Oqsillarning birlamchi tuzilishi Oqsillarning ikkilamchi tuzilishi Polipeptidlar va oqsillar tirik organizmning asosiy moddalaridir. «Hayot oqsil jismlarining mavjudligi shaklidir»

O'raqova Safargulning
Biokimyo fanidan mustaqil ishi


Polipeptid zanjirlarining alfa va betta tuzilishi


Reja:

• 
  Oqsillarning birlamchi tuzilishi
  
• 
  Oqsillarning ikkilamchi tuzilishi
  

Polipeptidlar va oqsillar tirik organizmning asosiy moddalaridir. «Hayot oqsil jismlarining mavjudligi shaklidir» (F. Engels). Ularning metabolizmdagi roli noyobdir, ular metabolizmning barcha asosiy funktsiyalarini bajaradilar:

1) Proteinlar - to'qimalarning plastik materiali;
2) Proteinlar organizm uchun zarur bo'lgan uch turdagi oziq moddalardan biridir;
3) Protein tuzilmalari fermentlar - biokimyoviy katalizatorlar, metabolizm "dvigatellari" tarkibida asosiy hisoblanadi;
4) Biokimyoviy o'zgarishlar yo'llarini tartibga soluvchi gormonlar va moddalar asosan polipeptidlar va oqsillardir. Gormonlar, bioregulyatorlar va dorilar uchun to'qimalarning retseptorlari ham oqsil tuzilmalari hisoblanadi.
Polipeptidlar va oqsillarning birlamchi tuzilishi
Polipeptidlar va oqsillar peptid bog'lari bilan bog'langan aminokislotalar qoldiqlaridan tashkil topgan polimerlar.
An'anaviy ravishda polipeptidlar 100 tagacha aminokislota qoldiqlarini o'z ichiga olgan polimerlar, 100 dan ortiq qoldiqlar oqsillar deb hisoblanadi. Oligopeptidlar ayniqsa ajralib turadi - 10 tagacha aminokislota qoldiqlari.
Polipeptidlar va oqsillar a-aminokislotalarning polikondensatsiyasi natijasida hosil bo'ladi:

Polipeptidlar va oqsillarning fizik-kimyoviy xossalari
Polipeptidlar va oqsillarning molekulalari o'z tarkibida ionogen karboksil va aminokislotalarga ega va aminokislotalar kabi har doim elektr zaryadini olib yuradi, uning belgisi va kattaligi eritmaning pH ga bog'liq.
Barcha polipeptidlar va oqsillar ma'lum bir xususiyatga ega izoelektrik nuqta (pi) - molekulaning umumiy zaryadi nolga teng bo'lgan pH qiymati.
Agar eritmaning pH qiymati bo'lsa quyida izoelektrik nuqta (pH< pI), то молекула в целом имеет ijobiy zaryad.
Agar eritmaning pH qiymati bo'lsa yuqorida izoelektrik nuqta (pH > pI), keyin butun molekula mavjud salbiy zaryad.
Agar molekuladagi karboksil va aminokislotalarning soni bir xil bo'lsa, u holda moddaning izoelektrik nuqtasi neytral pH (pI = 7) mintaqasida bo'ladi. bu neytral polipeptidlar.
Agar molekulada ustunlik qilsa karboksil guruhlari, keyin izoelektrik
nuqta kislota pH mintaqasida (pI< 7). Это nordon polipeptidlar.
Agar molekulada aminokislotalar ustunlik qilsa, u holda izoelektrik nuqta asosiy pH oralig'ida (pI > 7) bo'ladi. bu asosiy polipeptidlar.
Polipeptidlarning suvda eruvchanligi ularning molekulyar og'irligiga bog'liq.
Oligopeptidlar va past molekulyar og'irlikdagi polipeptidlar, aminokislotalar kabi, suvda yaxshi eriydi.
Yuqori molekulyar og'irlikdagi oqsillar kolloid eritmalar hosil qiladi. Ularning eruvchanligi pH ga (ya'ni, molekula zaryadiga) bog'liq. Izoelektrik nuqtada oqsilning eruvchanligi minimal bo'ladi va u cho'kadi. Kislotalangan yoki ishqorlanganda molekulalar yana zaryad oladi va cho'kma eriydi.
Oqsillar va polipeptidlarning fazoviy tuzilishi
Yuqori molekulyar polipeptidlar va oqsillar, birlamchi tuzilishga qo'shimcha ravishda, fazoviy tashkilotning yuqori darajalariga ega - ikkilamchi, uchlamchi va to'rtlamchi tuzilmalar.
PEPTIDA GURUHI

ikkilamchi tuzilma
1) a-spiral
Peptidlar guruhining tuzilishi polipeptid zanjirining fazoviy tuzilishini belgilaydi.
L. Pauling (1950) a-polipeptid zanjiri uchun eng ehtimollardan biri o'ng qo'lli a-spiralning tuzilishi ekanligini hisoblash yo'li bilan hisoblab chiqdi. Ko'p o'tmay, bu rentgen nurlari diffraktsiyasi tahlili bilan eksperimental ravishda tasdiqlandi:

1-chi C=O va 5-aminokislota qoldiqlarining N-H oʻrtasida vodorod bogʻlari hosil boʻlib, spiral oʻqiga deyarli parallel yoʻnaltirilgan boʻlib, ular spiralni birga ushlab turadi. Yon radikallar R spiralning periferiyasi bo'ylab joylashgan.
2) b-plisimon struktura
Ushbu turdagi ikkilamchi tuzilishda bir-biriga cho'zilgan polipeptid zanjirlari bir-biri bilan vodorod aloqalarini hosil qiladi:



Ko'pgina oqsillar ikkilamchi tuzilishga ega bo'lib, a-spiral va b-varaq strukturasining o'zgaruvchan qismlari.
Uchinchi darajali tuzilish
a-spiral etarlicha cho'zilgan holda, egilib, to'pga aylanadi. Bu bir-biridan etarlicha uzoqda joylashgan yon radikallarning o'zaro ta'siri natijasida yuzaga keladi. Globula hosil bo'ladi:

Uchinchi darajali tuzilmani tashkil etuvchi o'zaro ta'sir turlari
1) Vodorod aloqalari

2) Ionli o'zaro ta'sir

3) Gidrofobik o'zaro ta'sir

4) Disulfid bog'lari

To'rtlamchi tuzilish
To'rtlamchi struktura bo'linmalarning yig'indisi - globulalar. U uchinchi darajali tuzilish bilan bir xil turdagi o'zaro ta'sirlardan hosil bo'ladi:

Oqsilning to'rtlamchi tuzilishi Gemoglobinning to'rtlamchi tuzilishi

ADABIYOTLAR
1. Tyukavkina N.A., Zurabyan S.E., Beloborodov V.L. va boshqalar - Organik kimyo (maxsus kurs), 2-v. - Bustard, M., 2008, s. 207-227.
2. Tyukavkina N.A., Baukov Yu.I. - Bioorganik kimyo - DROFA, M., 2007, s. 314-315, 345-369.