Mavzu: rnk shaperonlar

TAQDIMOTI
BIOTEXNOLOGIYA FAKULTETI
BIOLOGIYA YO’NALISHI
IV-BOSQICH K.BIO-EU-19 GURUH TALABASI
BOLTABOYEVA XUSNIDANING
BIOINFORMATIKA FANIDAN
TAYYORLAGAN
MAVZU: RNK SHAPERONLAR
REJA:
Kirish
1. NCD elektrostatik o'zaro ta'sirlar
2. NCD ning katta va qarama-qarshi strukturaviy zaryadini hisobga olish
3. RNK chaperonlar makromolekulyar qarshi ionlar sifatida.
4. RNK Chaperon faolligi va RNKning noto'g'ri qatlamlanishi bilan oqsillarning ta'rifi
5. RNK Chaperonlari va RNK Chaperone faolligi bo'lgan oqsillar nima?
6. RNK Chaperone faolligini o'lchash uchun tahlillar
7. RNKni yumshatish jarayonida to'planish effekti
Xulosa
Foydalanilgan adabiyotlar
Kirish
Nuklein kislotalarning polianionliligi tufayli bu tuzilmalarning shakllanishiga elektrostatika kuchli ta'sir ko'rsatadi. Bundan tashqari, oqsillar holatida bo'lgani kabi, mahalliy bo'lmagan o'zaro ta'sirlar biologik faol konformatsiyalarni molekulyar qidirishga to'sqinlik qilishi va kinetik tuzoqqa olib kelishi mumkin 2 . Nuklein kislotalar uchun katlama muammosi ularning bir-biri bilan kuchli o'zaro ta'sirga ega bo'lgan monomerik qurilish bloklarining kichik to'plami bilan yanada kuchayadi, bu esa berilgan ketma-ketlik uchun noyob tuzilmani aniqlashni qiyinlashtiradi 3 . Natijada, oligonokleotidlar ko'pincha buzilgan funktsiyalari bilan uzoq muddatli nonativ konformatsiyalarni qabul qiladi. RNK şaperonlari oqsillar sinfi bo'lib, nuklein kislotalarga o'zlarining mustahkam energetik landshaftini ixcham va termoregulyatsiyaga olib borishga yordam berish orqali ushbu muammoni engillashtiradi.
 NCD elektrostatik o'zaro ta'sirlar
NCD elektrostatik o'zaro ta'sirlar orqali buklanishga yordam beradi. NCD ning soch tolasini shakllantirish qobiliyati 7-bp li poyali halqa tuzilishini hosil qilish uchun mo'ljallangan erkin tarqaladigan nuklein kislotalar bo'yicha konfokal bir molekulali FRET tajribalaridan ko'rinib turibdi (1-a-rasm ) . Ushbu soch turmagi molekulalari sayt uchun maxsus etiketlangan
3' va 5' uchlari yaqinida mos ravishda donor va akseptor bo'yoqlari bo'ladi, bu esa o'ta masofaga bog'liq bo'lgan uzatish samaradorligini o'zgartirish orqali ildiz halqasining shakllanishini (ya'ni, buklanishni) kuzatish imkonini beradi.
NCD ning katta va qarama-qarshi strukturaviy zaryadini hisobga olgan holda 25 (+25/
−3) va DNK (−60) (1-rasm). 1 a), ularning assotsiatsiyasi elektrostatik boshqarilishi kutilmoqda. Darhaqiqat, kompleksning barqarorligi NaCl qo'shilishiga juda sezgir bo'lib, appKd ning kuchli bir vaqtda ortishi ( 1 -rasm c, d). Ushbu ta'sirni NCD va DNK bog'langanda ~ 14 ta qarama-qarshi ionning chiqishi nuqtai nazaridan talqin qilish mumkin (3-rasm).