube,  des  mammifères  et  des 
oiseaux de taille moyenne.  
Menaces potentielles 
Destruction directe (tir, piégeage) ; électrocution, collision avec des câbles aériens, des voitures et des trains ; 
modification des milieux: abandon des cultures et augmentation des surfaces boisées entraînent une diminution des 
proies ; dérangement par travaux forestier en période de nidification ou activité des pleine nature.  
Localisation sur le site  
Il y a trois couples présents sur le site (2010) 
Caractéristique de l’habitat d’espèce et de l’espèce sur le site, état de conservation 
Le Grand-duc d’Europe est tributaire de différents habitats : milieu rupestre pour sa reproduction, milieu semis ouvert et 
milieu ouvert pour la chasse. On observe une augmentation généralisé du nombre d’individus toutefois, l’espèce reste 
rare et localisée. 
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Orange : espèce bien représentée 
Rouge : espèce faiblement représentée 
 
 
 
 

 
 
Diagnostic du Docob du site Natura 2000 FR4301294-FR4312010 « Moyenne Vallée du Doubs » - Etablissement Public Territorial 
du Bassin Saône et Doubs – Décembre 2010 
- 194 -
 
Faucon pèlerin     
Falco peregrinus
 
(Tunstall, 1771)  
Code Natura 2000 : A 103
 
 
Classe : Oiseaux 
 
Ordre : Falconiformes 
 
Famille : Falconidés 
 
 
 
 
 
Statut et Protection 
 
 
Directive Oiseaux : Annexe I 
Protection nationale : Arrêté du 17 
Avril 1981  
 
Liste rouge nationale : 
Préoccupation 
mineure
 
 
Convention de Bonn: Annexe II 
 
Convention de Bern : Annexe II  
Répartition en France et en Europe 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Population  française  estimée  à  400  couples  (10 %  de  la 
population européenne) 
 
Population  nicheuses  franc-comtoise  estimée  à  120 
couples. 
Intérêt patrimonial 
Cette  espèce  est  un  bon  indicateur  de  l'état  général  du 
site face à l'agriculture et à la diversité des habitats. 
 
Description de l’espèce 
Corps puissant à large poitrine, dos gris foncé, partie 
ventrale plus claire finement barrée de noir et ailes pointues. 
Nette différence de taille entre le mâle et la femelle. La tête 
présente une calotte noire et les joues sont marquées d’une 
large moustache noire contrastant avec la gorge et la poitrine 
blanche. Les ailes sont pointues et la queue est de longueur 
moyenne.  Les jeunes présentent de larges rayures sur une 
poitrine de couleur ocre.  
Taille: 38 à 51 cm, envergure: 89 à 100 cm pour le mâle et 
de 104 à 113 pour la femelle, poids: 650 à 750 g pour le 
mâle et de 900 à 1300 pour la femelle, longévité: 26 ans. 
 
Biologie et Ecologie 
Espèce  solitaire,  fréquentant  les  milieux  ouverts  dans  les 
régions  montagneuse.  Nicheur  rupestre,  son  aire  est  le  plus 
souvent  située  dans  la  partie  supérieure  des  parois 
rocheuses.  Il  peu  aussi  nicher  en  milieu  urbanisé  sur  de 
hauts édifices. En France le faucon pèlerin est sédentaire. Le 
couple reste formé à vie. 
Le  Faucon  pèlerin  se  nourrit  d’oiseaux  de  petites  et 
moyennes  tailles  qu’il  capture  en  vol,  après  une  poursuite 
horizontale ou un piqué débuté d’une grande hauteur. 
Menaces potentielles 
Utilisation  de  pesticide  organochlorés,  dérangement  durant  la  période  de  nidification  lors  d’activité  de  pleine  nature 
(escalade, randonnée, vol libre), capture pour la fauconnerie. 
Localisation sur le site (données DREAL FC 2010) 
On dénombre 12 Arrêtés de Protection de Biotope sur le site dont celui du Fort de Montfaucon, du fauteuil de Gargantua, 
ou du Mont Souvance. 
Caractéristique de l’habitat d’espèce et de l’espèce sur le site, état de conservation 
Le  faucon  pèlerin  est  une  espèce  inféodé  au  milieu  rupestre.  Les  falaises  lui  servent  de  site  de  nidification,  de  poste 
d’observation et de dortoir. L’attention particulière apportée à l’espèce à permis d’enrayer le déclin de la population. Le 
site  compte  un  grand  nombre  de  couple  nicheur  ainsi  la  Moyenne  du  Doubs  héberge  environ  10%  de  la  population 
régionale estimée à 120 couples. 
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Diagnostic du Docob du site Natura 2000 FR4301294-FR4312010 « Moyenne Vallée du Doubs » - Etablissement Public Territorial 
du Bassin Saône et Doubs – Décembre 2010 
- 195 -
 
Bondrée apivore     
Pernis apivorus (Linnaeus, 1758)
  
Code Natura 2000 : A 072
 
 
Classe : Oiseaux 
 
Ordre : Accipitriformes 
 
Famille : Accipitridé 
 
 
 
 
 
Statut et Protection 
 
 
Directive Oiseaux : Annexe I 
 
Protection nationale : Arrêté du 17 
Avril 1981  
 
Liste rouge nationale : Préoccupation 
mineure  
 
Convention de Bern : annexe II 
Répartition en France et en Europe 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Population estimée entre 10 000 et 15 000 couple. 
Intérêt patrimonial 
Cette  espèce  est  un  bon  indicateur  de  l'état  général  du 
site face à l'agriculture et à la diversité des habitats.   
 
Description de l’espèce 
Rapace de taille moyenne au plumage brun-roux 
Taille: 52 à 59 cm, envergure: 113 à 135 cm, poids: 600 à 
1000 g, longévité: 29 ans. 
 
Biologie et Ecologie 
Espèce visiteuse d’été de mai à septembre, qui fréquente les 
forêts  de  feuillus  à  proximité  de  prairie.  Le  nid  est 
généralement construit sur un grand arbre en lisière. Il peut 
être réutilisé d’une année à l’autre.  
 
La  Bondrée  apivore  se  nourrit  essentiellement  de  couvains 
d’hyménoptères mais chasse aussi rongeurs et reptiles. 
 
Menaces potentielles 
Raréfaction des proies due à la diminution des surfaces de milieux ouverts (prairies, pâtures). Persécution et chasse par 
l’homme. Electrocution sur lignes électriques et collision avec véhicules. 
  
Localisation sur le site 
Sans données 
Caractéristique de l’habitat d’espèce et de l’espèce sur le site, état de conservation 
La  Bondrée  Apivore  peut  nicher  dans  les  nombreux  habitats  forestiers  du  site,  notamment  dans  les  forêts  matures 
présentant des arbres de grandes tailles. 
 
 
 
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Diagnostic du Docob du site Natura 2000 FR4301294-FR4312010 « Moyenne Vallée du Doubs » - Etablissement Public Territorial 
du Bassin Saône et Doubs – Décembre 2010 
- 196 -
 
Milan royal     
Milvus milvus
 
(Linnaeus, 1758)  
Code Natura 2000 : A 074
 
 
Classe : Oiseaux 
 
Ordre : Falconiformes 
 
Famille : Accipitridé 
 
 
 
 
 
Statut et Protection 
 
 
Directive Oiseaux : Annexe I  
 
Protection nationale : Arrêté du 17 
Avril 1981  
 
Liste rouge nationale : A Surveiller 
 
Répartition en France et en Europe 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Population  nicheuse  française  estimée  entre  3 000  et     
3 900 couples (16 % de la population mondiale) 
 
Population  nicheuses  franc-comtoise  estimée  entre  500 
et 700 couples. 
Intérêt patrimonial 
Cette  espèce  est  un  bon  indicateur  de  l'état  général  du 
site face à l'agriculture et à la diversité des habitats.   
 
Description de l’espèce 
Rapace de taille moyenne aux longues ailes. La tête est 
blanchâtre, le plumage brun rouge dessus, roux rayé de brun 
dessous présentant deux fenêtres blanches. La queue est 
longue, rousse et très échancrée. Les deux sexes sont 
d’apparences identiques. 
Taille: 61 à 72 cm, envergure: 140 à 165 cm, poids: 720 à 
910g pour le  mâle et 800 à 1000g pour la femelle, 
longévité: 26 ans. 
 
Biologie et Ecologie 
Espèce  migratrice  partiel,  qui  fréquente  les  zones  agricoles 
ouvertes  (cultures,  pâtures,  prairies).  Le  nid  est 
généralement construit sur un grand arbre en bord de lisière.  
C’est une espèce grégaire qui forme des dortoirs regroupant 
plusieurs  dizaines  voire  centaines  d’individus  aussi  bien  sur 
les sites d’hivernage que lors de la migration. 
Le  Milan  royal  est  une  espèce  opportuniste  au  régime 
alimentaire  très  varié  (oiseaux,  reptiles,  micromammifères, 
vers de terre…) 
 
 
 
Menaces potentielles 
Raréfaction des proies due à la diminution des surfaces de milieux ouverts (prairies, pâtures).
  
Dérangements  en  période  de  nidification.  Persécution  et  chasse  par  l’homme.  Electrocution  sur  lignes  électriques  et 
collision avec véhicules. 
  
Localisation sur le site 
Sans données 
Caractéristique de l’habitat d’espèce et de l’espèce sur le site, état de conservation 
Le  Milan  royal  peut  se  rencontrer  tout  le  long  du  site,  principalement  en  bordure  d’habitats  forestier,  à  proximité  de 
milieux ouverts 
 
 
 
 
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Diagnostic du Docob du site Natura 2000 FR4301294-FR4312010 « Moyenne Vallée du Doubs » - Etablissement Public Territorial 
du Bassin Saône et Doubs – Décembre 2010 
- 197 -
 
Pic cendré     
Picus canus 
 
(Gmelin, 1788)  
Code Natura 2000 : A 223
 
 
Classe : Oiseaux 
 
Ordre : Piciformes 
 
Famille : Picidés