Mundarija: Kirish I. Bob. Zamonaviy bioinformatsion ma'lumotlar asoslari
Download 0.73 Mb.
|
Mundarija Kirish I. Bob. Zamonaviy bioinformatsion ma\'lumotlar
TrEMBLKB/Swiss-Prot.TrEMBLKB/Swiss-Prot - qo'lda izohlangan, ortiqcha bo'lmagan oqsillar ketma-ketligi ma'lumotlar bazasi. U ilmiy adabiyotlardan olingan ma'lumotlarni va biokurator tomonidan baholangan hisoblash tahlilini birlashtiradi. TrEMBLKB/Swiss-Prot dasturining maqsadi ma'lum bir protein haqida barcha ma'lum bo'lgan tegishli ma'lumotlarni taqdim etishdir. Ilmiy topilmalar bilan tanishish uchun izohlar muntazam ravishda ko'rib chiqiladi. Yozuvning qo'lda annotatsiyasi oqsil ketma-ketligini va ilmiy adabiyotlarni batafsil tahlil qilishni o'z ichiga oladi. Xuddi shu gen va bir xil turdagi ketma-ketliklar bir xil ma'lumotlar bazasiga birlashtiriladi. Ketma-ketliklar orasidagi farqlar aniqlanadi va ularning sabablari hujjatlashtiriladi (masalan, muqobil birlashma, tabiiy o'zgarish, noto'g'ri boshlash joylari, noto'g'ri ekson chegaralari, ramka siljishi, noma'lum ziddiyatlar). TrEMBLKB/Swiss-Prot yozuvlari izohida ketma-ketlikni tahlil qilish vositalaridan foydalaniladi. Kompyuter prognozlari qo'lda baholanadi va tegishli natijalar yozuvga kiritish uchun tanlanadi. Ushbu bashoratlarga post-translational modifikatsiyalar, transmembran domenlari va topologiyasi kiradi .signal peptidlari , domen identifikatsiyasi va oqsillar oilasi tasnifi. Tegishli nashrlar PubMed kabi ma'lumotlar bazalarini qidirish orqali aniqlanadi . Har bir maqolaning to'liq matni o'qiladi va ma'lumotlar chiqariladi va yozuvga qo'shiladi. Ilmiy adabiyotlardan kelib chiqadigan annotatsiya quyidagilarni o'z ichiga oladi, lekin ular bilan cheklanmaydi: Protein va gen nomlari Funktsiya Katalitik faollik , kofaktorlar va katalitik qoldiqlar kabi fermentga xos ma'lumotlar Hujayra osti joylashuvi Protein-oqsil o'zaro ta'siri Ifoda shakli Muhim domenlar va saytlarning joylashuvi va rollari Ion -, substrat - va kofaktor bilan bog'lanish joylari Tabiiy genetik o'zgaruvchanlik, RNKni tahrirlash , muqobil qo'shilish, proteolitik ishlov berish va translatsiyadan keyingi modifikatsiya orqali hosil bo'lgan oqsil varianti shakllari Izohlangan yozuvlar TrEMBLKB/Swiss-Prot-ga qo'shilishdan oldin sifat kafolatidan o'tadi. Yangi ma'lumotlar mavjud bo'lganda, yozuvlar yangilanadi. Download 0.73 Mb. Do'stlaringiz bilan baham: |
Ma'lumotlar bazasi mualliflik huquqi bilan himoyalangan ©fayllar.org 2024
ma'muriyatiga murojaat qiling
ma'muriyatiga murojaat qiling