Filogenetik daraxt qanday quriladi? (Upgma usuli)

Filogenetik daraxt anatomiyasi

Filogenetik daraxtlarda biz quyidagi qismlarni ajratishimiz mumkin - botanika o'xshashligini davom ettirish:
ad
Filiallar: Daraxtning chiziqlari "novdalar" deb nomlanadi va ular vaqt o'tishi bilan o'rganilayotgan populyatsiyalarni ifodalaydi. Daraxt turiga qarab (pastga qarang), novdaning uzunligi ma'noga ega bo'lishi yoki bo'lmasligi mumkin.
Filiallarning uchlarida biz baholamoqchi bo'lgan organizmlarni topamiz. Ular hozirgi paytda mavjud bo'lgan yoki yo'q bo'lib ketgan mavjudotlar bo'lishi mumkin. Turlar bizning daraxtimizning barglari bo'ladi.
Ildiz: ildiz daraxtning eng qadimiy shoxidir. Ba'zilarida bu bor va ularni ildiz otgan daraxtlar deyishadi, boshqalari esa yo'q.
Tugunlar: ikki yoki undan ortiq nasldagi shoxlarning tarmoqlanish nuqtalari tugun deb ataladi. Nuqta avlod guruhlarining eng so'nggi umumiy ajdodini ifodalaydi (bu ajdodlar taxminiy ekanligiga e'tibor bering).
Tugunning mavjudligi spetsifikatsiya hodisasini - yangi turlarni yaratishni nazarda tutadi. Shundan so'ng, har bir tur o'z evolyutsiyasini kuzatib boradi.

Qo'shimcha terminologiya

Filogenetik daraxtlar haqida gap ketganda, ushbu uchta asosiy tushunchalardan tashqari, boshqa zarur atamalar mavjud:
Politomiya: filogenetik daraxt tugunida ikkitadan ortiq shoxga ega bo'lganda, polotomiya borligi aytiladi. Bunday holatlarda filogenetik daraxt to'liq echilmagan, chunki ular bilan bog'liq bo'lgan organizmlar o'rtasidagi munosabatlar aniq emas. Bu odatda ma'lumotlarning etishmasligidan kelib chiqadi va faqat tadqiqotchi ko'proq to'planganda tuzatilishi mumkin.
Tashqi guruh: filogenetik mavzularda tashqi guruh tushunchasini eshitish odatiy holdir - deyiladi tashqi guruh. Ushbu guruh daraxtni ildiz otishi uchun tanlangan. U ilgari o'quv guruhidan ajralib chiqqan takson sifatida tanlanishi kerak. Masalan, men echinodermalarni o'rgansam, foydalanishingiz mumkin tashqi guruh dengiz shovqinlari.