Mavzu: rnk shaperonlar

RNK chaperonlar makromolekulyar qarshi ionlar sifatida.
Ushbu nukleoprotein kompleksining strukturaviy xususiyatlari haqida ma'lumot berishdan tashqari, bizning qo'pol taneli modelimiz musbat zaryadlangan tartibsiz oqsillarning nuklein kislotasi chaperonlari sifatida qanday ishlashi mumkinligi haqidagi savolni ham hal qilishga imkon beradi. E'tiborlisi, eksperimental ravishda kuzatilgan kinetik xatti-harakatlarning aksariyati simulyatsiyalar (7-rasm) yordamida takrorlanadi, masalan: (i) chaperonni bog'lash katlama tezligini oshiradi; (ii) chaperon o'xshash tezlikda buklangan va ochilgan soch turmagi bilan bog'lanadi;
RNK Chaperonlari va RNK Chaperone faolligi bo'lgan oqsillar nima?
RNK chaperon faolligi mumkin bo'lgan oqsillar ro'yxati doimiy ravishda o'sib bormoqda. RNK katlamini qo'llab-quvvatlaydigan turli xil faollikka ega oqsillar ushbu guruhga tasniflanadi. RNK chaperon faolligiga ega bo'lgan oqsilning ta'rifi shundan iboratki, oqsil noto'g'ri katlanmış tuzilmalarni ochib, RNKning noto'g'ri qatlamlanishini oldini oladi. RNK chaperon faolligi bo'lgan oqsillar ATP ni talab qilmaydi, bu ularni RNK spirallaridan, RNKning katlanishini osonlashtiradigan oqsillarning boshqa guruhidan ajratib turadi (masalan, Cyt-19) [2].
RNK Chaperone faolligini o'lchash uchun tahlillar
RNK chaperon faolligi bo'lgan oqsillar tuzilishi va RNK molekulalarining katlamlarini hal qilish usullari bo'yicha juda xilma-xil bo'lganligi sababli, turli xil faollikni o'lchash uchun turli xil RNK chaperon tahlillari mavjud. Asosan, tahlillarni in vitro va in vivo tahlillarga bo'lish mumkin, ularda oddiy oligonükleotidlarni yumshatish yoki joy o'zgartirish reaktsiyalaridan foydalaniladi yoki to'g'ri katlanmış ribozimlarning katalitik faolligini o'lchaydi.
RNK chaperonining tabiiy muhitida substratlarning ma'lum bir to'plamiga aniqroq yo'naltirilishi mumkin bo'lgan faollikni o'lchash bitta tahlil yordamida RNK chaperon faolligini baholashni qiyinlashtiradi.
RNKni yumshatish jarayonida to'planish effekti
RNKni yumshatish jarayonida to'planish effekti hech bo'lmaganda ma'lum darajada rol o'ynashi mumkinligini ko'rsatadigan yana bir ko'rsatkich quyidagilardir: RNK chaperon faolligi in vitro o'lchanganda, tahlilda RNKdan ko'ra protein har doim ko'p bo'ladi. Masalan, trans-splaysing tahlilida 200 nMols RNK (20 nM yakuniy kontsentratsiyaga olib keladi) 1-2 mkM oqsil ishtirokida katlama uchun sinovdan o'tkaziladi.
Tartibsiz RNK şaperonlari g'oyasi ayniqsa jozibali, chunki tartibsiz mintaqalarga ega bo'lgan oqsillarning ixcham oqsillarga nisbatan ko'plab afzalliklari mavjud: (1) tartibsiz mintaqaning asosiy afzalligi shundaki, u juda ko'p turli sheriklar bilan osongina o'zaro ta'sir qilishi mumkin va cheklanmagan. sherik molekulasida bitta bog'lovchi cho'ntagiga yoki tanib olish elementiga. (2) Tuzilmagan oqsilning kattaroq yuzasi noto'g'ri katlanmış RNK molekulasi uchun "bo'shashtiruvchi ta'sir" berishi mumkin. (3) RNKni yechish uchun energiya qayerdan kelib chiqishi mumkinligi haqidagi muammoli savolni RNK bilan o'zaro ta'sirlashganda ixchamlikning ortishi va RNK strukturasining bir vaqtning o'zida bo'shashishi bilan izohlash mumkin
Xulosa
Kelajakda RNK shaperonlari bo'yicha tadqiqot asosiy e'tibor molekulyar mexanizmni tushunishga va oqsillarning o'ziga xos tuzilmagan hududlari funktsiyada qanday rol o'ynashi mumkinligini tushunishga qaratilgan. Qizig'i shundaki, 70% aminokislota identifikatsiyasini o'z ichiga olgan Archaeadan olingan ikkita juda yaqin bog'langan L1 ribosoma oqsillari qarama-qarshi faoliyatga ega: mezofil L1 oqsili kuchli RNK chaperon faolligini ko'rsatadi, termofil esa ribozim tahlillarini inhibe qiladi [42]. Mutatsiyani batafsil o'rganish, ehtimol, turli xil faoliyatlarni yoritib beradi va hech bo'lmaganda RNK shaperonlarining kichik guruhi uchun RNKni boshqarish mexanizmini tushuntiradi.
Biroq, katta qiyinchilik RNK shaperonlarining in vivo maqsadlarini aniqlash bo'ladi. RNK shaperonlari keng o'ziga xosligi uchun tahlillarda baholanadi, ammo in vivo ular RNK molekulalarining faqat bir qismining katlanishini nazorat qilish uchun ixtisoslashgan bo'lishi mumkin. O'ziga xoslik, ehtimol, homiylik faoliyatidan boshqa domen tomonidan berilishi mumkin.
Foydalanilgan adabiyotlar
Breaker, RR & Joyce, GF RNK va DNK funktsiyasining kengayayotgan ko'rinishi.
Kimyo &. Kimyo. Biol. 21, 1059–1065 (2014).
Thirumalai, D. & Hyeon, C. RNK va oqsillarni katlama: umumiy mavzular va o'zgarishlar. Biokimyo 44, 4957–4970 (2005).
Herschlag, D. RNK shaperonlari va RNKning katlama muammosi. J. Biol. Kimyo.
Rev. 270, 20871–20874 (1995).
Chen, SJ & Dill, RNK katlama energiya landshaftlari. Proc. Natl akad. Sci. AQSH 97, 646–651 (2000).
ETIBORINGIZ UCHUN RAHMAT