I. Genomik va proteomik ma'lumotlar bazalari bilan ishlash

III. Molekulyar fiolgeniya
Molekulyar filogeniya turli tipdagi tirik organizmlar oʻrtasidagi evolyutsion munosabatlar darajasini aniqlash, tabiiy taksonomiyani qurish va genomlarning nukleotidlar ketma-ketligi haqidagi maʼlumotlar asosida evolyutsion hodisalarni qayta qurish bilan shugʻullanadi. Birinchi yaqinlashishda bu vazifa juda oddiy: siz tahlil qilingan genomlarni bir nechta tekislashni amalga oshirishingiz va farqlarni topishingiz kerak. Bir-biridan kamroq farq qiladigan organizmlar evolyutsion jihatdan yaqinroq bo'lib, ular quyi tartibli (turlar, jinslar, oilalar) taksoniga birlashtirilishi kerak.¹⁴ Ularning genomlari keskin farq qiladiganlari juda uzoq evolyutsion qarindoshlar bo'lib, faqat bitta tartib yoki turga tegishli bo'lishi mumkin. Biroq, agar muammoni batafsilroq ko'rib chiqsangiz, hamma narsa unchalik oddiy emas. Birinchidan, butun genomlarni bir nechta tekislash texnik jihatdan juda qiyin vazifadir. Shuning uchun butun genom emas, balki uning ma'lum bo'limlari solishtiriladi. Shuning uchun muvaffaqiyat ko'p jihatdan taqqoslash uchun sayt tanlashga bog'liq. Ikkinchidan, hozirgi vaqtda biologlar uchun genomning turli qismlaridagi farqlar teng bo'lmagan evolyutsion "og'irlik" ga ega ekanligi ayon bo'ladi, chunki genlar yoki tartibga soluvchi elementlarning o'zgarishi organizm xususiyatlarining o'zgarishiga olib kelishi mumkin (ya'ni, aynan shunday). evolyutsion ahamiyatga ega bo'lgan o'zgarishlar ), genomning kodlanmagan hududlaridagi o'zgarishlar esa organizmning belgilariga hech qanday ta'sir qilmasligi va shunga mos ravishda evolyutsion ahamiyatga ega bo'lmasligi mumkin. Demak, organizmlarning filogenetik munosabatlarini yoritishda bunday farqlarni hisobga olmaslik kerak. Bundan tashqari, yuqorida aytib o'tilganidek, hatto genlarning nukleotidlar ketma-ketligidagi o'zgarishlar ham turli yo'llar bilan namoyon bo'lishi mumkin: bir tomondan, nisbatan ko'p miqdordagi nukleotid almashinuvi oqsilning ishlashiga hech qanday ta'sir ko'rsatmasligi mumkin va bitta almashtirish. Proteinning funktsional muhim hududida boshqa aminokislota paydo bo'lishiga olib keladi, bu xususiyatni butunlay yo'qolgunga qadar butunlay o'zgartirishi mumkin. Shunga ko'ra, filogenezni yoritishda bunday almashtirishlardan biri oqsil funktsiyasiga ta'sir qilmaydigan ko'plab almashtirishlarga qaraganda ko'proq vaznga ega bo'lishi kerak. Tabiiy taksonomiyani qurish uchun yana ham qiziqroq va muhim narsa shundaki, ma'lum bo'lishicha, bir-biridan juda farq qiladigan ko'plab organizmlar (masalan, sichqonlar va odamlar) genlar to'plami va ularning ketma-ketligida juda oz farq qiladi. Ma'lum bo'lishicha, sichqonlar va odamlar o'rtasidagi fenotipik farqlar ikki organizmdagi genlarning regulyatsiyasi juda katta farq qilishi bilan izohlanadi [7]. Shuning uchun molekulyar filogeniya masalalarini yoritishda nafaqat genlarning to'plami va nukleotidlar ketma-ketligiga, balki ularning yonida ma'lum tartibga soluvchi elementlarning, masalan, promotorlar, kuchaytirgichlar, susturucular va boshqalar mavjudligiga ham e'tibor qaratish lozim. va ularning tuzilishi xususiyatlari. Shuningdek, turli xil genetik elementlarning nisbiy pozitsiyasi evolyutsion ma'noga ega bo'lishi mumkin va ularni hisobga olish kerak.¹⁵
Umuman olganda, BIning ushbu sohasi eng qiyin va ayni paytda eng istiqbolli sohalardan biri bo'lib qolmoqda. Ehtimol, bu sohadagi muvaffaqiyatlar bizni tirik tabiatning evolyutsion rivojlanish mexanizmlarini to'liqroq tushunishga yaqinlashtirishi mumkin.