Kurs ishi mavzu: Oqsil ketma-ketliklari bazalari (swiss-prot)
SWISS-PROT va TrEMBL-ga interaktiv kirish
Download 184.51 Kb.
|
183-Shokirova Shamsiya. OQSIL KETMA-KETLIKLARI BAZALARI (SWISS-PROT).
- Bu sahifa navigatsiya:
- Toliq SWISS-PROT va/yoki TrEMBL relizlarini qanday olish mumkin
- SWISS-PROT-ga malumotlar yoki yangilanishlar/tuzatishlarni qanday yuborish kerak
|
SWISS-PROT va TrEMBL-ga interaktiv kirish
SWISS-PROT yoki TrEMBL-da interaktiv ko'rib chiqishning eng samarali va foydalanuvchilarga qulay usuli bu WWW molekulyar biologiya serveri ExPASy va EBI tomonidan ishlab chiqilganidan foydalanishdir. 1993-yil sentabrida ExpASy veb-server ommaga taqdim etildi. 1999-yil oktyabr oyida jami 60 million ulanishga erishildi. Uning manzili: http://www.expasy.ch/ ExPASy-ning to'liq va yangilangan oyna saytlari Avstraliya, Kanada va Tayvanda mavjud: http://expasy.proteome.org.au/ (Avstraliya Proteome Analysis Facility, Sidneyda) http://expasy.cbr.nrc.ca/ (Kanada bioinformatika resursida, Halifax) http://expasy.nhri.org.tw/ (Milliy sog'liqni saqlash tadqiqot institutlarida, Taypey) EBI serveriga quyidagi manzilda kirish mumkin: http://www.ebi.ac.uk/ ExPASy va EBI veb-serverlarida ketma-ketlik yozuvlarini so'rash va olish uchun Sequence Retrieval System (SRS) dasturiy paketidan foydalanishingiz mumkin. EBI va SIB, shuningdek, Smit-Waterman, FASTA va BLAST ketma-ketligi o'xshashligini ishlatish uchun bir qator qidiruv xizmatlarini taklif qiladi. SWISS-PROT + TrEMBL ga qarshi qidiruvlar. To'liq SWISS-PROT va/yoki TrEMBL relizlarini qanday olish mumkin SWISS-PROT + TrEMBL EBI tomonidan CD-ROMda tarqatiladi. CD-ROMlar shuningdek, MS-DOS va Apple Macintosh kompyuterlari uchun ma'lumotlar bazasi so'rovlari va qidirish dasturlarini o'z ichiga oladi. Barcha savollar uchun quyidagi manzilga murojaat qiling: EMBL Outstation — Yevropa bioinformatika instituti, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Kembrij CB10 1SD, Buyuk Britaniya. Tel: +44 1223 494 444; Faks: +44 1223 494 468; Elektron pochta: datalib@ebi.ac.uk Internetga ulangan kompyuterdan SWISS-PROT va TrEMBL ni anonim FTP (Fayl uzatish protokoli) yordamida quyidagi serverlardan olishingiz mumkin: ftp.expasy.ch va ftp.ebi.ac.uk SWISS-PROT-ga ma'lumotlar yoki yangilanishlar/tuzatishlarni qanday yuborish kerak Yangi ketma-ketlik ma'lumotlarini SWISS-PROTga yuborish va topshirish jarayoniga oid barcha so'rovlar uchun quyidagi manzilga murojaat qiling: SWISS-PROT, The EMBL Outstation — The European Bioinformatika Instituti, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Cambridge CB10 1SD, Buyuk Britaniya. Tel: +44 1223 494 457; Faks: +44 1223 494 468; Elektron pochta: datasubs@ebi.ac.uk (yuborish uchun) yoki datalib@ebi. ac.uk (so'rovlar uchun). SWISS-PROT-ga yangilanishlar va/yoki tuzatishlar yuborish uchun siz swiss-prot@expasy.ch elektron pochta manzilidan yoki http://www.expasy.ch/sprot/sp_update_form.html WWW manzilidan foydalanishingiz mumkin. Download 184.51 Kb. Do'stlaringiz bilan baham: 
|