Fermentativ faollik

• to'g'ri uchinchi darajali tuzilmani shakllantirishga yordam beradigan oqsil zanjiri polipeptidining yordamchi qismini olib tashlash (proinsulindagi C-peptid);

• ferment prekursorlarini faollashtirish (hazm qilish fermentlari, qon ivish proteazlari);

• oqsilning lokalizatsiyasini o'zgartirish (ayrim sitoplazmatik oqsillar cheklangan proteolizdan so'ng yadroga o'tadi: SREBP, NF-kB, YB-1);

• prekursor oqsilidan fiziologik faol oligopeptidlarni olish (endorfin, adrenokortikotrop gormon, a- va g-melanotsitlarni ogohlantiruvchi gormonlar va boshqa fiziologik faol peptidlar hosil bo'lishi bilan proopiomelanokortinning parchalanishi);

• oqsil domenlari orasidagi ko'prikni kesish, bunda domenlar odatda bir-biri bilan aloqada bo'lib qoladi (difteriya toksinining pishishi, HCF-1 hujayra proliferatsiyasi omilining shakllanishi;

• poliproteinlardagi oqsil globullarini ajratish uchun (bu viruslar uchun xosdir);

• bir nechta oqsil izoformlarini olish (Stat5 va Stat6 oqsillarining cheklangan proteolizi ularning transkripsiyani faollashtiruvchi domenlari bo'lmagan izoformalarining shakllanishiga olib keladi).

Proteolitik fermentlar

Proteolitik fermentlar

Oqsillarning erkin aminokislotalarga to'liq parchalanishi uchun turli xil o'ziga xosliklarga ega bo'lgan bir nechta fermentlar kerak bo'ladi. Proteinazalar va peptidazalar nafaqat oshqozon-ichak traktida, balki hujayralarda ham mavjud. Substrat molekulasining hujum joyiga ko'ra proteolitik fermentlar endopeptidaza va ekzopeptidazalarga bo'linadi. Endopeptidazalar yoki proteinazlar peptid zanjiridagi peptid bog'lanishini ajratadilar. Ular substratlarning qisqa peptid ketma-ketligini "tanadi" va bog'laydi va ma'lum aminokislotalar qoldiqlari orasidagi bog'larni nisbatan maxsus gidrolizlaydi. Proteinazalar reaksiya mexanizmiga ko'ra tasniflanadi. Serin proteinazalar (B sxemasi) faol markazda ushbu fermentlarning katalitik ta'siri uchun muhim bo'lgan serin qoldig'ini o'z ichiga oladi; sistein oqsillarida bu sistein qoldig'i va boshqalar. Ekzopeptidazalar zanjirning oxiridan peptidlarni gidrolizlaydi: aminopeptidazalar - N uchidan, karboksipeptidazalar - C-uchidan. Nihoyat, dipeptidazalar faqat dipeptidlarni parchalaydi.