Reja: I. Klassifikatsiya. II. Katalitik asoslari. III. Mexanizm. IV. Sanoatdagi ahamiyati

Reja:
I.Klassifikatsiya.


II.Katalitik asoslari.


III.Mexanizm.


IV.Sanoatdagi ahamiyati.


V.Xulosa.


VI.Foydalanilgan adabiyotlar.

EC 3.4.22.44

Qabul qilingan nom : endopeptidaza


Reaksiya : Glutaminil bog'larini gidrolizlaydi. Tabiiy substrat virusli poliproteindir, ammo tegishli konsensus ketma-ketligini o'z ichiga olgan boshqa oqsillar va oligopeptidlar ham parchalanadi.


Boshqa nomi : potivirus NIa Proteaza


Sharhlar : Potiviruslar o'simliklarda kasalliklarga olib keladi va mezbon hujayra yadrolarida inklyuziya tanalari paydo bo'ladi; Inklyuziya organlarining oqsili a endopeptidazadir. Ferment rekombinant termoyadroviy oqsillarni sun'iy ifodalash uchun vektorlarda kodlanganda amaliy foydalanishni topadi, chunki u ularga avtolitik bo'linish qobiliyatini berishi mumkin. Bundan tashqari, fermentni ifodalovchi transgen o'simliklar virusli infektsiyaga chidamliligi haqida xabar berilgan.

Katalitik asoslari

Proteazalarni yetita keng guruhga bo'lish mumkin:

• 
  Serin Proteazalari - serin yordamida spirtli ichimliklar
  

• 
  Sistein Proteazalari - sistein yordamida tiol
  

• 
  Treonin Proteazalari - treonin yordamida ikkilamchi spirt
  

• 
  Aspartik Proteazalar - aspartat yordamida karboksilik kislota
  

• 
  Glutamik Proteazalar - glutamat yordamida karboksilik kislota
  

• 
  MetalloProteazalar - odatda metalldan foydalanish rux
  

Proteazalar birinchi marta 1993 yilda o'zlarining evolyutsion munosabatlariga ko'ra 84 ta oilaga birlashtirilgan va to'rt katalitik turga ajratilgan: serin, sistein, aspartik va metallo Proteazalar. The treonin va glutamik kislota Proteazaalar 1995 va 2004 yillarga qadar ta'riflanmagan. Ajratish uchun ishlatiladigan mexanizm a peptid birikmasi qilishni o'z ichiga oladi aminokislota bor bo'lgan qoldiq sistein va treonin (Proteazalar) yoki suv molekulasi (aspartik kislota, metallo- va kislota Proteazalari) nukleofil, peptidga hujum qilishi mumkin karboksil guruh. Nukleofilni yaratish usullaridan biri bu katalitik uchlik,qaerda a histidin qoldiq faollashtirish uchun ishlatiladi serin, sistein, yoki treonin nukleofil sifatida. Ammo bu nukleofil turlari kabi evolyutsion guruhlash emas yaqinlashib rivojlandi boshqacha superfamilalar, va ba'zi bir superfamilalar turli xil nukleofillarga divergent evolyutsiyani ko'rsatadilar.

2011 yilda proteolitik fermentlarning ettinchi katalitik turi - asparagin peptid liazasi tasvirlangan. Uning proteolitik mexanizmi odatdagidan farqli o'laroq, gidroliz, u bajaradi yo'q qilish reaktsiyasi Ushbu reaksiya davomida katalitik asparagin tsiklli kimyoviy tuzilishni hosil qiladi, u kerakli sharoitda oqsillardagi asparagin qoldiqlaridan ajralib chiqadi. Uning printsipial jihatdan boshqacha mexanizmini hisobga olgan holda, uni peptidaza sifatida kiritish munozarali bo'lishi mumkin.

Evolyutsion filogeniya Proteaza evolyutsiyasining zamonaviy

klassifikatsiyasi superfamilalar MEROPS ma'lumotlar bazasida joylashgan. Ushbu ma'lumotlar bazasida Proteazalar birinchi navbatda "klan" tomonidan tasniflanadi (superfamily) tuzilishga, mexanizmga va katalitik qoldiq tartibiga asoslangan (masalan, PA klani bu yerda P nukleofil oilalarining aralashmasini bildiradi). Har bir "klan" ichida Proteazalar tasniflanadi oilalar ketma-ketlik o'xshashligiga asoslangan (masalan, PA klanidagi S1 va C3 oilalari). Har bir oilada yuzlab bog'liq Proteazalar bo'lishi mumkin masalan: tripsin, elastaza, trombin va streptogrisin S1 oilasida.

Hozirda 50 dan ortiq klan ma'lum, ularning har biri proteolizning mustaqil evolyutsion kelib chiqishini bildiradi.