|
37.Дастлабки геометрияларни ва инпут файлларни тайёрлаш усуллари.
Birikmalarning hisoblashlar uchun dastlabki geometriyalarini tayyorlash hamda hisoblash natijalarini grafik tarzda ifodalash maqsadida yordamchi dasturlar ˗ interfeyslar yaratilgan. Sababi, Mopac va boshqa majmualar faqat maxsus input fayllarni tushunadi. Interfeyslarda modda geometriyasi chizilib, input fayllar hosil qilinadi. Shuning uchun oldin ayrim input fayllarni qarab chiqamiz. Keyin bironta dasturda hosil qilingan input fayl formati boshqa dasturlar fayl formatlariga openbabel (www.openbabel.org) dasturi orqali o‘girilishi mumkin. Atomlarning x, y va z koordinatalar o‘qida joylashish tartibi bo‘yicha hosil qilingan maxsus fayllar kartsian ko‘rinishidagi input fayllar deyiladi. Yuqorida Avogadro, GaussView, MaSK, ChemCraft va WinMostar interfeyslarida Mopac, Gamess yoki Gaussian input fayllarini tuzish mumkinligi aytildi. Bu interfeyslarning ichida yaponiyalik olimlar tomonidan yaratilgan WinMostar (www.winmostar.com) dasturi keng imkoniyatlarga ega.
Do'stlaringiz bilan baham: |
