„AFLP, amplified fragment length polymorphism“ Alternativa k RAPD na bázi DNA fingerprintingu nabízí metoda AFLP (česky polymorfismus délek amplifikovaných fragmentů) (Vos et al. 1995)Multilokusová analýza AFLP má mnohem vyšší schopnost rozlišení polymorfismu alel než metoda RFLP (Barker et al. 1999) a je velmi vhodnou technikou pro studium genetické variability na úrovni druhů či populací u široké škálu organismů (např. Liu et al. 1998, Wang et al. 2004, Uthicke et Conand 2005) možnost rychle vygenerovat velké množství polymorfních markerů i u druhů, o nichž nemáme jedinou předchozí genetickou informaciPrincip metody: technika AFLP kombinuje výhody osvědčeného principu PCR (polymerase chain reaction) a štěpení restrikční endonukleázou pro získání specifických selektovaných restrikčních fragmentů celkové DNA jakéhokoli jedince, tedy napříč genomem, za vysoké míry opakovatelnosti pokusu.„nevýhody“: dominantní marker s občas nejistým původem a homologií fragmentů, finančně dražší metoda, komplikovanější protokol
„AFLP, amplified fragment length polymorphism“ Využitívhodnost AFLP markerů při studiu hybridizace, introgrese, definice klonů, polyploidů, stanovení genotypu (vyšší variabilita oproti konzervativním alozymovým lokusům)určování paternity díky variabilitě a vysoké míře reprodukovatelnosti výsledkůsystematika, fylogeneze, fylogeografiepopulačně-genetické studie: vnitro- a mezipopulační variabilita, kvantifikace genového toku, podobnost/rozdílnost mezi populacemi AFLP protokol na: http://www.natur.cuni.cz/~muncling/praktGM.htm (Projekt FRVŠ 813/2008)
Do'stlaringiz bilan baham: |
