I-bob. Adabiyotlar taxlili ii-bob

2.3. Protein axborot resursi-PIR.
PIR - protein axborot resursi bazasi, Jorjtaun universiteti tibbiyot markazi (GUMC) tomonidan bioinformatikani qo‘llab-quvvatlash maqsadida genom va proteom tadqiqot natijalari va oqsil ketma-ketliklarini taqdim etadi
PIR 1984 yilda Uinona Barker va Robert Ledlilar boshchiligida Milliy Biotibbiy Tadqiqotlar Fondi (NBRF) tomonidan tadqiqotchilar va mijozlarga oqsillar ketma-ketligi ma‘lumotlarini aniqlash va izohlashda yordam beradigan manba sifatida tashkil etilgan. Bungacha NBRF 1964-1974 yillarda Margaret Dayhoff tahriri ostida nashr etilgan "Proteinlar ketma-ketligi va tuzilishi atlasi" da birinchi makromolekulyar ketma-ketlik to‘plamini tuzgan. Dayxof va uning tadqiqot guruhi oqsillar ketma-ketligini taqqoslash, ketma-ketliklar orasidagi masofa va ketma-ketlikni aniqlash hamda oqsillar ketma-ketligi evolyutsion tarixini aniqlash uchun kompyuter usullarini ishlab chiqishda kashf etdilar.
PIR boshqa ma‘lumotlar bazalari jumladan, EBI (Yevropa Bioinformatika Instituti), oqsillar ketma-ketligi va funktsiyalarining markaziy manbai bo‘lgan
UniProt (Birlashgan Protein ma‘lumotlar bazasi) va SIB (Shveytsariya Bioinformatika Instituti) bilan birgalikda ish yuritishadi.
PIR o‘zida oqsillar ketma-ketligi, oilalari, fermentlar va fermentativ yo‘llar, molekulyar tuzilmalar va strukturalar ularning sinflari, genlar va genomlar, adabiyot va taksonomiyalarning ko‘p sonli molekulyar ma‘lumotlar bazalariga keng ko‘lamli murojaatlarni va havolalarni taqdim etadi.
Ushbu sayt ma‘lumotlarini UniProt (Birlashgan Protein ma‘lumotlar bazasi) resurslari bilan dastlabki tahlilini o‘tkazgan holda taqdim etib, tahlil qilishda ham UniProt dasturlaridan foydalanadi.


Foydalanilgan adabiyotlar:
1) Xaksli J. 1959. Klasslar va sinflar. Qobilda A.J. (tahrirlangan) Vazifasi va taksonomik
ahamiyati. Sistematik assotsiatsiya, London.
2) Latreil, P.A. (1804). Nouveau Dictionnaire à Histoire Naturelle, xxiv; Latreilda keltirilgan,
P.A. (1825).Familles naturelles du règne animal, foshlar qisqacha va dans un ordre analytique.
3) a b Tudge, Kolin (2000). Hayotning xilma-xilligi. Oksford universiteti matbuoti.
ISBN 0198604262.
4) LAN, R; Rivz, PR (2002). "Escherichia coli maskasi: Shigellaning molekulyar kelib chiqishi".
Mikroblar va infektsiya / Institut Pasteri. 4 (11): 1125–32. doi:10.1016 / S1286-4579 (02) 01637-
4. PMID 12361912.
5) a b Grant, Verne (1998). "Molekulyar kladistika bo'yicha sharhlar bilan polemoniasiyalarning
birlamchi tasnifi va filogeniyasi". Amerika botanika jurnali. 85 (6): 741–752.
doi:10.2307/2446408. JSTOR 2446408. PMID 21684957.
6) Sperling, E. A .; Pisani, D .; Peterson, K. J. (2007 yil 1-yanvar). "Poriferan parafili va uning
prekambriyadagi paleobiologiyaga ta'siri" (PDF). Geologik Jamiyat, London, Maxsus nashrlar.