Mouse Genome Database bioinformatsion ma’lumotlar bazasi umumiy interfeysining ko’rinishi AceDB – bu ma’lumotlar bazasining tarkibida turli organizmlarning genetik xaritalari, lokuslar va allellar, gen mahsulotlari, DNK va oqsillarning ketma – ketliklari, genom klonlari va genlarning ekspressiyalanishiga oid bo’lgan ma’lumotlar mavjud. - PDG - Plant Genome Databases- ma’lumotlar bazasi qishloq xo’jaligida yetishtiradigan asosiy o’simliklarning genomlari haqidagi ma’lumotlarni saqlaydi. Shuningdek baza tarkibida bu genom ketma – ketliklarini taqqoslanishini amalga oshiruvchi bioinformatsion dastur vositalari va ba’zi o’simliklarning aynan o’z genomiga tegishli bo’lgan ma’lumotlarnigina saqlovchi kichik tipdagi ma’lumotlar bazalari ham o’rin olgan
Plant Genome Databases bioinformatsion ma’lumotlar bazasi umumiy interfeysining ko’rinishi Genomlarni shajaraviy solishtirishi uchun filogenetik daraxtlarni tuzish tartibi - Evolyutsion daraxt – kelib chiqishi umumiy bo’lgan turli ko’rinishdagi organizmlarning orasidagi o’zaro bog’liqlikni tasvirlovchi hayot daraxtidir.
- Filogenetik daraxtning yuqori qismi uchta sinfga bo’linadi: barglar, tugun va ildiz (maksimum bitta). Barglar bu oxirgi uchlar hisoblanadi va har bir barg tirik organizmlarning ma’lum bir ko’rinishini ifodalaydi.Har bir tugun evolyutsion ma’noga ega bo’lib, ajdodlarning ikki va undan ortiq avlodlarga bo’linishini va ularning alohida evolyutsiya yo’liga ega ekanligini ko’rsatadi. Ildiz barcha qarab chiqilayotgan ob’ektlarning umumiy ajdodga tegishli ekanligini ko’rsatadi.
“Daraxt” g’oyasi oddiy tuzilishdagi organizmlardan murakkab organizmlarning kelib chiqishini tushuntirish maqsadida dastlab paydo bo’lgan. Zamonaviy evolyutsion biologlar filogenetik daraxtlardan turlarning kelib chiqishini va ularning rivojlanishini ko’rsatib berish maqsadida foydalanishadi. - “Daraxt” g’oyasi oddiy tuzilishdagi organizmlardan murakkab organizmlarning kelib chiqishini tushuntirish maqsadida dastlab paydo bo’lgan. Zamonaviy evolyutsion biologlar filogenetik daraxtlardan turlarning kelib chiqishini va ularning rivojlanishini ko’rsatib berish maqsadida foydalanishadi.
- Shoxlangan daraxt – bu umumiy shoxlanish nuqtasi ildizga ega bo’lgan daraxt hisoblanadi. Shoxlangan daraxtni ma’lum yo’nalishga ega deyish mumkin, chunki tabiiy yo’nalishda ya’ni ildizdan barglar tomonga shoxlangan bo’ladi. Shoxlangan daraxtning har bir tuguni oldingi ajdodlarning umumiyligini ta’riflaydi. – rasmda tirik organizmlarning umumiy uchta domen bo’yicha shoxlangan filogenetik daraxtini ifodalaydi. Shoxlanmagan daraxt ildizga ega bo’lmaydi va barglarning bog’lanish nuqtalarini ifodalamaydi. Shoxlangan yoki shoxlanmagan ko’rinishdagi filogenetik daraxtlar bifurkatsion yoki nobifurkatsion tarzda bo’lishi mumkin.
Do'stlaringiz bilan baham: |