Filogenetik daraxtlar klasterlash metodlar mundarija


-rasm: Filogenetik shajara


Download 316.7 Kb.
bet7/10
Sana18.06.2023
Hajmi316.7 Kb.
#1588660
1   2   3   4   5   6   7   8   9   10
Bog'liq
Genlarni filogenetik shajaralarini organish mundarija kirish 1

-rasm: Filogenetik shajara


Cladogram va filogenetik daraxt o'rtasidagi farq nima?



Cladogram va boshqalar filogenetik daraxt

Kladogramma evolyutsion daraxt
emas. Shunday qilib, u evolyutsion aloqalarni ko'rsatmaydi.

Filogenetik daraxt -
evolyutsion daraxt. Bu evolyutsion aloqalarni ko'rsatadi.

Foydalanish

Kladogramma - bu guruhning
haqiqiy evolyutsion tarixi haqidagi faraz.

Filogenetik daraxt
organizmlarning haqiqiy evolyutsion tarixini ifodalaydi.

Filiallarning uzunligi

Kladogramma teng uzunlikda chiziladi. Filialning uzunligi

Filogenetik daraxtning filial uzunligi evolyutsion masofani

evolyutsion masofani anglatmaydi.

ko'rsatadi.

Evolyutsion vaqtni ko'rsatish

Kladogramma organizmlar taksilarini ajratishda evolyutsion vaqt miqdorini ko'rsatmaydi.

Filogenetik daraxt organizmlar taksilarini ajratish vaqtini ko'rsatadi.

Xulosa - Cladogram va boshqalar filogenetik shajara


Kladogramma - bu turli xil organizmlarning o'zaro o'xshashligini ko'rsatadigan diagramma. Filogenetik daraxt - bu geologik vaqt shkalasi bo'yicha organizmlarning filogenetik tarixini aks ettiruvchi diagramma. Bu organizmlar va evolyutsion tarix o'rtasidagi mumkin bo'lgan munosabatlarni ifodalaydi. Bu kladogramma va filogenetik daraxt o'rtasidagi farq.
Manbalar:

  1. Voez, Karl R. "Umumjahon filogenetik daraxtni talqin qilish." Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. Milliy fanlar akademiyasi, 2000 yil 18 iyul. Internet. 2017 yil 03 aprel

  2. Xoll, Barri G. "Molekulyar ma'lumotlardan filogenetik daraxtlarni MEGA yordamida qurish." Molekulyar biologiya va evolyutsiya. Oksford universiteti matbuoti, 12 -mart, 2013. Veb. 2017 yil 03 aprel

Rasm izni:
1. "Filogenetik daraxt" Ushbu vektor versiyasi bo'yicha: Erik Gaba (Sting - fr: Sting) - NASA Astrobiologiya instituti, Commons Wikimedia orqali (Public Domain) maqolasida topilgan.
Daraxtlarni morfologik yoki molekulyar belgilar yoki ikkalasi yordamida tiklash mumkin. Xuddi shu tarzda, ularni qurish uchun turli usullar mavjud, eng keng tarqalgani kladistlar metodologiyasi. Bu sinapomorfiya deb nomlanuvchi, birgalikda olingan belgilarni aniqlashga intiladi.

Filogenetik daraxt anatomiyasi


Filogenetik daraxtlarda biz quyidagi qismlarni ajratishimiz mumkin - botanika o'xshashligini davom ettirish:
Filiallar: Daraxtning chiziqlari "novdalar" deb nomlanadi va ular vaqt o'tishi bilan o'rganilayotgan populyatsiyalarni ifodalaydi. Daraxt turiga qarab (pastga qarang), novdaning uzunligi ma'noga ega bo'lishi yoki bo'lmasligi mumkin.
Filiallarning uchlarida biz baholamoqchi bo'lgan organizmlarni topamiz. Ular hozirgi paytda mavjud bo'lgan yoki yo'q bo'lib ketgan mavjudotlar bo'lishi mumkin. Turlar bizning daraxtimizning barglari bo'ladi.
Ildiz: ildiz daraxtning eng qadimiy shoxidir. Ba'zilarida bu bor va ularni ildiz otgan daraxtlar deyishadi, boshqalari esa yo'q.
Tugunlar: ikki yoki undan ortiq nasldagi shoxlarning tarmoqlanish nuqtalari tugun deb ataladi. Nuqta avlod guruhlarining eng so'nggi umumiy ajdodini ifodalaydi (bu ajdodlar taxminiy ekanligiga e'tibor bering).
Tugunning mavjudligi spetsifikatsiya hodisasini - yangi turlarni yaratishni nazarda tutadi. Shundan so'ng, har bir tur o'z evolyutsiyasini kuzatib boradi.
Qo'shimcha terminologiya
Filogenetik shajaralarhaqida gap ketganda, ushbu uchta asosiy tushunchalardan tashqari, boshqa zarur atamalar mavjud:
Va nihoyat, bizda ultrametrik daraxtlar yoki dendogrammalar mavjud bo'lib, u erda daraxtlarning barcha uchlari bir xil masofada joylashgan (filologiyada bunday holat uchi sherigidan pastroq yoki balandroq ko'rinishi mumkin). Filialning uzunligi evolyutsion vaqt bilan bog'liq.
Daraxtni tanlash biz javob bermoqchi bo'lgan evolyutsion savol bilan bevosita bog'liq. Masalan, agar biz faqat shaxslar o'rtasidagi munosabatlar bilan shug'ullanadigan bo'lsak, kladogramma o'rganish uchun etarli bo'ladi.

    1. Download 316.7 Kb.

      Do'stlaringiz bilan baham:
1   2   3   4   5   6   7   8   9   10




Ma'lumotlar bazasi mualliflik huquqi bilan himoyalangan ©fayllar.org 2024
ma'muriyatiga murojaat qiling