Structural databases of bioinformatics

PROTEIN MA'LUMOTLAR BANKI
Protein ma'lumotlar banki (PDB) - bu oqsillar va nuklein kislotalar kabi yirik biologik 
molekulalarning uch o'lchovli strukturaviy ma'lumotlari uchun kristallografik 
ma'lumotlar bazasi. Odatda rentgen kristallografiyasi, NMR spektroskopiyasi yoki 
tobora krioelektronmikroskopiya yordamida olingan va butun dunyo bo'ylab biologlar 
va biokimyogarlar tomonidan taqdim etilgan ma'lumotlarga a'zo tashkilotlarning 
(PDBe, PDBj va) veb-saytlari orqali Internetda erkin foydalanish mumkin. RCSB.
PDB butunjahon oqsil ma'lumotlar banki, wwPDB deb nomlangan tashkilot tomonidan nazorat 
qilinadi.
PDB strukturaviy genomika kabi strukturaviy biologiya sohalarida asosiy manba hisoblanadi. Ko'pgina 
yirik ilmiy jurnallar va ba'zi moliya agentliklari endi olimlardan o'z tuzilmalari haqidagi ma'lumotlarni 
PDBga taqdim etishlarini talab qiladi.
Ko'pgina boshqa ma'lumotlar bazalari PDBda saqlanadigan protein tuzilmalaridan foydalanadi. 
Masalan, SCOP va CATH oqsil tuzilmalarini tasniflaydi, PDBsum esa gen ontologiyasi kabi boshqa 
manbalardan olingan ma'lumotlardan foydalangan holda PDB yozuvlarining grafik ko'rinishini taqdim 
etadi.
O'tmishda PDBdagi tuzilmalar soni taxminan eksponensial sur'atda o'sib bordi va 
1982 yilda ro'yxatga olingan 100 ta tuzilmani, 1993 yilda 1000 tani, 1999 yilda 10 000 
tani va 2014 yilda 100 000 tani bosib o'tdi. Biroq, 2007 yildan boshlab, yangi oqsil 
tuzilmalarining to'planish tezligi platoga o'xshaydi.
Keyn Zane yuklab oldi ( [e-mail] )

---

MAQSAD :PDB dan oqsil tuzilishini olish.
TARTIBI:
1. PDB veb-saytini yangi oynada oching.
2. Berilgan qidiruv maydoniga oqsil nomini kiriting.
3. Qidiruv opsiyasini bosing va qidiruvni bajaring.
4. Natija yangi oynada paydo bo'ladi.
5. Natija sahifasidan oqsilni tanlang va yuklab olish opsiyasini bosing.
6. Ko'rsatilgan oynada saqlash opsiyasini bosing.
7. Ko'rsatilgan yangi oynada joylashuvni ko'rsatib, PDB faylini 
saqlang.
8. Tegishli vizualizatsiya yordamida strukturani ko'ring.
Keyn Zane yuklab oldi ( [e-mail] )

---

NATIJA:
Keyn Zane yuklab oldi ( [e-mail] )

---