Kurs ishi mavzu: Filogenetikaning asosiy tushunchalari

6-rasm: Filogenetik daraxtlarning turlari. Bu daraxtlar har xil bo'lishiga qaramay, ekvivalent munosabatlarni tasvirlaydi.

Turli xil ko'rinishdagi daraxtlar bir xil ma'lumotlarni o'z ichiga olishi chalkash tuyulishi mumkin. Bu erda daraxtning chiziqlari evolyutsion nasllarni ifodalashini eslash foydali bo'lishi mumkin va evolyutsion nasllarning haqiqiy pozitsiyasi yoki shakli yo'q. Shunday qilib, 7-rasmda ko'rsatilganidek, A uchiga olib boradigan novdani bo'linishning o'ng yoki chap tomonida chizish bir xil darajada haqiqiydir. to'rtburchak daraxt hosil qilish uchun bukilgan yoki dumaloq daraxt qilish uchun egri. Nasllarni qattiq tayoqchalar emas, balki moslashuvchan quvurlarni tozalash vositalari sifatida o'ylab ko'ring; xuddi shunday, rasm tugunlari sobit choklarni emas, balki aylana oladigan universal bo'g'inlar sifatida. Ushbu turdagi tasvirlardan foydalangan holda, masalan, 7-rasmdagi uchta daraxt ekvivalent ekanligini ko'rish osonroq bo'ladi.

7-rasm: Filogenetik daraxtdagi munosabatlar bir necha usulda tasvirlanishi mumkin.
Ba'zi ichki novdalar uchi teglar tartibi boshqacha bo'lishi uchun aylantirilganiga qaramay, bu daraxtlar ekvivalent munosabatlarni tasvirlaydi.

Va nihoyat, shuni ta'kidlash kerakki, ba'zi hollarda to'rtburchaklar filogenetik daraxtlar novdalar uzunligi mazmunli bo'lishi uchun chiziladi. Ushbu daraxtlar ko'pincha filogrammalar deb ataladi va ular odatda ma'lum bir gen ketma-ketligida sodir bo'lgan evolyutsiya miqdorini yoki novdalarning taxminiy davomiyligini tasvirlaydi. Odatda, bunday daraxtlarning konteksti filial uzunligining ma'noga ega ekanligini aniq ko'rsatadi. Biroq, bunday bo'lmaganda, ko'rsatilmagan har qanday vaqtinchalik ma'lumotni o'qishdan qochish kerak. Misol uchun, 8-rasmda A va B uchlariga olib boradigan oxirgi bo'linishni belgilovchi tugun ( x belgilangan ) C uchini D va E uchlaridan ( y belgilangan ) ajratib turuvchi tugundan keyin paydo bo'lganligini ko'rsatishi mumkin. Biroq, bu daraxtga o'qilmasligi kerak; haqiqatda, tugunx y tugunidan oldin yoki keyin sodir bo'lishi mumkin edi .