Oqsillarni identifikatsiyalash resursi (Protein Identification Resource,pir) Reja Kirish Asosiy qism. I-bob Oqsillarni identifikatsiyalash resursi

PIR World Wide Web (WWW) sayti: PIR WWW sayti PIR loyihasi tomonidan yaratilgan ma'lumotlarga to'liq kirishni ta'minlaydi, jumladan: (i) loyiha tavsifi, (ii) ma'lumotlar bazalariga qidirish va qidirish uchun kirish vositalari, (iii) anonim FTP, (iv) ma'lumotlarni yuborish uchun vositalar. ma'lumotlar, (v) umumiy e'lonlar va (vi) xodimlar bilan bog'lanish ma'lumotlari.Qidiruv va izlash vositalari PIR-International Protein Sequence Database va NRL_3D ( 8 ) va ketma-ketlikni moslashtirish ma'lumotlar bazasi ( 8 ) kabi boshqa PIR ma'lumotlar bazalarining haftalik yangilanishlariga kirishni ta'minlaydi . Ushbu ob'ektlar to'rtta xizmatga guruhlangan: (i) kirish so'rovi xizmati, (ii) matn qidirish xizmati, (iii) tanlash ro'yxati xizmati va (iv) ketma-ket qidiruv so'rovi xizmati.
Kirish so'rovi xizmati 1-jadvalda ko'rsatilgan ob'ekt identifikatorlaridan istalgani tomonidan yozuvni to'g'ridan-to'g'ri qidirish uchun imkoniyat yaratadi . Misol uchun, belgilangan PIR mos yozuvlar raqamini (yoki MUID) o'z ichiga olgan barcha PIR yozuvlari tanlanishi yoki ma'lum bir Haemophilus influenzaega mos keladigan yozuvni tanlash mumkin.kodlash hududi TIGR noyob ID tomonidan tanlanishi mumkin.
Ushbu xizmat shuningdek, gipermatnni ulash nuqtasi bo'lib xizmat qiladi; tashqi serverlar ushbu identifikatorlarning har biri orqali ma'lum PIR yozuvlariga ulanishi mumkin (batafsilroq ma'lumot uchun PIR xodimlari bilan bog'laning). Matnni qidirish xizmati Sarlavha, Turlar, Muallif, Nashr, Kalit so'zlar, Superfamily va Gen nomi kabi maydonlarning pastki qator so'rovlari bo'yicha Mantiqiy VA operatsiyalari asosida kirishni qidirishga imkon beradi. Tanlash roʻyxati xizmati Turlar, Kalit soʻzlar, Superfamily yoki Gen nomi maydonlaridan standartlashtirilgan roʻyxatlarda keltirilgan atamalarni tanlash orqali muqobil qidiruv mexanizmini taqdim etadi. Ketma-ket qidirish so'rovi xizmati tanlangan ma'lumotlar bazasi yozuvlaridan ketma-ketliklarni BLAST ketma-ketlik so'rovlari sifatida avtomatik ravishda paketlaydi va qidiruvni NCBI BLAST serveriga yuboradi ( 23 ).
Tanlangandan so'ng, HTML formatidagi yozuvlar, jumladan tashqi WWW-serverlarga to'liq gipermatnli havolalar ko'rsatiladi. Ma'lumotlar bazasi teglari ( 1-jadval ) ma'lum WWW-serverlarni aniqlaydigan mantiqiy nomlar sifatida qaraladi. O'zaro havolalar umumiy mexanizm orqali yoqiladi, bunda yangi havolalar sinflari qo'shilishi va mantiqiy nomlar jadvalidagi o'zgarishlar orqali maqsadli WWW serverlari qo'shilishi yoki qayta aniqlanishi mumkin. BLAST qidiruv so'rovining ketma-ketligi to'g'ridan-to'g'ri kirish ekranidan chaqirilishi mumkin.Anonim FTP xizmatlarini nbrf.georgetown.edu saytidan olish mumkin. Xost mashinasi VAX/VMS katalog tuzilishini taniydi. PIR anonim FTP fayllari DISK$BIG1 katalogida joylashgan:[ANONYMOUS.PIR]. 000README. Ushbu katalogdagi fayl katalog tarkibini va saytdan mavjud ma'lumotlarni tavsiflaydi.