Muxammad al-xorazmiy nomidagi toshkent axborot texnologiyalari unversiteti samarqand filiali «kompyuter injiniringi»
Download 25.72 Kb.
|
3-amaliy mashgulot
- Bu sahifa navigatsiya:
- MUTAXASSISLIGI 104-GURUX TALABASI TULIYEV OTABEKNING Amaliy mashg’uloti Samarqand 2022
|
O’ZBEKISTON RESPUBLIKASI OLIY VA O’RTA MAXSUS TA’LIM VAZIRLIGI MUXAMMAD AL-XORAZMIY NOMIDAGI TOSHKENT AXBOROT TEXNOLOGIYALARI UNVERSITETI SAMARQAND FILIALI «KOMPYUTER INJINIRINGI» KAFEDRASI “KOMPYUTER INJINIRINGI” MUTAXASSISLIGI 104-GURUX TALABASI TULIYEV OTABEKNING Amaliy mashg’uloti Samarqand 2022 3-Amaliy mashg’ulotMavzu: Qidiruv natijasida topilgan ketma-ketliklarni birma-bir tahlil qiling. Kirish
Qadamlar NCBI ma’lumotlar bazasidan Gen pastki ma’lumotlar bazasini tanlang. Homo sapiens genlari maʼlumotlar toʻplamida genni qidirishni belgilash uchun soʻrov maydoniga Gen nomini kiriting, LCT mantiqiy operatori bilan VA. Qidiruv tugmasini bosing, u eng ko’p taxminni ko’rsatadi va undan pastda u Homo sapiensdagi LCT genining qidiruv natijalarini ko’rsatadi. U turli xil ma’lumotlarni ko’rsatadi, masalan, Gen nomi/ID, Tavsif, Joylashuv, taxalluslar va genlarning MIM kirish raqamlari. Gen nomidan LCT giperhavolasini bosing. LCT ning Gen sahifasiga o’tadi. U LCT genining xulosasini ko’rsatadi, masalan, uning rasmiy belgisi, asosiy manbasi, rasmiy nomi, gen turi, ifodasi, nasl-nasabi, ortologi, xulosasi, gen turi va boshqa ma’lumotlar bazalariga havolalar. Genom konteksti bo’limida genning xromosomadagi joylashuvi, uning izohli chiqishi, yig’ilishi va genning grafik tasviri ko’rsatilgan. Genomik hududlar, transkriptlar va mahsulotlar bo’limlari ketma-ketlikning o’lchami, joylashuvi va yo’nalishini eslatib o’tadi. Shuningdek, u transkriptlari va izoformalarining kirish raqamlarini beradi. Qo’shilish raqamining boshidagi XM bu mRNK qo’shilish raqami ekanligini va qo’shilish raqamining boshida XP bu proteinga kirish raqami ekanligini belgilaydi. Shuningdek, u SNP mavjudligini ham aytadi. Shuningdek, u yig’ilgan RNK ifodasi ma’lumotlarini ko’rsatadi. Ekspressiya bo’limi loyiha tafsilotlari va ma’lum organlarda gen ifodasining grafik ma’lumotlari bilan RNKning to’qimalarni ifodalash ma’lumotlarini belgilaydi. Keyin u Bibliografiya ma’lumotlarini, turli sharoitlarda fenotiplar ma’lumotlarini, Variatsiyalar haqida ma’lumotni, yo’llar va PubChemni, ushbu gen mahsulotining o’zaro ta’siri haqida ma’lumotni, gen ontologiyasi ma’lumotlarini ta’minlaydigan umumiy gen ma’lumotlarini, homologiya ma’lumotlarini va markerlar ma’lumotlarini taqdim etadi. Protein haqida umumiy ma’lumot bo’limida XP raqamlari, EC raqamlari va uning nomlari mavjud. NCBI Reference Sequence bo’limi genomik hududlar haqida ma’lumot, mRNK va oqsillarning yangilangan ulanishlari, saqlangan domen ma’lumotlari va xulosalarini taqdim etadi. Keyin GRCh38 moslamasi genomik, mRNK va oqsil kontekstlarini aniqlash uchun ishlatiladi va oxirida u tegishli ketma-ketliklarni taqdim etadi. Eslatma: Genni uning Gen ID orqali izlash mumkin. Har bir gen o’ziga xos va noyob GENE ID-ga ega. Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi (NCBI) Milliy Sog’liqni saqlash instituti (NIH) filiali bo’lgan Amerika Qo’shma Shtatlari Milliy Tibbiyot Kutubxonasi (NLM) tarkibiga kiradi. Bu asosiy ma’lumotlar bazasi, birlamchi ma’lumotlar bazalari tabiatan arxivdir. Ular nukleotidlar ketma-ketligi, oqsillar ketma-ketligi yoki makromolekulyar tuzilish kabi eksperimental olingan ma’lumotlardan iborat. Eksperimental natijalar tadqiqotchilar tomonidan to’g’ridan-to’g’ri ma’lumotlar bazasiga yuboriladi. NCBI asosiy ma’lumotlar bazasi bo’lib, biotexnologiya va biomeditsinaga tegishli 32 ta kichik ma’lumotlar bazasini o’z ichiga oladi va bioinformatika vositalari va xizmatlari uchun muhim manba hisoblanadi. Har bir ma’lumotlar bazasi turli xil ma’lumotlarni o’z ichiga oladi. Ushbu video NCBI funksionalligi, NCBI ning 32 ta kichik ma’lumotlar bazasi va LCT geni bo’yicha ketma-ketlik tahlili haqida bosqichma-bosqich ma’lumotdan iborat. Qadamlar NCBI bosh sahifasida bizni qiziqtirgan ma’lumotlarni va qidirish uchun so’rovlar oynasini olishimiz mumkin bo’lgan turli pastki ma’lumotlar bazalari mavjud. Jami 32 ta kichik maʼlumotlar bazasi mavjud boʻlib, ular orasida Biokoleksiyonlar, Assambleya, Protein, Gen, Nukleotid, BioProject, OMIM, Kitoblar va turli maʼlumotlarga ega boʻlgan boshqa turli xil maʼlumotlar mavjud. So’rov maydoniga LCT, laktaza fermentini ishlab chiqaruvchi gen uchun kalit so’zni kiriting. Uni barcha maʼlumotlar bazalari orqali qidiring. Qidiruv natijasi barcha maʼlumotlar bazalarida LCT kalit soʻzining havolasini koʻrsatadi. Homo sapiens qidiruvning eng ehtimoliy qiziqishi sifatida tilga olinadi, NCBI natijalarni turli sub-ma’lumotlar bazasi toifalariga ajratadi. Turkumlar kitoblar, maqolalar, ilmiy maqolalarga ega boʻlgan adabiyotlar, ularda LCT tilga olingan, genni taʼminlovchi turli organizmlar, Geo DataSets Geo profili gen ekspresyon tahlili, HomologGene homologiya tahlili va PopSet organizmlar toʻplamida gen populyatsiyasi tahlili. Boshqa toifalar Proteomika uchun oqsillar, moddalar birikmalari va ularning xossalarini topish uchun kimyoviy moddalar, Genotip-fenotip munosabatlari uchun genetika, Genomik ma’lumotlar uchun genomlar. Gennom toifasidan turli organizmlardagi LCT genining jami 7856 ta referent nukleotidlar ketma-ketligini ko’rsatadigan Nukleotidlar ma’lumotlar bazasini bosing. Bu Homo sapiensning LCT geni sifatida eng ehtimoliy qidiruv qiziqishini ko’rsatadi va undan pastroqda birinchi sahifada LCT genining 7865 ta mos yozuvlar ketma-ketligidan 20 ta mos yozuvlar ketma-ketligi ro’yxati mavjud bo’lib, ular har bir sahifada 200 ta havolaga qadar kengaytirilishi mumkin. Xulosa
Foydalanilgan adabiyot va sayt havollari. https://uz.wikipedia.org/wiki/dnk https://t.me/dnk_03_15 https://t.me/dnk_03_15 https://t.me/dnk_03_15 http://najodshifo.uz/uz/ndc-medik-beruniy-obsledovaniye https://as-med.uz/uz/service/elektrokardiografiya-ekg/ Download 25.72 Kb. Do'stlaringiz bilan baham: 
|