Reja: dnk chiplari

DNK mikrochiplari
Reja:
1.DNK chiplari
2.Protein va peptid chiplar
3.Ifoda mikrochiplari
4.Mikrochiplar ahamiyati
DNK chiplari-bu tahlil qilinadigan namunada (odatda biologik kelib chiqishi) aniqlangan DNK ketma-ketligini aniqlashga imkon beradigan noyob analitik vosita (gibridizatsiya tahlili deb ataladi). DNK chiplari yordamida tahlil qilish muqobil texnologiyalardan (elektroforez, real vaqtda PCR) qaraganda bir necha barobar arzonroq va oddiy dizayndagi detektor yordamida laboratoriya tashqarisida ishlash imkonini beradi. Birinchi marta DNK chiplari 1980 -yillarning oxirida tadqiqotlarda ishlatilgan. Hozirgi vaqtda keng tarqalgan, bu bir vaqtning o'zida ko'plab genlarning ekspressiyasini tahlil qilishga imkon beradi, mRNK yoki cDNA maqsadlarini mikrochipda immobilizatsiyalangan bitta ipli DNK bo'laklari bilan gibridlash orqali tanib olish tamoyiliga asoslangan. DNK chipi - har xil uzunlikdagi bitta torli DNK bo'laklari immobilizatsiyalanadigan (qoida tariqasida, kovalent) mustahkam tayanchdir: qisqa - 15-25 nukleotidlar, uzun - 25-60 nukleotidlar va cDNA fragmentlari - 100 dan 3000 nukleotidgacha . Substrat materiali sifatida shisha, kremniy, turli polimerlar, gidrogellar (masalan, poliakrilamidga asoslangan) va hatto oltin ishlatiladi. Eng keng tarqalgan substratlar shisha hisoblanadi.
Protein va peptid chiplari. Genlarni tarjima qilish mahsulotlarini tahlil qilish uchun polipeptidlar asosida qurilgan chiplardan foydalaniladi. Dori -darmonlarning aksariyati oqsillardir, shuning uchun oqsil va peptid chiplari yangi dorilarni topish uchun foydali bo'lishi mumkin. Protein mikrochiplari tibbiyotda organizmning immunitet holatini aniqlash, allergik sezuvchanlikni aniqlash va o'ziga xos allergenlarni aniqlash uchun miniatyurali analitik tizimlar sifatida juda foydali bo'lishi mumkin. Asosiy patogen mikroorganizmlar (bakteriyalar, zamburug'lar va viruslar) ning asosiy antijenlari to'plamini ifodalovchi mikrochiplar qon namunalarini bir vaqtning o'zida yuzlab, minglab antitelalar borligini tahlil qilishga va infektsiyalarni tezda aniqlashga imkon beradi. Signallarni yozish usullari katta ahamiyatga ega oqsilli mikroto'lqinlarning rivojlanishi. Bunga quyidagilar kiradi: radioaktiv yorliqdan foydalanadigan birinchi ma'lum usul - RIA (radioimmunoassay), lyuminestsent yorliqlar yordamida immunoassay - FIA va ferment bilan bog'langan immunosorbent tahlil (ELISA), bu belgi antikor molekulasi bilan kovalent bog'langan ferment molekulasi. . ELISAda etiketkalar sifatida yuqori faol stabil fermentlar (ishqoriy fosfataza, peroksidaza va boshqalar) tanlanadi. Elishayning afzalligi - signallarni ko'paytirish imkoniyatidir. V oxirgi yillar Erimaydigan lyuminestsent mahsulotlarni olish uchun sezgir substrat tizimlari ishlab chiqilgan, masalan ELF-97. Shubhasiz, oqsilli mikrochipni tayyorlash jarayoni mikrochipni mahkamlash, harakatsizlantirish tartibini o'z ichiga olishi kerak. Usulni tanlash ko'plab parametrlar bilan belgilanadi - dastlabki substratning tabiati, mikrochipning keyingi qo'llanilish sohasi va boshqalar.Protein mikrochiplari, birinchi navbatda, ma'lum bo'lgan (va mavjud) biologik suyuqliklarni, shu jumladan qon zardobi / plazmasi, siydik, miya omurilik suyuqligi, tupurik, lakrimal suyuqlik, amniotik suyuqlik va boshqalarni tahlil qilish uchun faol ishlatiladi.Zamonaviy DNK mikrochipi quyidagilardan iborat minglab deoksioligonukleotidlar (problar yoki problar), mikroskopik nuqta shaklida guruhlangan va mustahkam tayanchga o'rnatiladi. Har bir nuqta ma'lum bir nukleotid ketma -ketligiga ega bo'lgan bir nechta DNK pikomollarini o'z ichiga oladi. DNK mikroarrayining oligonukleotidlari genlarning qisqa qismi yoki DNKning boshqa funktsional elementlari bo'lishi mumkin va cDNA yoki mRNK (cRNA) bilan duragaylash uchun ishlatiladi. Namunada berilgan ketma-ketlik bilan nuklein kislotaning nisbiy miqdorini aniqlash uchun prob-maqsadli gibridizatsiya flüoresan yoki xemiluminesans yordamida qayd qilinadi va miqdori aniqlanadi. Oddiy DNK mikrochipida problar kovalent tarzda qattiq yuzaga - shisha yoki silikon chipga biriktiriladi. Boshqa platformalar, masalan Illumina tomonidan ishlab chiqarilgan, katta, qattiq yuzalar o'rniga mikroskopik boncuklardan foydalanadi.
Ifoda mikrochiplari Mikrochip texnologiyasidan foydalangan holda faol rivojlangan sohalardan biri murakkab kasalliklarda transkripsiya profillarini o'rganishdir. Bizning tanamizdagi barcha hujayralar bir xil irsiy genomli DNKga ega bo'lsa -da, har bir hujayra hujayra turiga, biologik jarayonlarga, normal yoki patologik holatga va boshqalarga ko'ra mRNK shaklida turli xil genlarni ifodalaydi. Gen ekspozitsiyalarining bu xilma -xilligi biologik va klinik ahamiyatga ega bo'lgani uchun qizg'in tadqiq qilinmoqda. Mikroarray texnologiyasining yuzlab va minglab genlarning ifodasini tahlil qilish qobiliyati saraton kabi murakkab kasallikni hal qilishda eng ko'p talabga ega ekanligini isbotladi. Mikroarray texnologiyasi bir vaqtning o'zida hujayraning molekulyar portretini yaratib, o'n minglab genlarning ifodasini kuzatishi mumkin. Gen ekspressiv profilini o'rganishning eng muhim oqibatlari saratonning ko'p turlarida diagnostika, tabaqalanish va prognozni o'z ichiga oladi. Garchi sitogenetik tekshirish va bir nechta molekulyar markerlarni tahlil qilish bilan to'ldirilgan gistopatologik baholash hali ham tashxis va prognozning oltin standarti bo'lsa -da, yaqinda olib borilgan ishlar shuni ko'rsatadiki, ko'p hollarda uni gen ekspression profillash bilan almashtirish mumkin. Saraton kasalligining diagnostikasi va prognozi, shuningdek, onkolog, patolog va sitogenetik kabi bir qancha amaliyotchilarning birgalikdagi tajribasini talab qiladi. yakuniy xulosalar uslubiy yondashuvlar va mutaxassislarning malakasiga qarab farq qilishi mumkin. Mikrochiplar ko'plab mutaxassislarning sa'y -harakatlarini to'liq almashtirishi mumkin, bundan tashqari, tashxis va prognozning aniqligini yaxshilaydi va tahlil qilish uchun yagona standartlashtirilgan platformani taqdim etadi.Amaliy nuqtai nazardan, bugungi kunda mikrochiplardan foydalanish quyidagi vazifalarni hal qilishga imkon beradi: aniq tashxis qo'yish, kasallikning yangi kichik turlarini aniqlash, tasnifni aniqlashtirish; kasallikning kechishini va klinik natijasini bashorat qilish, onkematologik kasalliklarning patogenezida ishtirok etuvchi genlar va signal yo'llarini aniqlash, maqsadli differentsial terapiya uchun yangi maqsadlarni qidirish; oddiy va arzonroq diagnostika testlarini ishlab chiqish va yaratish, shu jumladan mikrochip texnologiyasiga asoslangan testlar (o'n va yuz minglar o'rniga o'nlab yoki yuzlab genlar uchun namunalarni o'z ichiga olgan mikrochiplar); mikrochiplarni istiqbolli klinik tadqiqotlarga kiritish, klinik davolash protokollariga kiritish uchun mikrochiplar bo'yicha tahlil natijalarini tasdiqlash, mikrochip texnologiyasi yordamida olingan kasalliklarning tabiati haqidagi yangi ma'lumotlarni hisobga olgan holda klinik protokollarni tuzish.
Foydalanilgan adabiyotlar
1. Алматов А. С., Турабеков Ш., Жалолов Генетикадан масалалар тўплами ва уларни ечиш методикаси.
2.Genetika, A.T.G’ofurov, S.S. Fayzullayev.
3. Инге-Вечтомов С.Г. Генетика с основами селекции
4. Лобашев М.Е., Ватти К.В., Тихомирова М.М. Генетика с основами селекции.