Oqsillarni identifikatsiyalash resursi (Protein Identification Resource,pir) Reja Kirish Asosiy qism. I-bob Oqsillarni identifikatsiyalash resursi

I-Bob Oqsillarni identifikatsiyalash resursi (Protein Identification Resource,PIR)
1.1. Oqsillarni identifikatsiyalash resursi.
Protein axborot resursi (PIR) 1960-yillarning boshlarida marhum Margaret O. Dayhoff ( 1-3 ) tomonidan tashkil etilgan Proteinlar ketma-ketligi va tuzilishi atlasidan kelib chiqqan. Oqsillarning o'zaro bog'liqligi va evolyutsiyasi bo'yicha tadqiqotlarni qo'llab-quvvatlash uchun mo'ljallangan ma'lumotlar to'plami sifatida kelib chiqishidan boshlab, resurs statik kutubxona sifatida emas, balki tadqiqotni qo'llab-quvvatlash vositasi sifatida ishlab chiqilgan. Demak, ma'lumotlar tahlil qilinadi, ko'rib chiqiladi va biologik bilimlarning dinamik ko'rinishini ifodalash uchun qayta tuziladi. PIR taqdim etilgan va chop etilgan ma'lumotlarni asl ko'rinishida saqlagan bo'lsa-da, PIRning vazifasi saqlangan ma'lumotlar arxivini taqdim etish emas; aksincha, PIR biologik tushunchalarni ifodalovchi shakldagi ketma-ketlik ma'lumotlarining tuzatilgan va joriy resursini ishlab chiqarish uchun bunday arxivlardan foydalanadi.Proteinlar ketma-ketligi ma'lumotlar bazasi 1988-yildan beri PIR-International ( 4–9 ) tomonidan yuritiladi. Ishtirokchi markazlarga quyidagilar kiradi:
O qsillarni ketma-ketligini aniqlashning amaliy jarayoni aminokislotalar ketma-ketligiga yoki qisman oqsil yoki peptid. Bu oqsilni aniqlashga yoki uning xarakteristikasiga xizmat qilishi mumkin tarjimadan keyingi modifikatsiyalar. Odatda, oqsilning qisman ketma-ketligi, uni kontseptual asoslardan kelib chiqqan oqsillar ketma-ketligining ma'lumotlar bazalariga asoslanib aniqlash uchun etarli ma'lumot (bir yoki bir nechta ketma-ketlik yorliqlari) beradi. Tarjimaning genlar. Proteinlarni ketma-ketlikning ikkita asosiy to'g'ridan-to'g'ri usullari mass-spektrometriya va Edman degradatsiyasi yordamida oqsil sekvenatori (sekvensiya). Ommaviy spektrometriya usullari hozirgi kunda oqsillarni ketma-ketligi va identifikatsiyasi uchun eng keng qo'llaniladi, ammo
Bekman-Spinko oqsil-peptid sekvensiyasidan foydalanish, 1970 y
Edman degradatsiyasi oqsillarni tavsiflash uchun qimmatli vosita bo'lib qolmoqda N-terminus.