Peptidlar

Peptidlar (yun. peptos — qaynatilgan, oʻta qaynatilgan) — birbiriga amid (peptid) bogʻ bilan bogʻlangan 2 va undan ortiq aminokislotalar qoldigʻidan iborat birikmalar. Tarkibidagi aminokislota qoldigʻining soniga qarab P. dipeptidlar, tripeptidlar, tetrapeptidlar va boshqa deb ataladi. Molekulasida 10 tagacha aminokislota qoldigʻi boʻlgan P. — oligopeptidlar, 10 tadan ortiq aminokislota qoldigʻi tutgan P. — polipeptidlar, massasi 6000 dan yuqori boʻlgan tabiiy polipeptidlar — oqsillar deb ataladi. P. hayvon va oʻsimliklar organizmida oqsillarning parchalanishidan hosil boʻladigan mahsulotlardir. Oʻsimliklar, hayvonlar va mikroorganizmlarda erkin holda uchraydi.

Oqsillar katta biomolekulalar, yoki makromolekulalar ning bir yoki bir nechta uzun zanjirlaridan iborat aminokislota qoldiqlar. Oqsillar organizmlarda juda ko'p funktsiyalarni bajaradi, shu jumladan metabolik reaktsiyalarni katalizatori, DNKning replikatsiyasi, ogohlantirishlarga javob berish, ta'minlash hujayralar tuzilishi va organizmlar va molekulalarni tashish bir joydan boshqasiga. Oqsillar bir-biridan birinchi navbatda aminokislotalarning ketma-ketligi bilan ajralib turadi nukleotidlar ketma-ketligi ularning genlar va bu odatda natijaga olib keladi oqsilni katlama aniq bir narsaga 3D tuzilish uning faoliyatini belgilaydigan.
Aminokislota qoldiqlarining chiziqli zanjiri a deb ataladi polipeptid. Oqsil tarkibida kamida bitta uzun polipeptid mavjud. 20-30 dan kam qoldiqni o'z ichiga olgan qisqa polipeptidlar kamdan-kam hollarda oqsil deb hisoblanadi va odatda ularni chaqiradi peptidlar yoki ba'zan oligopeptidlar. Alohida aminokislota qoldiqlari bir-biriga bog'langan peptid bog'lari va qo'shni aminokislota qoldiqlari. The ketma-ketlik oqsil tarkibidagi aminokislota qoldiqlari ketma-ketlik a gen ichida kodlangan genetik kod. Umuman olganda, genetik kodda 20 ta standart aminokislotalar ko'rsatilgan; ammo ba'zi organizmlarda genetik kod o'z ichiga olishi mumkin selenotsistein va - albatta arxey —pirroliz. Sintezdan biroz vaqt o'tgach yoki hatto undan keyin ham, oqsil tarkibidagi qoldiqlar ko'pincha kimyoviy jihatdan o'zgartiriladi tarjimadan keyingi modifikatsiya, bu oqsillarning fizikaviy va kimyoviy xususiyatlarini, katlanishini, barqarorligini, faolligini va oxir-oqibat funktsiyasini o'zgartiradi. Ba'zi oqsillarda peptid bo'lmagan guruhlar biriktirilgan bo'lib, ularni chaqirish mumkin protez guruhlari yoki kofaktorlar. Proteinlar ma'lum bir funktsiyaga erishish uchun birgalikda ishlashlari mumkin va ular ko'pincha barqaror shakllanish uchun birlashadilar oqsil komplekslari.