Oqsil strukturalarini oldindan aytish va oqsil muhandisligi

A derivatizatsiya N- bilan terminali tugatish Sanger reaktivi (DNFB), B dinitrofenil peptidning umumiy kislota gidrolizi
Qaysi aminokislota hosil bo'lishini aniqlash N-terminus a peptid zanjir ikki sababga ko'ra foydalidir: peptid bo'laklari ketma-ketligini butun zanjirga tartiblashda yordam berish va birinchi tur Edman degradatsiyasi ko'pincha iflosliklar bilan ifloslangan va shuning uchun aniq aniqlik bermaydi N-terminal aminokislota. Uchun umumlashtirilgan usul N- aminokislota terminali tahlili quyidagicha:
Peptidni terminal aminokislotani tanlab belgilaydigan reaktiv bilan reaksiyaga kiriting.
Oqsilni gidroliz qiling.
Aminokislotani xromatografiya va standartlar bilan taqqoslash orqali aniqlang.
Terminal aminokislotalarni belgilash uchun ishlatilishi mumkin bo'lgan juda ko'p turli xil reagentlar mavjud. Ularning barchasi omin guruhlari bilan reaksiyaga kirishadi va shu sababli lizin kabi aminokislotalarning yon zanjiridagi amin guruhlari bilan ham bog'lanadi - shu sababli to'g'ri joy tanlanganligini ta'minlash uchun xromatogrammalarni izohlashda ehtiyot bo'lish zarur. Eng keng tarqalgan reaktivlardan ikkitasi Sanger reaktivi (1-ftor-2,4-dinitrobenzol) va kabi dansil hosilalari dansil xlorid. Fenilizotiyosiyanat, Edman degradatsiyasi uchun reaktivdan ham foydalanish mumkin. Xuddi shu savollar aminokislota tarkibini aniqlashda bo'lgani kabi amal qiladi, faqat dog 'kerak emas, chunki reaktivlar rangli hosilalarni hosil qiladi va faqat sifatli tahlil talab qilinadi. Shunday qilib, aminokislota faqat standart bilan taqqoslaganda, xromatografiya kolonkasidan chiqarilishi shart emas. Shuni ham hisobga olish kerakki, har qanday omin guruhlari markalash reagenti bilan reaksiyaga kirishganligi sababli, ion almashinadigan xromatografiyadan foydalanish mumkin emas va yupqa qatlamli xromatografiya yoki yuqoribosimli suyuqlik xromatografiyasi o'rniga ishlatilishi kerak.