Biologiya fakulteti Biologiya (turlari bo‘yicha) ta’lim yo‘nalishi

Faol sun'iy metalloenzim. Asosiy vazifalardan biri noyob geometrik konfiguratsiyaga ega bo'lgan metall ionlarining klasterlari va markazlarini yaratishdir. Yana bir qiyinchilik - oqsillar interfeysida metallni bog'lash joyini loyihalash. Bundan tashqari, birlamchi koordinatsion sohadagi o'zgarishlarni kiritish funktsional faol metallofermentni hosil qilish uchun hech qachon etarli bo'lmagani kuzatildi. Metallofermentlarni qurish sof oqsil fermentlarini qurishdan ko'ra qiyinroq ekanligi isbotlangan sababi shundaki, sun'iy metallofermentni qurish polipeptidni qurishdan tashqari, turli xil yuqori darajadagi metall ionlarini tanlashni ham talab qiladi. o'zgaruvchan geometriyalar.
Qurollarni loyihalashni qiyinlashtiradigan ba'zi muammolarga (Lu va boshq. 2009):
1. Yangi metall kofaktorni bog'lash joyini yaratish yoki oqsil konjugatsiyasi hududida joylashgan mavjud metallni bog'lash joyini o'zgartirish. Metall ionlari bilan bog'langan cho'ntak bilan bog'liq bo'lgan oksidlanish-qaytarilish reaktsiyalarini konformatsion o'zgarishlar, zaryadning ajralishi yoki protonning o'tkazilishi bilan bog'lash juda qiyinligi kuzatildi.
2. Membranaga bog'langan oqsillarni qo'llash orqali metall ionlari uchun bog'lanish joylarini yaratish.
3. Qurolni loyihalash uchun metall shaperonlardan foydalanishni rad etish.
Metall ionlarini bog'laydigan joyni qurish uchun ko'pincha metall şaperonlar talab qilinganligi sababli, metall kofaktorning apoprotein bilan o'zaro ta'siri har doim ham funktsional faol APMlarni ishlab chiqish uchun etarli emasligi kuzatilgan va bunday hollarda funksionallik metall chaperonlar tomonidan ta'minlangan qo'shimcha o'zaro ta'sirlar bilan ta'minlanadi. . apoprotein kofaktori bilan birga metall kofaktor.
Nometallofermentlarga nisbatan APMni qurishning afzalligi shundaki, kofaktorni bog'lovchi cho'ntaklar xarakterli magnit xususiyatlarga ega va xromofor xarakterga ega bo'lib, APM ning spektroskopik xarakteristikasi imkonini beradi; shunday qilib, u dizayn protsedurasining samaradorligini oshiradi (Lu va boshq. 2009).
Shunday qilib, muammolarga qaramay, APM ning rivojlanishi kimyoviy transformatsiyalar katalizi uchun hali eshitilmagan yangi fermentlarni yaratish uchun katta istiqbolga ega. Ma'lum bo'lgan metallofermentlarning samaradorligini oshirish APMlarni qo'llashning yana bir istiqbolli sohasi bo'lsa-da, har qanday etuk, tasdiqlangan texnologiyaning yo'qligi bu sohada silikonda ham, laboratoriyada ham APMlarni ishlab chiqish uchun yaxshiroq vositalarni ishlab chiqish uchun ko'proq izlanishlarni talab qiladi. kerakli funksionallik..