Biologiya fakulteti mustaqil ish

Tuzilishi va bog'lanishi

 

Fe-O ning molekulyar orbital tavsifi₂ miyoglobin tarkibidagi o'zaro ta'sir.
Miyoglobin quyidagilarga tegishli globin oqsillarning superfamiliyasi va boshqa globuslarda bo'lgani kabi, sakkiztadan iborat alfa spirallari ilmoqlar bilan bog'langan. Miyoglobin tarkibida 154 ta aminokislotalar mavjud.
Miyoglobin tarkibida a porfirin markazida temir bilan uzuk. A proksimal histidin guruh (His-93) to'g'ridan-to'g'ri temirga biriktirilgan va a distal gistidin guruhi (His-64) qarama-qarshi yuzga yaqinlashadi. Distal imidazol temir bilan bog'lanmagan, ammo O substrat bilan ta'sir o'tkazish uchun mavjud₂. Ushbu o'zaro ta'sir O ning bog'lanishini rag'batlantiradi₂, ammo uglerod oksidi (CO) emas, u hali ham O ga qaraganda 240 × kuchliroq bog'lanadi₂.
O ning bog'lanishi₂ Fe markazida sezilarli tarkibiy o'zgarishlarni keltirib chiqaradi, bu radiusda qisqaradi va N4 cho'ntagining markaziga o'tadi. O₂-bog'lanish "spin-juftlikni" keltirib chiqaradi: besh koordinatali temirli deoksi shakli yuqori aylanish va oltita koordinatali oksi shakli past spin va diamagnetik.

Bu kislorodli mioglobin molekulasining tasviridir. Rasmda kislorod gem protez guruhining temir atomiga bog'langanida strukturaviy o'zgarish ko'rsatilgan. Kislorod atomlari yashil rangga, temir atomi qizil rangga va gem guruhi ko'k rangga bo'yalgan.

Sintetik analoglar

  Miyoglobinning ko'plab modellari keng qiziqishning bir qismi sifatida sintez qilingan o'tish metall dioksigen komplekslari. Taniqli misol porfirin piketi, ning steroid jihatdan katta hosilasining temir kompleksidan iborat tetrafenilporfirin.^[29] An huzurida imidazol ligand, bu temirli kompleks O ni qaytarib bog'laydi₂. O₂ substrat temir markazining oltinchi pozitsiyasini egallab, egilgan geometriyani qabul qiladi. Ushbu modelning asosiy xususiyati m-okso dimerining sekin shakllanishi bo'lib, u faol bo'lmagan diferrik holatdir. Tabiatda bunday deaktivatsiya yo'llari Fe-porfirin birikmalarining yaqinlashishiga to'sqinlik qiladigan oqsil matritsasi bilan bostiriladi.^[30]

Metilimidazol (yashil) va eksenel koordinatsiya joylari joylashgan Fe ning piket-panfirin kompleksi dioksigen. R guruhlari O₂- bog'laydigan sayt.