Mundarija kirish Zamonaviy bioinformatsiya ma'lumotlari asoslari Bioinformatikaning kompyuter komponentlari Bioinformatikaning internet komponentlari Tarmoqlar va asoslar Xulosa Foydalanilgan adabiyotlar 2 kirish mavzuning dolzarbligi
Download 187.1 Kb. Pdf ko'rish
|
Zamonaviy bioinformatsiya ma\'lumotlari asoslari
|
bo'linadi va ular belgilangan joyga etib borgach,
birlashtiriladi. Lekin paketlar to'g'ridan-to'g'ri bir mashinadan boshqasiga yuborilishi shart emas; ular yakuniy qabul qiluvchiga yo'lda bir nechta kompyuterlardan o'tishlari 12 mumkin. Agar tanlangan marshrutning oraliq tugunlaridan birortasi ishlamasa, tarmoq protokollari turli yo'nalishlarning o'zaro kesishishi tufayli mumkin bo'lgan muqobil yo'l qidirish funktsiyasini ta'minlaydi. Internet dasturiy ta'minotni tarqatish va tadqiqotchilarga uzoq serverlarda murakkab tahlillarni o'tkazish imkonini beradi. 1980-yillarning oxirigacha. Internet orqali ma'lumotlar bazalariga kirishning uchta asosiy usuli mavjud : 1) elektron pochta serverlari; 2) FTP 3) telnet serveri. Elektron pochta serveri matnli xabarlarni bir kompyuterdan ikkinchisiga yuborish vositasidir. FTP (File Transfer Protocol) - bu kompyuter fayllarini masofaviy kompyuterlar o'rtasida uzatish protokoli. TELNET - bu tarmoq protokoli bo'lib, operatorga masofaviy kompyuterlarga ulanish va ularda xuddi shu mashinalarga jismoniy kirish imkoni bo'lgandek ishlash imkonini beradi. Elektron pochta serverlari olimlarga pochta serveri manziliga elektron pochta so'rovini yuborish orqali 13 ma'lumot almashish imkonini berdi. Ertami-kechmi, so'rov server tomonidan ko'rib chiqildi va natija jo'natuvchining pochta qutisiga yuborildi. Biroq, bunday tizimning kamchiliklari bor edi - so'rovlar noto'g'ri, xatolar bilan ishlangan va javobni cheksiz uzoq kutish kerak edi. FTP tadqiqotchiga to'liq ma'lumotlar bazasini yuklab olish va o'z kompyuterida qidirish imkonini berdi. Ma'lumotlar bazalariga kirishning bu usuli ham o'zining kamchiligiga ega - tadqiqotchi har bir yangilashdan keyin foydalanadigan barcha ma'lumotlar bazalarini vaqti-vaqti bilan yuklab olishi kerak. TELNET foydalanuvchiga masofaviy kompyuterga ulanish va uning dasturiy va apparat resurslariga kirish imkonini beradi. Bu usul vaqti-vaqti bilan so'rovlar uchun foydalidir. Uning kamchiliklari foydalanuvchi autentifikatsiyasini murakkab boshqarish va ortiqcha yuklashni o'z ichiga oladi masofaviy kompyuterning hisoblash quvvati. Kompyuterlar bir-biriga tarmoq orqali ulangandan so'ng, xabarlar va fayllar aniq manzilga yuborilishi uchun alohida kompyuterlarni aniqlashning aniq usulini topish kerak bo'ldi. 14 Tugunlar orasidagi aloqani osonlashtirish uchun Internetdagi har bir kompyuterga noyob identifikatsiya raqami (uning IP- manzili, internet protokoli manzili) beriladi. IP-manzil noyobdir va faqat bitta kompyuterni ifodalaydi. U nuqta bilan ajratilgan arab raqamlarida yozilgan. Misol uchun, AQSh hukumati qoshidagi Milliy Sog'liqni saqlash instituti ( NIH) qoshidagi Milliy Tibbiyot kutubxonasi ( NLM) qoshidagi Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi ( NCBI) kompyuteri quyidagi IP manzilga ega : 130.14 .29.110. Bu raqamlar ma'lum bir kompyuterni, ushbu kompyuter joylashgan xostni va ushbu xost tegishli bo'lgan domenni (va subdomenni) ifodalaydi. Bu raqamlar kompyuterlarga ma'lumotlarni uzatish yo'nalishini aniqlashga yordam beradi. Bundan tashqari, raqamli IP-manzillarni matn nomlari bilan taqqoslaydigan muqobil ierarxik domen nomlari tizimi yaratildi, shunda Internet manzillari tushunarliroq shaklda yozilishi mumkin. Misol uchun, "ncbi.nlm.nih.gov" yozuvi yuqoridagi raqamlarga ekvivalent bo'lib, "Milliy tibbiyot kutubxonasi" (nlm) ostidagi "Milliy biotexnologiya ma'lumotlar markazi" (ncbi) tugunini anglatadi. AQSh 15 hukumati (gov) huzuridagi Sog'liqni saqlash institutlari" (nih). Raqamli IP manzillar va matn nomlari o'rtasidagi yozishmalarni, shuningdek IP manzil yoki Internet xostning geografik joylashuvini quyidagi manzilda aniqlashingiz mumkin: http://smart-ip.net/tools/geoip. Butunjahon Internet tarmog'i Internetda tarqalgan ma'lumotlar bazalarini samarali integratsiyalash orqali o'zaro bog'lanish imkoniyatini sezilarli darajada kengaytirdi va shu bilan mahalliy kompyuterlarda ma'lumotlar bazalarining bir nechta nusxalarini yuklab olish va saqlash zaruriyatini yo'q qildi. Buning yordamida tadqiqotchi oxirgi ko'rilgan yozuvga qaytish imkoniyati bilan faol gipermatnli o'zaro havolalar yordamida ma'lumotlar bazasi yozuvlarini osongina ko'rishi mumkin. ExPASy (Expert Protein Analysis System - Expert Protein Analysis System, http://www.expasy.org/) - molekulyar biologiya bo'yicha birinchi veb-server 1993 yilda Jeneva universiteti klinikasi va Jeneva universitetining o'zi tomonidan birgalikda yaratilgan. 16 Veb-sahifalar - World Wide Web tarmog'ida kezganimizda brauzer oynasida paydo bo'ladigan hujjatlar. Brauzer tomonidan ko'rsatiladigan har bir veb-hujjat veb- sahifa deb ataladi va berilgan serverning veb-sahifalari to'plami umumiy holda veb-sayt deb ataladi. Veb-sahifalar mazmuni boʻyicha oddiy matnli hujjatlarga oʻxshash, faqat ular ancha moslashuvchan, chunki ular tarmoq ichida joylashgan boshqa sahifalar va fayllarga havolalarni oʻz ichiga olishi mumkin. Veb-sayt - bu bir xil kompyuterda joylashgan o'zaro bog'liq veb-sahifalar to'plami. Internetdagi har bir veb-saytga o'ziga xos manzil beriladi. Veb-sahifalarning eng diqqatga sazovor xususiyati havolalar mavjudligidir. Veb-sahifadagi havola (giperhavola) foydalanuvchiga xuddi shu veb-saytdagi boshqa sahifaga yoki hatto dunyoning istalgan nuqtasidagi boshqa veb-sayt sahifasiga o'tish imkonini beradi. Download 187.1 Kb. Do'stlaringiz bilan baham: 
|