Soft wheat, Salinity, ssr markers, pcr, Phylogenetic family tree

DNA barcoding. After the PCR and genotyping phase of 
the study, barcoding based on cross-genetic polymorphism 
data of samples was performed in the Tec-IT Barcode Studio 

---

10 
Jumanov Г. T. et al.: Molecular Genetic Evaluation of Wheat Varieties Based on SSR Markers 
 
16.3 computer program [15,16]: 
1. Name of the variety -Antanina. Genetic passport: A
2
, B
4
, 
D
1
, E
2
, F
3
, I
2 
2. Name of the variety -Gazgan. Genetic passport: A
1
,
 
A
3
, 
B
3
, C
2
, D
1
, E
2
, F
2
, H
1
, H
2
, I
1 
3. Name of the variety -Zvezda. Genetic passport: A
3
, B
2
, 
C
2
, D
3
, E
2
, F
2
, G
2
, H
2
, I
2 
4. Name of the variety -Bobur. Genetic passport: A
1
, A
5
, B
1
, 
C
3
, D
3
, E
2
, F
2
, G
1
, H
2
, I
1 
5. Name of the variety -Dustlik. Genetic passport: A
3
, B
2
, 
C
2
, D
1
, D
3
, E
2
, F
2
, G
1
, G
2
, H
1
, H
2
, I
2 
6. Name of the variety -Turkiston. Genetic passport: A
3
, B
1
, 
C
2
, D
3
, E
2
, F
3
, G
1
, H
1
, H
2
, I
2 
7. Name of the variety -Grekum. Genetic passport: A
4
, B
1
, 
C
2
, D
2
, E
1
, F
2
, G
1
, H
1
, H
2
, I
2 
8. Name of the variety -Omad. Genetic passport: A
1
, A
4
, B
1
, 
C
2
, D
2
, E
1
, F
1
, G
1
, H
1
, H
2
, I
2 
9. Name of the variety -Bunyodkor. Genetic passport: A
1
, 
A
4
, B
1
, C
1
, D
1
, D
2
, E
2
, F
2
, G
1
, H
1
, H
2
, I
1 
10. Name of the variety -Agro27. Genetic passport: A
1
, A
4
, 
B
1
, C
2
, D
1
, D
2
, E
2
, F
1
, G
1
, H
1
, H
2
, I
2 
5. Conclusions 
Of the 10 SSR (Simple sequence repeat) markers 
associated with wheat salt resistance markers, 9 had genetic 
differences between the study materials. These identified 
polymorphic SSR markers will be used in further studies
for molecular mapping to identify genes responsible for 
resistance to salinization of winter wheat. Based on the 
obtained data of genetic polymorphism, a phylogenetic 
family tree of 10 varieties of wheat samples was compiled. 
According to phylogenetic analysis, the proximity of the 
varieties Zvezda, Babur, Gazgan and Turkestan to the variety 
Druzhba, resistant to salinization, among the selected wheat 
genotypes, indicates the common origin of these genotypes. 
 
REFERENCES 
[1] Huang XQ, Cöster H, Ganal MW, Röder MS (2003) 
Advanced backcross QTL analysis for the identification of 
quantitative trait loci alleles from wild relatives of wheat 
(Triticum aestivum L.). Theor Appl Genet 106:1379–1389. 
[2] Ražná K1, Ablakulova N, Žiarovská J, Kyseľ M, Cagáň
Ľ, Khojiboboevich KK and Bakievich GM, The Effect
of Seed-Priming by Cobalt-Diglycyrrhizinate on Wheat 
(Triticum Aestivum L.) Genome, Open Acces Journal of 
Agricultural Research ISSN: 2474-8846, pp. 3-4. 
[3] Katarína Ražná, Nodira Ablakulova, Jana Žiarovská, Matúš 
Kyseľ, Khabibjhan K. Kushiev, Maxmudjhan B. Gafurov & 
Ľudovít Cagáň, Molecular characterization of the effect of 
plant-based elicitor using microRNAs markers in wheat 
genome, Institute of Molecular Biology, Slovak Academy of 
Sciences, June 2020 Biologia 75(12), pp. 2-3. 
[4] W John Kress 1, David L Erickson DNA barcodes: methods 
and protocols Methods Mol Biol. 2012; 858: 3-8.
doi: 10.1007/978-1-61779-591-6_1. 
[5] Shneer VS. [DNA barcoding of animal and plant species as an 
approach for their molecular identification and describing of 
diversity].. Zh Obshch Biol. 2009. PMID: 19799325 Review. 
Russian. 
[6] A. Shahzad, M. Ahmad, M. Iqbal, Ahmed, and G.M. Ali. 
Evaluation of wheat landrace genotypes for salinity tolerance 
at vegetative stage by using morphological and molecular 
markers Article in Genetics and molecular research: 
GMR· March 2012 DOI: 10.4238/2012.March.19.2. 
[7] M Ghaedrahmati and et all Mapping QTLs Associated
with Salt Tolerance Related Traits in Seedling Stage of
Wheat (Triticum aestivumL) November 2014 Journal of 
Agricultural Science and Technology 16(6): 1413-1428. 
[8] J. J. Doyle and J. L. Doyle, “Isolation of Plant DNA from 
Fresh Tissue,” Focus, Vol. 12, No. 1, 1990, pp. 13-15. 
[9] William W. Wilfinger, Karol Mackey, and Piotr 
Chomczynski, Effect of pH and Ionic Strength on the 
Spectrophotometric Assessment of Nucleic Acid Purity: 
BioTechniques 22: 474-481 (March 1997). 
[10] Nei M, Li WH. Mathematical model for studying variation in 
terms of restriction endonucleases. Proc Natl Acad Sci. 1979; 
76: 5269–5273. doi: 10.1073/pnas.76.10.5269. [PMC free 
article] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 
[11] Botstein D, White R, Skolnick M, Davis R. Construction of a 
genetic linkage map in man using restriction fragment length 
polymorphisms. Am J Hum Genet. 1980; 32: 314–331. [PMC 
free article] [PubMed] [Google Scholar] 
[12] Nagy S, Poczai P, Cernák I, Gorji AM, Hegedűs G, Taller
J. PICcalc: an online program to calculate polymorphic 
information content for molecular genetic studies. Biochem 
Genet. 2012; 50(9–10): 670–672. doi:10.1007/s10528-012-9
509-1. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 
[13] Liu B H. Statistical genomics: linkage, mapping and QTL 
analysis. Boca Raton: CRC Press; 1997. [Google Scholar] 
[14] Jaccard P. Nouvelles research sur la distribution florare.
Bull De Lasociete Vaudoise Des Sciences Naturelles. 1908; 
44: 223–270. [Google Scholar] [Ref list] 
[15] W John Kress 1, David L Erickson DNA barcodes: methods 
and protocols Methods Mol Biol. 2012; 858: 3-8.
doi: 10.1007/978-1-61779-591-6_1. 
[16] Shneer VS. [DNA barcoding of animal and plant species as an 
approach for their molecular identification and describing of 
diversity]. Zh Obshch Biol. 2009. PMID: 19799325 Review. 
Russian. 
Copyright
©
2023
The Author(s).
Published
by
Scientific
&
Academic
Publishing 
This work is licensed under the Creative Commons Attribution International License (CC BY). http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/