Muhammad al-xorazmiy nomidagi toshkent axborot texnologiyalari universiteti bioinformatika va biomexanika


Download 0.57 Mb.
bet3/6
Sana10.04.2023
Hajmi0.57 Mb.
#1348623
1   2   3   4   5   6
Bog'liq
Abdirimov Azizbek

Asosiy bioinformatik dasturlar


  • ACT (Artemis Comparison Tool) Wayback Machine saytida arxivlandi (2011-01-09). — genomik tahlil

  • Arlequin — populyatsiya genetik maʼlumotlarini tahlil qilish

  • Bioconductor — bu bioinformatika boʻyicha tadqiqotlar uchun koʻplab mustaqil paketlarni taqdim etadigan katta FLOSS loyihasi.

  • BioEdit — nukleotidlar va aminokislotalar ketma-ketligini bir nechta taxrir qilish uchun muharrir.

  • BioNumerics Wayback Machine saytida arxivlandi (2012-08-19). — universal dasturiy taʼminot toʻplami

  • BLAST — nukleotidlar va aminokislotalar ketma-ketligi maʼlumotlar bazasida tegishli ketma-ketliklarni qidirish

  • Clustal — nukleotidlar va aminokislotalar ketma-ketligini taxrirlash.

  • DnaSP — DNK ketma-ketligi polimorfizmini tahlil qilish

  • FigTree — filogenetik daraxtlar muharriri

  • Genepop — populyatsiya genetik tahlili

  • Genetix — Populyatsiya genetik tahlili (faqat frantsuz tilida mavjud)

  • JalView —nukleotidlar va aminokislotalar ketma-ketligini bir nechta tekislash uchun muharrir.

  • MacClade — interaktiv evolyutsion maʼlumotlarni tahlil qilish uchun pulli dasturidir.

  • MEGA — molekulyar evolyutsion genetik tahlil

  • Mesquite — qiyosiy biologiya Java dasturi

  • Muscle — nukleotid va aminokislotalar ketma-ketligini koʻp taqqoslash. ClustalW ga qaraganda tezroq va aniqroq

  • PAUP — parsimoniya yordamida filogenetik tahlil

  • PHYLIP — filogenetik dasturiy taʼminot toʻplami

  • Phylo_win — filogenetik tahlil. Dastur grafik interfeysga ega.

  • PopGene —pulyatsiyalarning genetik xilma-xilligini tahlil qilish

  • Populations — populyatsiya genetik tahlili

  • PSI Protein Classifier — PSI-BLAST dasturi yordamida olingan natijalarning qisqacha mazmuni

  • Seaview — Filogenetik tahlil (GUI)

  • SplitsTree Wayback Machine saytida arxivlandi (2018-03-14). — filogenetik daraxtlarni qurish uchun dastur

  • UGENE — bu rus tilidagi bepul vosita, nukleotidlar va aminokislotalar ketma-ketligini bir nechta marta taxrirlash, filogenetik tahlil, annotatsiya, maʼlumotlar bazalari bilan ishlash.

  • ZENBU — natijalar xulosasi

Download 0.57 Mb.

Do'stlaringiz bilan baham:
1   2   3   4   5   6




Ma'lumotlar bazasi mualliflik huquqi bilan himoyalangan ©fayllar.org 2024
ma'muriyatiga murojaat qiling