Рабочая программа дисциплины базы данных и основные методы биоинформатики

Структурная аннотация биополимеров
(наименование дисциплины/практики)
Знания: основные термины и понятия биоинформатики, современные концепции биоинформатики; объекты изучения биоинформатики: последовательности аминокислот и нуклеиновых кислот; методы исследования биологических последовательностей, их описания и предсказания структуры: первичной, вторичной, супервторичной, доменной, глобулярной и четвертичной; технические и программные средства реализации информационных технологий; основы работы в локальных и глобальных сетях; особенности, возможности и ограничения специализированных баз данных и специфику работы с ними; типовые численные методы решения математических задач и алгоритмы их реализации.
Умения: ориентироваться в глобальных и локальных сетях, работать со специализированными серверами и различными базами данных; находить, анализировать, обобщать и систематизировать научные данные, полученные в ходе биологических, химических и физических экспериментов, для предсказания структуры биомакромолекул и ее аннотации; подбирать необходимые и оптимальные условия проведения научного анализа в зависимости от специфики поставленной задачи с применением методов биоинформатики; использовать стандартные и специализированные пакеты прикладных компьютерных программ для решения практических задач биоинформатики.
Навыки: навыками использования программных средств и работы в компьютерных сетях, использования ресурсов Интернета применительно к биологическим объектам; основными методами, способами и средствами получения, хранения, анализа и систематизации информации применительно к биологическим объектам; правилами расчетов оптимальных параметров проведения анализа, систематизации и интерпретации данных биологических объектов, и их корректирования и аннотации; методами проведения необходимых этапов статистического и сравнительного анализа, компьютерной обработки, диагностики, моделирования биологических последовательностей с целью предсказания их структуры.


Функциональная аннотация биополимеров
(наименование дисциплины/практики)
Знания: основные термины и понятия биоинформатики, современные концепции биоинформатики и ее применимость к структурной аннотации биополимеров; объекты изучения биоинформатики: последовательности аминокислот и нуклеиновых кислот; методы исследования биологических последовательностей, их описания и предсказания структуры; технические и программные средства реализации информационных технологий; основы работы в локальных и глобальных сетях; особенности, возможности и ограничения специализированных баз данных и специфику работы с ними; типовые численные методы решения математических задач и алгоритмы их реализации.
Умения: ориентироваться в глобальных и локальных сетях, работать со специализированными серверами и различными базами данных, содержащие информацию о функциональных особенностях биополимеров; находить, анализировать, обобщать и систематизировать научные данные, полученные в ходе биологических, химических и физических экспериментов, для предсказания функций биомакромалекул и их аннотации; подбирать необходимые и оптимальные условия проведения научного анализа в зависимости от специфики поставленной задачи с применением методов биоинформатики; использовать стандартные и специализированные пакеты прикладных компьютерных программ для предсказания функциональных особенностей биоплимеров.
Навыки: использование программных средств и работы в компьютерных сетях, использование ресурсов Интернета применительно к биологическим объектам для предсказания и аннотации их функций; основные методы, способы и средства получения, хранения, анализа и систематизации информации применительно к биологическим объектам и их функциональной аннотации; использование правил расчетов оптимальных параметров проведения анализа, систематизации и интерпретации данных биологических объектов, предсказание функциональных особенностей биомакромолекул, их аннотация и корректирования; методами проведения необходимых этапов статистического и сравнительного анализа, компьютерной обработки, диагностики, моделирования биологических последовательностей для предсказания их функций.