Mundarija kirish Zamonaviy bioinformatsiya ma'lumotlari asoslari Bioinformatikaning kompyuter komponentlari Bioinformatikaning internet komponentlari Tarmoqlar va asoslar Xulosa Foydalanilgan adabiyotlar 2 kirish mavzuning dolzarbligi

Kurs ishi bo’yicha tadqiqot obyekti va predmeti ; 
Dasturiy ta’minot, kompyuter, genomika, tibbiyot,tarmoqlar. 
 
I BOB ZAMONAVIY BIOINFORMATSIYA 
MA'LUMOTLARI ASOSLARI 
1.1 Bioinformatikaning kompyuter komponentlari. 
Bugungi kunda axborot va kompyuter komponentlari 
biotexnologiyaning ajralmas qismi hisoblanadi. Hajmi va 
murakkabligi doimiy ravishda o'sib borayotgan biologik 
ma'lumotlarni boshqarish uchun kompyuterlar kerak. Xalqaro 
Internetning paydo bo'lishi aloqa olamida inqilob qildi. World 
Wide Web (WWW, "World Wide Web") ning yaratilishi 

---

4 
Internetning 
muvaffaqiyatli 
amalga 
oshirilishi 
va 
rivojlanishiga yordam berdi. Internet global supermagistral 
bo'lib, foydalanuvchi larga WWW doirasida erkin harakat 
qilish imkonini beradi - heterojen axborot resurslarining eng 
katta to'plami. 
Kompyuter - bu ikkilik hisoblash rejimida axborotni 
saqlash va qayta ishlash uchun ishlatiladigan elektron 
kompyuter. 
Bioinformatikaning paydo bo'lishi apparat dizayni va 
dasturiy ta'minotni ishlab chiqishdagi yutuqlarsiz mumkin 
emas edi. Ma'lumotni saqlash uchun sizga yuqori tezlik va 
yuqori sig'imga ega bo'lgan ommaviy axborot vositalari kerak. 
Axborotni tanlash va tahlil qilish maxsus dasturlarni talab 
qiladi. 
texnik vositalari bu jismoniy qurilmalar: protsessor, disk 
drayvlar va displey. 
Dasturiy ta'minot - bu kompyuterlarda ishlash uchun 
mo'ljallangan turli xil dasturlar to'plamining umumiy atamasi. 
Dasturiy ta'minot ikki toifaga bo'linadi: tizimli dasturiy 
ta'minot va amaliy dasturiy ta'minot. 

---

5 
Tizimli dasturiy ta'minot kompyuterning operatsion 
tizimini va ilovalarni ishga tushirish uchun zarur bo'lgan 
boshqa dasturlarni o'z ichiga oladi, amaliy dasturiy ta'minot 
esa muayyan vazifalarni bajarish uchun foydalanuvchi 
tomonidan o'rnatiladi. 
Kompyuter dasturlari turli dasturlash tillarida: mashina 
kodida, assemblerlarda yoki yuqori darajali tillarda yoziladi. 
Assembly yoki yuqori darajali tilda yozilgan dasturlar montaj 
va kompilyatsiya orqali mashina kodiga aylantirilishi kerak. 
Windows 
operatsion 
tizimida 
mahalliy 
fayllar 
bajariladigan fayllar, Unix tizimidagi mos fayllar esa 
bajariladigan tasvirlar deb ataladi. Bunday fayllar bevosita 
kompyuter protsessori tomonidan bajariladi. 
Skriptlar - bu dastur tomonidan bajariladigan fayllar. Ular 
Microsoft Visual Basic, Java Script va PERL kabi skript 
tillarida yozilgan. 
Bioinformatikaga o'z yo'lini topgan turli xil dasturlash, 
skript va belgilash tillari mavjud. 
HTML (HyperText Markup Language - gipermatnni 
belgilash tili) - gipermatnli hujjatning ko'rinishini o'rnatish, 

---

6 
shu jumladan giperhavolalar o'rnini aniqlash uchun 
mo'ljallangan. Shuni ta'kidlash kerakki, HTML dasturlash tili 
emas. 
Java skripti mashhur skript tili boʻlib, u qalqib chiquvchi 
oynalar, animatsiyalar va sichqonchani ustiga olib kelinganda 
koʻrinishini oʻzgartiruvchi obʼyektlar kabi elementlarni veb-
sahifalarga kiritish imkonini berish orqali gipermatnli 
hujjatning funksiyalarini kengaytiradi. 
Java turli xil apparat platformalarida ishlaydigan 
ilovalarni yaratish uchun umumiy maqsadli va mashinadan 
mustaqil dasturlash tilidir. Java manba kodi "C++". Java Java 
Script-dan farq qiladi. Java appletlari gipermatnli hujjatlarga 
kiritilgan. 
XML (extensible Markup Language - kengaytiriladigan 
belgilash tili) - fayllarni ulardagi ma'lumotlar turi bo'yicha 
tavsiflash imkonini beradi. 
1998 yilda Guido van Rossum tomonidan yozilgan, 
obyektga yo'naltirilgan, talqin qilinadigan, portativ, o'ta yuqori 
darajadagi skript tili . Phytonda dasturlash kerakli dasturiy 
modullarni tez va samarali olish imkonini beradi. Python 

---

7 
tarjimoni Unix, Windows, Linux, RiscOS, MAC, Sun kabi 
istalgan platformaga ko'chirilishi mumkin. Phyton-da kod 
yozishda, 
ushbu 
tizim 
uchun 
maxsus 
modullardan 
foydalanishdan 
tashqari, 
yakuniy 
platforma 
haqida 
qayg'urishingiz shart emas. Shunday qilib, Phyton Java-ga 
raqobatchi bo'lib, operatsion tizim resurslariga kirish 
vositalarini birlashtirgan holda qulay portativlikni ta'minlaydi. 
Phyton foydalanuvchining grafik interfeysini tez va oson 
yaratish vositalarini, strukturaviy biologiyada qoʻllaniladigan 
funksiyalar kutubxonasini va raqamli usullarning keng 
kutubxonasini oʻz ichiga oladi. Phyton-ni uning bosh 
sahifasidan yuklab olish mumkin: http://python.org. 
PERL (Practical Extraction and Reporting Language ) 
umumiy maqsadli 
skript 
tili boʻlib, ketma-ketlik 
maʼlumotlarini tahlil qilishda keng qoʻllaniladi. PERL Sed, 
Awk, Unix shell va C tillari asosida Larri Uoll tomonidan 
ixtiro qilingan . PERL oddiy belgilar birikmalarini mukammal 
moslashtirish imkonini beradi, moslashuvchan sintaksis yoki 
grammatikaga ega va turli operatsiyalarni dasturlash uchun 
nisbatan kam sonli kodlarni talab qiladi. Bu satrlarni qayta 

---

8 
ishlash uchun yaxshi, ya'ni ketma-ketlikni tahlil qilish va 
ma'lumotlar bazasini boshqarishda bajariladigan asosiy 
harakatlar. Ushbu til kompyuter xotirasini taqsimlashni 
nazorat qiladi va optimallashtiradi, shuningdek, Unix-da 
ishlaydigan kompyuter tizimlari bilan yaxshi mos keladi. U 
bepul nusxa ko'chirish, kompilyatsiya qilish va chop etish 
uchun onlayn mavjud. PERL-ni o'zining bosh sahifasidan 
yuklab olish mumkin: http://www.perl.org. 
PERL va Phyton tillari bioinformatika uchun ilovalar 
yaratish uchun eng mos keladi, asosan ularning samaradorligi 
va ushbu sohaning turli funktsional talablarini qondirish 
qobiliyati. BSML (Bioinformatika Sequence Marku