Structural databases of bioinformatics
MOLEKULAR MODELLASH MA'LUMOTLARI BAZASI (MMDB)
Download 0.62 Mb. Pdf ko'rish
|
structural-databases-of-bioinformatics.en.uz
- Bu sahifa navigatsiya:
- MAQSAD
|
MOLEKULAR MODELLASH MA'LUMOTLARI BAZASI (MMDB)
MMDB kristallografiya va NMR tuzilishini aniqlashdan olingan eksperimental ma'lumotlarni o'z ichiga oladi. MMDB ma'lumotlari PDB dan olinadi. NCBI tizimli ma'lumotlarni bibliografik ma'lumotlarga, ketma-ketlik ma'lumotlar bazalariga va NCBI taksonomiyasiga o'zaro bog'ladi. Molekulyar modellashtirish ma'lumotlar bazasi (MMDB) eksperimental ravishda aniqlangan uch o'lchovli bimolekulyar tuzilmalar ma'lumotlar bazasi bo'lib, u Entrez Structure ma'lumotlar bazasi deb ham ataladi. Bu nazariy modellar bundan mustasno, RCSB Protein Data Bank (PDB) dan olingan uch o'lchovli tuzilmalarning kichik to'plamidir. Ko'pgina tuzilish ma'lumotlari rentgen kristallografiyasi va NMRspektroskopiyadan olinadi. Rentgen kristallografiyasi oqsilning kristallangan shakli orqali rentgen nurlarini o'tkazish va hosil bo'lgan rentgen nurlarining diffraktsiya naqshini tahlil qilish orqali oqsil ichidagi atomlarning joylashishini aniqlaydi. Ushbu uslub eng yuqori aniqlikni ta'minlaydi va odatda strukturaning faqat bitta modelini beradi.ning eritmadagi harakati. Har bir strukturaning namunasi ushbu hujjatning "yozuv turlari" bo'limida ko'rsatilgan va qo'shimcha eksperimental usullar ma'lumotlar bazasining Metod qidirish maydonida keltirilgan. Ushbu eksperimental usullarga alternativa sifatida, ba'zi tadqiqotchilar ma'lum tarkibga ega molekuladagi har bir atomga ta'sir qiluvchi kuchlarni taqlid qilish orqali oqsil tuzilishini taxmin qilish uchun hisoblash modellaridan foydalanadilar. Biroq, bu usul eksperimental bo'lmagan modellarni va eng kam ishonchli natijalarni beradi. Shu sabablarga ko'ra, Molekulyar modellashtirish ma'lumotlar bazasi hisoblash yo'li bilan yaratilgan tuzilmalarni yoki boshqa nazariy modellarni istisno qiladi va faqat eksperimental tarzda aniqlangan tuzilmalarni o'z ichiga oladi. Keyn Zane yuklab oldi ( nodirmusaboyev@gmail.com ) MAQSAD :Protein tuzilishini olish uchun. TARTIBI: 1. MMDB uchun veb-saytni yangi oynada oching. 2. Ochiladigan menyudan variant tuzilishini tanlang. 3. Ko'rsatilgan qidiruv maydoniga kalit so'zni kiriting. 4. Ko'rsatilgan ro'yxatdan kerakli ulanish raqamini tanlang. 5. Natija yangi oynada paydo bo'ladi. Keyn Zane yuklab oldi ( nodirmusaboyev@gmail.com ) NATIJA: Keyn Zane yuklab oldi ( nodirmusaboyev@gmail.com ) Download 0.62 Mb. Do'stlaringiz bilan baham: 
|