Ochiq o'qish doirasini topish orf finder dasturi. Ochiq o'qish ramkasi O'qish uchun ochiq qidiruv ramkalari

Ochiq o'qish doirasini topish. orf finder dasturi

ORF fotolarini ochadigan yana bir Olympus - bu Olympus Studio, faqat E-1 dan E-5 kameralariga. Olympusga elektron pochta orqali nusxasini yuborishingiz mumkin. ORF fayllari, shuningdek, Able RAWer, Adobe Photoshop, Corel AfterShot va ehtimol boshqa mashhur foto va grafik vositalar kabi, Olympus dasturisiz ham ochilishi mumkin. Windows-dagi standart fotosuratchi ORF fayllarini ham ochishi kerak, ammo u Microsoft Camera Codec Pack-ni talab qilishi mumkin. ORF fayllarini ochish uchun bir nechta dastur mavjud bo'lganligi sababli, siz kompyuteringizda bir nechta nusxa bo'lishi mumkin. Agar ORF fayli uni ishlatmaslikni xohlagan dastur bilan ochilganini bilsangiz, ORF fayllarini ochadigan ko'rsatuv dasturini osongina o'zgartirishingiz mumkin. ORF faylini qanday qilib o'zgartirasiz? Agar ORF faylini JPEG yoki TIFFga o'zgartiradigan bo'lsangiz, Olympus Viewer-ni bepul yuklab oling. Bundan tashqari, JPG, PNG , TGA , TIFF, BMP , A.I. va boshqa formatlarga faylni saqlashni qo'llab-quvvatlaydigan Zamzar kabi veb-sayt yordamida ORF faylini onlayn almashtirishingiz mumkin.
Sizning faylingiz ochilmayaptimi?
Sizning faylingiz yuqorida ko'rsatilgan dasturlar bilan ochilmasa, fayl kengaytmasini ikki marta tekshirish kerak. Ba'zi fayl formatlari "ORF" ga juda o'xshash fayl kengaytmasidan foydalanadi, ammo bu ular bilan umumiy bo'lgan narsalar yoki bitta dasturiy ta'minot bilan ishlay oladigan degan ma'noni bermaydi.
Misol uchun, OFR fayllari osonlik bilan ORF rasmlari bilan aralashtirilishi mumkin, ammo ular faqat Winamp (OptimFROG plagini bilan) kabi audio bilan bog'liq bir necha dastur bilan ishlaydigan OptimFRONG Audio fayllari.
Faylingiz ORA fayli yoki hatto RadiantOne FID bilan ochiladigan ORX fayl kengaytmasi bilan RadiantOne VDS bazasi sxemasi fayli bo'lishi mumkin.
ORF report fayli ORF rasm faylida qandaydir narsaga o'xshab ko'rinishi mumkin, lekin bunday emas. ORF report files PPR fayl kengaytmasi bilan yakunlanadi va Vamsoft ORF spam-filtrlari tomonidan yaratiladi.
Bularning barchasida va ehtimol ko'pchilik boshqa fayllarda, Olympus kameralaridan foydalanadigan ORF tasvirlari bilan hech qanday aloqasi yo'q. Fayl kengaytmasi haqiqatan ham ".ORF" faylning oxirida o'qilishini tekshiring. Ehtimol, siz yuqorida ko'rsatilgan tasvirni tomoshabinlar yoki konvertorlar bilan ocholmaysiz, siz aslida Olympus Raw Image fayli bilan ishlamaysiz.
Molekulyar genetikada ochiq o'qish ramkasi (ORF ) tarjima qilish qobiliyatiga ega bo'lgan o'qish ramkasining bir qismidir. ORF boshlang'ich kodon (odatda AUG) bilan boshlangan va stop kodon (odatda UAA, UAG yoki UGA) bilan tugaydigan kodonlarning doimiy qismidir. Orf ichidagi atg kodi (RNK jihatidan AUG) (mutlaqo birinchi emas) efirga uzatiladigan joyni ko'rsatishi mumkin. Transkripsiyani tugatish sayti ORFDAN so'ng, efirga uzatish kodining orqasida joylashgan . Agar transkriptsiya to'xtash kodonining paydo bo'lishidan oldin to'xtatilsa, efir vaqtida to'liq bo'lmagan protein hosil bo'ladi. Ko'p eksonli eukaryot genlarida intronlar chiqariladi va eksonlar keyinchalik transkripsiyadan so'ng proteinni uzatish uchun yakuniy mrnani olish uchun birlashtiriladi. Gen topish kontekstida, ORF dan start-stop ta'rifi introns stop kodonları o'z ichiga olishi va / yoki kadrlar o'qish o'rtasida siljishlar olib kelishi mumkin , chunki faqat mRNA o'rniga genom DNK bitilgan, shunday qilib, qo'llaniladi. Shu bilan bir qatorda ta'rifda ORF uch marta ko'p bo'lgan va stop kodonlari bilan cheklangan ketma-ketlikdir. Ushbu umumiy ta'rif , shuningdek, boshlang'ich va / yoki stop kodon qabul qilingan ketma-ketliklarda mavjud bo'lmasligi mumkin bo'lgan transkriptomika va / yoki metagenomikalar kontekstida ham foydali bo'lishi mumkin. Bunday ORF to'liq gen emas, balki genning qismlariga mos keladi.
Biologik ahamiyati
Ochiq o'qish ramkalari (ORF) ko'pincha genlarni prognozlashda yordam beradigan bitta dalil sifatida ishlatiladi. Uzoq ORF ko'pincha boshqa dalillar bilan bir qatorda, nomzod oqsili kodlovchi saytlarni yoki RNKni DNK ketma-ketligida kodlovchi funktsional maydonlarni dastlabki aniqlash uchun ishlatiladi . ORFGA ega bo'lish, albatta, mintaqa har doim efirga uzatilishini anglatmaydi . Misol uchun , tasodifiy yaratilgan DNK ketma-ketligida har bir nukleotidning teng foiziga ega va stop kodon har bir 21 kodon uchun bir marta kutilishi mumkin . Prokaryotlar uchun oddiy genlarni bashorat qilish algoritmi boshlang'ich kodni qidirishi mumkin, undan keyin ochiq o'qish ramkasi bu hududning kodonlaridan foydalanish ma'lum bir tananing kodlash hududlari uchun chastota tavsifiga mos keladigan odatiy oqsilni kodlash uchun etarli. Shuning uchun, ba'zi mualliflar ORF ning 100 yoki 150 kodlari kabi minimal uzunligi bo'lishi kerakligini aytishadi. O'z - o'zidan, hatto uzoq ochiq o'qish ramkasi ham genning mavjudligiga ishonchli dalil emas . Boshqa tomondan, u funktsional peptidlar ishlab chiqarish mumkin (nkrnk va mRNA ikkala) gen oqsillar kodlayan hech klassik oyat-belgilar bordir ba'zi qisqa ORS (Kors), deb isbotlangan. 5'NTR sutemizuvchilar mRNA ning taxminan 50% bir yoki bir nechta korsni o'z ichiga olganligi ma'lum. 64-75% eksperimental ravishda aniqlangan translyatsiya boshlash saytlari Kors inson va sichqoncha genomlarida konservativ bo'lib, bu elementlarning funktsiyani bajarishini ko'rsatishi mumkin. Biroq, Kors ko'pincha faqat kichik mRNA shakllarida topiladi va tanlovdan qochadi; boshlanish saytlarining yuqori konservatizmi tegishli genlarning targ'ibotchilari ichidagi joylashuvi bilan bog'liq bo'lishi mumkin. Bu holat , masalan, slamf1 geniga xosdir .
Olti kvadrat tarjima
DNK uchta nukleotid (kodon) guruhlari tomonidan talqin qilinganligi sababli, DNK zanjiri uch xil o'qish doirasiga ega. DNK molekulasining ikki spirali ikki parallel filamentga ega; ikkita zanjir bilan, ularning har biri uchta o'qish ramkasiga ega, oltita ramka translyatsiyasi mavjud.
Olti bosqichli tarjima misoli. Nukleotid ketma-ketligi o'rtada yuqorida to'g'ridan-to'g'ri efirga uzatiladi va pastda teskari tarjima qilinadi. Ketma-ketlik bilan ikkita ochiq o'qish ramkasi mavjud.

2.