Mustaqil ish mavzu: genom ma’lumotlari asosida filogenetik daraxt tuzish

Filogenetik daraxt barcha uch domendan organizmlarning umumiy kelib chiqishini ko’rsatadi. Bakteriyalar ko’k, eukariotlar qizil va arxeylar yashil rang bilan belgilangan. Ba’zi tiplarning o’zoro aloqasi daraxtning atrofida ko’rsatilgan.

• 
  Filogenetik daraxt barcha uch domendan organizmlarning umumiy kelib chiqishini ko’rsatadi. Bakteriyalar ko’k, eukariotlar qizil va arxeylar yashil rang bilan belgilangan. Ba’zi tiplarning o’zoro aloqasi daraxtning atrofida ko’rsatilgan.
  

RNK GENLARI UCHUN NAZARIY ILDIZLASHTIRILGAN DARAXTI, BARCHA UCH DOMEN : BAKTERIYA, ARXEY, EUKARIOTLARNING UMUMIY KELIB CHIQISHINI KO’RSATADI.

OQSIL-MIOZINLARNING ILDIZLASHTIRILMAGAN DARAXTI

Ildizlashtirilgan daraxt —ajratilgan cho’qqi –ildizga ega bo’lgan daraxtdir. Ildizlashtirilgan daraxtni orientirlangan graf deb tasavvur qilish mumkin. Chunki unda ildizdan yaproqlarga tomon aniq orientatsiya mavjud. Bunda har tugun pastki qismdagi daraxt yaproqlari uchun javob beradi.

• 
  Ildizlashtirilgan daraxt —ajratilgan cho’qqi –ildizga ega bo’lgan daraxtdir. Ildizlashtirilgan daraxtni orientirlangan graf deb tasavvur qilish mumkin. Chunki unda ildizdan yaproqlarga tomon aniq orientatsiya mavjud. Bunda har tugun pastki qismdagi daraxt yaproqlari uchun javob beradi.
  
• 
  Ildizsiz daraxt ildizga ega emas va yaproqlar orasidagi aloqani umumiy ajdod tahminlarisiz ko’rsatib beradi. Evolyutsiya yo’nalishidan ko’ra tugunlar orasidagi aloqani tiklash oson bo’lganligi sababli ildizsiz filogenetik daraxt ko’rib chiqilgan. 2-rasm ildizsiz filogenetik daraxtni aks ettiradi. ILdizsiz filogenetik daraxtni ildizli ko’rinishga o’tkazishda turlarning “tashqi guruxi”ni –bizni qiziqtirgan turlar naboriga yetarlicha yaqin, ammo shu bilan birga aloxida gurux sanaluvchi turlarni qo’llash eng qulay usul xisoblanadi (buning uchun tugunlardan birini ildiz deb e’lon qilish, yoki ildizdan chiquvch novdalardan birini ikkiga bo’lish lozim) . Ammo ba’zan o’rganilayotgan ob’ekt tabiati xaqida yetarlicha ma’lumotga ega bo’lganda ildizning holatini tahmin qilish mumkin bo’ladi.